More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2882 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2882  GTP-binding protein HSR1-related  100 
 
 		 291 aa  594  1e-169  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1388  GTP-binding protein HSR1-related protein  93.47 
 
 		 291 aa  560  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0930  GTP-binding protein HSR1-related  52.88 
 
 		 288 aa  314  9.999999999999999e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.518572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3353  GTP-binding protein HSR1-related protein  51.71 
 
 		 287 aa  310  2e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0759  putative GTPase  49.14 
 
 		 291 aa  305  5.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1043  GTP-binding protein HSR1-related protein  51.71 
 
 		 287 aa  302  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.557877  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3433  GTP-binding protein HSR1-related  47.08 
 
 		 291 aa  294  2e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2138  putative GTPase  45.02 
 
 		 290 aa  262  6e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4891  putative GTPase  44.67 
 
 		 290 aa  260  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1393  putative GTPase  45.02 
 
 		 290 aa  258  1e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3346  putative GTPase  43.99 
 
 		 290 aa  257  2e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2251  putative GTPase  44.67 
 
 		 290 aa  257  2e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.796861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1071  putative GTPase  42.96 
 
 		 290 aa  251  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0467468 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3137  GTP-binding protein HSR1-related  39.51 
 
 		 295 aa  215  5.9999999999999996e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4797  putative GTPase  35.96 
 
 		 294 aa  209  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3402  putative GTPase  35.96 
 
 		 294 aa  209  6e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4685  putative GTPase  36.01 
 
 		 294 aa  208  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3202  putative GTPase  35.79 
 
 		 294 aa  208  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1658  GTPase-like protein  39.13 
 
 		 236 aa  144  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.374478  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  26.23 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  26.37 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4767  GTP-binding protein HSR1-related  28.06 
 
 		 629 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.049365  hitchhiker  0.000697216 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1042  GTP-binding protein Era  38.2 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3787  GTP-binding protein Era  33.33 
 
 		 468 aa  60.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.0434052 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4307  GTP-binding protein HSR1-related  29.88 
 
 		 650 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2152  GTP-binding protein, HSR1-related  25.68 
 
 		 523 aa  60.1  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  28.26 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  25.2 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2380  GTP-binding protein, HSR1-related  27.23 
 
 		 635 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  23.58 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  23.58 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2082  GTP-binding protein Era  26.32 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.592415  normal  0.853182 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  25.2 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  24.73 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  27.64 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  26.63 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  25.2 
 
 		 301 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  24.75 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  25.2 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  29.03 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  22.17 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  25.21 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  24.39 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  24.39 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  22.46 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  24.39 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  24.39 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  24.39 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  24.39 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  27.47 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  24.39 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1153  hypothetical protein  29.33 
 
 		 614 aa  55.8  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.9167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  24.59 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  27.87 
 
 		 298 aa  55.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  26.83 
 
 		 301 aa  55.1  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  26.83 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  32.77 
 
 		 300 aa  55.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2089  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.59 
 
 		 637 aa  55.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000643797  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  26.92 
 
 		 451 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2632  small GTP-binding protein  32.61 
 
 		 434 aa  54.3  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1291  GTP-binding protein Era  28.02 
 
 		 449 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.537318 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  23.08 
 
 		 297 aa  53.9  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1825  GTP-binding protein Era  32.5 
 
 		 309 aa  54.3  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  26.05 
 
 		 300 aa  53.5  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1462  GTP-binding protein Era  27.72 
 
 		 293 aa  53.1  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1758  small GTP-binding protein  28.96 
 
 		 448 aa  53.1  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0080  GTP-binding protein Era  28.57 
 
 		 300 aa  52.8  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1395  GTP-binding protein EngA  26.92 
 
 		 441 aa  52.8  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0080  GTP-binding protein Era  28.57 
 
 		 301 aa  52.8  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412844  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2546  GTP-binding protein Era  26.23 
 
 		 314 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3560  GTP-binding protein Era  26.23 
 
 		 314 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  29.41 
 
 		 306 aa  52.4  0.000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0975  small GTP-binding protein domain-containing protein  25.15 
 
 		 440 aa  52.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0887  GTP-binding protein EngA  27.66 
 
 		 487 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.283319 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1120  GTP-binding protein EngA  33.09 
 
 		 488 aa  52.4  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  27.42 
 
 		 303 aa  52.4  0.000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18431  GTPase SAR1 and related small G proteins  24.55 
 
 		 440 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.491382 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1224  ribosome-associated GTPase EngA  32.28 
 
 		 447 aa  52  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  24.58 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf635  GTP-binding protein Era  26.15 
 
 		 294 aa  51.6  0.00001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.308582  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2030  GTP-binding protein Era  32.52 
 
 		 294 aa  51.6  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0924182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0320  small GTP-binding protein  29.14 
 
 		 197 aa  52.4  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  30.08 
 
 		 296 aa  51.6  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  30.08 
 
 		 296 aa  52  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2045  GTP-binding protein EngA  32.26 
 
 		 464 aa  52  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  23.53 
 
 		 298 aa  52.4  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1077  Miro domain protein  27.6 
 
 		 444 aa  51.2  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2892  GTPase family protein  31.4 
 
 		 463 aa  50.8  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3496  GTP-binding protein EngA  34.65 
 
 		 492 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4597  GTP-binding protein EngA  32 
 
 		 490 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0526  tRNA modification GTPase TrmE  32.48 
 
 		 446 aa  51.2  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1403  hypothetical protein  22.09 
 
 		 328 aa  51.2  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  23.63 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1260  GTP-binding protein EngA  33.09 
 
 		 491 aa  50.8  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00475437  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf303  GTP-binding protein EngA  29.46 
 
 		 434 aa  51.6  0.00002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.778638  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1743  GTP-binding protein Era  23.2 
 
 		 293 aa  50.8  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0597  GTP-binding protein Era  34.41 
 
 		 348 aa  51.2  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117321 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0738  ribosome-associated GTPase EngA  33.87 
 
 		 484 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.922813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2361  GTP-binding protein EngA  31.65 
 
 		 488 aa  51.6  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.596104  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3828  GTP-binding protein Era  22.65 
 
 		 305 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>