More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1153 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1153  ABC transporter domain protein  100 
 
 		 600 aa  1234    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2698  ABC transporter-like  38.86 
 
 		 589 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0409  ABC transporter  38.86 
 
 		 589 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0847307  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3507  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  38.5 
 
 		 589 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0388  ABC transporter  38.86 
 
 		 589 aa  412  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0336  ABC transporter  38.32 
 
 		 589 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294433  normal  0.265185 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0327  ABC transporter  38.15 
 
 		 589 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2775  ABC transporter  38.06 
 
 		 577 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1048  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  38.43 
 
 		 599 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2783  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.63 
 
 		 584 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3684  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.63 
 
 		 588 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2731  ABC transporter, ATP-binding protein  37.63 
 
 		 588 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3221  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.63 
 
 		 588 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3711  ABC transporter, ATP-binding protein  37.63 
 
 		 588 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3009  ABC transporter, ATP-binding protein  37.97 
 
 		 588 aa  396  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0382  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  38.88 
 
 		 592 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.260963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1771  ABC transporter, ATP-binding protein  37.63 
 
 		 588 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.425769  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3741  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.63 
 
 		 588 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.699706  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3576  ABC transporter domain protein  38.88 
 
 		 583 aa  396  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0754799  hitchhiker  0.00000117282 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0312  ABC transporter  37.43 
 
 		 589 aa  394  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0369  ABC transporter-like protein  37.11 
 
 		 636 aa  391  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455646  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0429  ABC transporter related  36.21 
 
 		 621 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0620153  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6112  ABC transporter  37.52 
 
 		 603 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.863799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1667  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  35.82 
 
 		 588 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3843  ABC transporter  37.48 
 
 		 578 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0735  ABC transporter-like  36.05 
 
 		 613 aa  362  2e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1326  ABC transporter domain protein  34.81 
 
 		 586 aa  361  2e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0822  ABC transporter-like  37.91 
 
 		 575 aa  361  3e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0638  ABC transporter  35.6 
 
 		 610 aa  353  5.9999999999999994e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.226962  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0667  ABC transporter domain protein  35.6 
 
 		 596 aa  352  1e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1832  ABC transporter-like  34.74 
 
 		 583 aa  348  2e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0566621 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4132  ABC transporter-like  34.3 
 
 		 630 aa  347  4e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0456  ATP-binding transport ABC transporter protein  37.81 
 
 		 614 aa  345  1e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.709933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0346  ABC transporter domain protein  35.83 
 
 		 614 aa  345  1e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0331  ABC transporter domain protein  35.65 
 
 		 614 aa  343  5.999999999999999e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.441162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0737  ABC transporter-like  34.8 
 
 		 614 aa  341  2e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4731  ABC transporter-like  34.17 
 
 		 579 aa  333  6e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.612585  normal  0.660257 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0552  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.48 
 
 		 587 aa  332  1e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0707  ABC transporter domain protein  35.48 
 
 		 587 aa  332  1e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000255653 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0152  ABC transporter domain protein  35.14 
 
 		 590 aa  331  2e-89  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0199241  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4551  ABC transporter, ATP-binding protein  36.41 
 
 		 577 aa  330  6e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.859512  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2461  ABC transporter  32.01 
 
 		 606 aa  330  6e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142821  normal  0.345293 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1064  ABC transporter domain protein  35 
 
 		 593 aa  326  8.000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4229  ABC transporter:ABC transporter, N-terminal  36.41 
 
 		 572 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1852  ABC transporter  34.56 
 
 		 596 aa  325  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0298007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0799  ABC transporter related  33.98 
 
 		 701 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0267156 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1740  ABC transporter  32.99 
 
 		 712 aa  318  2e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000825117 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0559  ABC transporter  35.69 
 
 		 588 aa  318  2e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.393268  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1179  ABC transporter domain protein  35.48 
 
 		 595 aa  303  5.000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3430  ABC transporter  32.44 
 
 		 708 aa  301  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18221 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4948  ABC transporter domain protein  32.6 
 
 		 704 aa  300  4e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4485  ABC transporter  32.6 
 
 		 712 aa  300  6e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.991125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5001  ABC transporter domain protein  32.96 
 
 		 704 aa  297  3e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.650966 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1864  ABC transporter  35.83 
 
 		 602 aa  296  7e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.653168 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1710  ABC transporter  36.7 
 
 		 605 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3498  ABC transporter  35.7 
 
 		 615 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.661743 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2240  ABC transporter  35.5 
 
 		 626 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2634  ABC transporter domain protein  32.32 
 
 		 563 aa  291  3e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1577  ABC transporter domain protein  35.07 
 
 		 667 aa  291  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482114  hitchhiker  0.0000264384 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4654  ABC transporter domain protein  33.54 
 
 		 713 aa  290  6e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.435698 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1469  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.34 
 
 		 598 aa  289  8e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4019  ABC transporter  36.01 
 
 		 606 aa  289  9e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0431407  normal  0.349748 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3439  ABC transporter related  33.84 
 
 		 588 aa  288  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571731 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4366  ABC transporter related  32.13 
 
 		 660 aa  285  2.0000000000000002e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0233  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  31.76 
 
 		 651 aa  281  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.525703  normal  0.627984 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3285  ABC transporter domain protein  31.14 
 
 		 553 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0762  ABC transporter domain protein  32.06 
 
 		 557 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2971  ABC transporter  35.31 
 
 		 597 aa  276  1.0000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4198  ABC transporter related  32.53 
 
 		 591 aa  272  1e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00760523  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1219  ABC transporter  32.8 
 
 		 595 aa  271  2.9999999999999997e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0999  ABC transporter domain protein  31.33 
 
 		 557 aa  270  5e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3991  ABC transporter related  33.13 
 
 		 642 aa  270  8e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3826  ABC transporter related  34.81 
 
 		 576 aa  268  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0157  ABC transporter related  31.97 
 
 		 674 aa  268  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036118 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0045  ABC transporter related  33.7 
 
 		 603 aa  268  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.315535 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5213  ABC transporter domain protein  32.08 
 
 		 563 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149652 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0163  Sigma 54 interacting domain protein  31.97 
 
 		 666 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1803  ABC transporter  33.33 
 
 		 576 aa  265  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.550427 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11849  drug ABC transporter ATP-binding protein  33 
 
 		 639 aa  266  1e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000106158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0401  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.19 
 
 		 549 aa  264  4e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2885  ABC transporter  30.38 
 
 		 636 aa  261  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.306309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0331  ABC transporter related  34.04 
 
 		 534 aa  260  5.0000000000000005e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0622  ATPase  34.17 
 
 		 665 aa  260  6e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.333082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2854  ABC transporter-like protein  30.21 
 
 		 634 aa  259  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2898  ABC transporter  30.21 
 
 		 636 aa  259  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5296  ABC transporter domain protein  33.76 
 
 		 567 aa  258  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0424  ABC transporter  30.56 
 
 		 640 aa  257  4e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3678  ABC transporter  33.92 
 
 		 575 aa  255  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3329  ABC transporter domain protein  32.25 
 
 		 560 aa  253  5.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46957  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4887  ABC transporter domain protein  29.72 
 
 		 589 aa  252  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1359  ABC transporter domain protein  32.62 
 
 		 663 aa  251  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164606 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1330  ABC transporter domain protein  32.62 
 
 		 663 aa  251  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3410  ABC transporter  31.3 
 
 		 635 aa  249  7e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362077  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2150  ABC transporter related protein  30.22 
 
 		 561 aa  244  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.675746  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2161  ABC transporter related  30.22 
 
 		 561 aa  244  5e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.918171 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2109  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein  30.22 
 
 		 561 aa  243  5e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.356794  normal  0.522774 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1645  ABC transporter related  32.97 
 
 		 570 aa  243  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3164  ABC transporter  32.02 
 
 		 637 aa  243  6e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0211349  normal  0.192847 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1581  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein  30.22 
 
 		 561 aa  243  7e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.477042  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1677  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein  30.04 
 
 		 561 aa  241  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>