More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0715 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 
153 aa  305  1e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 
153 aa  305  1e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  78.32 
 
 
152 aa  225  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  69.39 
 
 
150 aa  213  7e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  71.72 
 
 
150 aa  213  7e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  71.62 
 
 
149 aa  210  7e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  64.79 
 
 
149 aa  199  8e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  65.97 
 
 
152 aa  196  1e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  64.58 
 
 
150 aa  193  8e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  61.81 
 
 
150 aa  185  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  61.11 
 
 
144 aa  184  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  5.27848e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  58.11 
 
 
149 aa  179  9e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.54633e-05 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  57.43 
 
 
149 aa  178  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  61.11 
 
 
144 aa  177  3e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  59.03 
 
 
147 aa  172  1e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  56.94 
 
 
145 aa  171  4e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  56.12 
 
 
158 aa  169  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  56.25 
 
 
145 aa  167  4e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  61.31 
 
 
184 aa  164  3e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  56.34 
 
 
155 aa  164  3e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.48 
 
 
145 aa  163  8e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04491  3-dehydroquinate dehydratase  54.93 
 
 
146 aa  163  1e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.609687  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0530  3-dehydroquinate dehydratase  58.16 
 
 
145 aa  161  2e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  55.88 
 
 
152 aa  161  2e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  52.08 
 
 
148 aa  162  2e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  7.97805e-05 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  54.74 
 
 
147 aa  162  2e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  9.95076e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04071  3-dehydroquinate dehydratase  53.15 
 
 
147 aa  162  2e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  51.72 
 
 
150 aa  162  2e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1505  3-dehydroquinate dehydratase  48.98 
 
 
159 aa  161  3e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  54.86 
 
 
148 aa  161  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0383  3-dehydroquinate dehydratase  54.41 
 
 
166 aa  161  4e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04381  3-dehydroquinate dehydratase  52.45 
 
 
147 aa  161  4e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0026  3-dehydroquinate dehydratase  53.29 
 
 
152 aa  160  5e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0506  3-dehydroquinate dehydratase  58.16 
 
 
145 aa  160  5e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1924  3-dehydroquinate dehydratase  53.96 
 
 
142 aa  160  5e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1540  3-dehydroquinate dehydratase  57.14 
 
 
156 aa  160  6e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0606879 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0695  3-dehydroquinate dehydratase  56.83 
 
 
144 aa  160  6e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103169  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3174  3-dehydroquinate dehydratase  53.15 
 
 
153 aa  160  6e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.715681 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0695  3-dehydroquinate dehydratase  56.12 
 
 
146 aa  159  9e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114768  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1242  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.82 
 
 
145 aa  160  9e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0183  3-dehydroquinate dehydratase  55.41 
 
 
172 aa  159  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0858965 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3731  3-dehydroquinate dehydratase  52.05 
 
 
157 aa  159  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.318206  hitchhiker  0.00144149 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1456  3-dehydroquinate dehydratase  54.86 
 
 
145 aa  159  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.903143  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  57.78 
 
 
162 aa  158  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  56.55 
 
 
145 aa  158  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  57.35 
 
 
142 aa  158  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2620  3-dehydroquinate dehydratase  55.63 
 
 
155 aa  157  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.535696 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3030  3-dehydroquinate dehydratase  55.63 
 
 
155 aa  157  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4214  3-dehydroquinate dehydratase  50.65 
 
 
163 aa  157  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392467  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  54.17 
 
 
150 aa  157  7e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  56.34 
 
 
145 aa  156  8e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  53.62 
 
 
159 aa  156  8e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  55.47 
 
 
145 aa  156  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  55.48 
 
 
149 aa  155  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2785  3-dehydroquinate dehydratase  54.79 
 
 
156 aa  155  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2547  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.35 
 
 
142 aa  155  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.758716  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  55.56 
 
 
148 aa  155  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1751  3-dehydroquinate dehydratase  55.8 
 
 
156 aa  155  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06130  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.45 
 
 
148 aa  155  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2973  3-dehydroquinate dehydratase  53.57 
 
 
144 aa  155  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.013509  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  52.17 
 
 
159 aa  155  2e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3205  3-dehydroquinate dehydratase  53.85 
 
 
148 aa  155  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087334 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2715  3-dehydroquinate dehydratase  54.23 
 
 
151 aa  154  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2864  3-dehydroquinate dehydratase  56.93 
 
 
162 aa  154  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2893  3-dehydroquinate dehydratase  50.69 
 
 
146 aa  154  5e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3151  3-dehydroquinate dehydratase  55.3 
 
 
147 aa  154  5e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0845  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.35 
 
 
145 aa  154  6e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3940  3-dehydroquinate dehydratase  56.03 
 
 
141 aa  153  7e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  7.39911e-15  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0204  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.35 
 
 
147 aa  153  7e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  54.01 
 
 
145 aa  153  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2433  3-dehydroquinate dehydratase  54.81 
 
 
156 aa  153  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2754  3-dehydroquinate dehydratase  53.19 
 
 
151 aa  153  8e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0230  3-dehydroquinate dehydratase  48.55 
 
 
160 aa  153  1e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3425  3-dehydroquinate dehydratase  54.23 
 
 
151 aa  152  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112625  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2778  3-dehydroquinate dehydratase  54.86 
 
 
150 aa  153  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0813  3-dehydroquinate dehydratase  56.93 
 
 
146 aa  152  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2077  3-dehydroquinate dehydratase  52.9 
 
 
150 aa  152  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.556948  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0606  3-dehydroquinate dehydratase  54.17 
 
 
150 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0575  3-dehydroquinate dehydratase  54.17 
 
 
150 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  4.60325e-05 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0533  3-dehydroquinate dehydratase  54.23 
 
 
151 aa  152  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.665564 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21280  3-dehydroquinate dehydratase  50.99 
 
 
150 aa  152  2e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.775201  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0123  3-dehydroquinate dehydratase  54.17 
 
 
150 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3018  3-dehydroquinate dehydratase  53.33 
 
 
151 aa  151  3e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572032  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0508  3-dehydroquinate dehydratase  53.47 
 
 
150 aa  151  3e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0532  3-dehydroquinate dehydratase  53.47 
 
 
150 aa  151  3e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.68766  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 
151 aa  151  3e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  48.61 
 
 
146 aa  151  3e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  48.61 
 
 
146 aa  151  3e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  48.61 
 
 
146 aa  151  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  48.61 
 
 
146 aa  151  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  48.61 
 
 
146 aa  151  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  48.61 
 
 
146 aa  151  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  54.74 
 
 
160 aa  151  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  48.61 
 
 
146 aa  151  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2228  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.72 
 
 
149 aa  150  5e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3243  3-dehydroquinate dehydratase  53.44 
 
 
144 aa  150  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.414343 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0544  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
152 aa  150  5e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1164  3-dehydroquinate dehydratase  52.78 
 
 
207 aa  150  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  48.3 
 
 
151 aa  150  6e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3916  3-dehydroquinate dehydratase  52.05 
 
 
150 aa  150  6e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.491166  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>