39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_00160 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_00160  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
105 aa  210  6e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0015  TPR domain-containing protein  86.54 
 
 
104 aa  181  2e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0013  hypothetical protein  75.96 
 
 
104 aa  160  8e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540742  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0051  TPR repeat-containing protein  74.04 
 
 
104 aa  155  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46510  hypothetical protein  76.24 
 
 
107 aa  154  6e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0247352  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0080  tetratricopeptide domain-containing protein  70.59 
 
 
102 aa  147  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.163561  hitchhiker  7.57426e-12 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0080  TPR repeat-containing protein  71.29 
 
 
104 aa  147  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.550206  normal  0.123914 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0064  TPR domain-containing protein  71.29 
 
 
104 aa  147  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  3.02311e-07 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0083  TPR repeat-containing protein  70.59 
 
 
102 aa  146  1e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.50356  hitchhiker  1.63177e-08 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2284  TPR repeat-containing protein  64.71 
 
 
112 aa  129  9e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0435427  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0023  TPR repeat-containing protein  53 
 
 
111 aa  101  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.727906  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0354  TPR repeat-containing protein  53.47 
 
 
108 aa  101  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  6.06003e-08 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0204  TPR repeat-containing protein  53.47 
 
 
110 aa  100  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0438861  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4712  hypothetical protein  55.45 
 
 
108 aa  92  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.658591  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2621  TPR repeat-containing protein  47.57 
 
 
107 aa  87.8  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.606766 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2265  TPR repeat-containing protein  43.88 
 
 
112 aa  72  3e-12  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.635279  normal  0.073962 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3205  tetratricopeptide TPR_2  32.32 
 
 
111 aa  62.8  2e-09  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3592  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 
109 aa  54.3  6e-07  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292213 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43936  antiviral protein  41.82 
 
 
1413 aa  47.4  6e-05  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01282  glutamine-rich cytoplasmic protein (Eurofung)  28.71 
 
 
347 aa  46.2  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.271193 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1242  TPR repeat-containing protein  33.66 
 
 
103 aa  46.6  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0662  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.21 
 
 
330 aa  45.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0114263  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.67 
 
 
461 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3564  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.55 
 
 
637 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0623706  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3496  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.55 
 
 
638 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3254  hypothetical protein  29.67 
 
 
102 aa  44.7  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.185219 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  27.63 
 
 
436 aa  43.9  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1254  tetratricopeptide TPR_2  33.33 
 
 
260 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.146515  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1472  methyltransferase type 12  40.35 
 
 
308 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3481  hypothetical protein  28.43 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  35.63 
 
 
266 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3987  TPR repeat-containing protein  37.66 
 
 
1092 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.017736 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3633  hypothetical protein  27.17 
 
 
111 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3565  hypothetical protein  27.17 
 
 
111 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.65733  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3688  response regulator receiver domain-containing protein  31.94 
 
 
718 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  32 
 
 
935 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0678  extracellular ligand-binding receptor  36.62 
 
 
1073 aa  40.8  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  36.07 
 
 
405 aa  40  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  29.7 
 
 
626 aa  40  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>