More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_04491 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_04491  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 146 aa  288  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.609687  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04071  3-dehydroquinate dehydratase  86.9 
 
 		 147 aa  253  8e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04381  3-dehydroquinate dehydratase  85.52 
 
 		 147 aa  252  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0383  3-dehydroquinate dehydratase  81.88 
 
 		 166 aa  228  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  62.94 
 
 		 145 aa  195  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  61.54 
 
 		 145 aa  191  2e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03831  3-dehydroquinate dehydratase  57.36 
 
 		 148 aa  165  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  56.34 
 
 		 152 aa  165  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21621  3-dehydroquinate dehydratase  55.38 
 
 		 164 aa  164  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0724958 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01135  Catabolic 3-dehydroquinase (EC 4.2.1.10)(3-dehydroquinate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P05147]  56.72 
 
 		 153 aa  164  4e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  58.62 
 
 		 150 aa  163  5.9999999999999996e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  54.93 
 
 		 153 aa  163  9e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  54.93 
 
 		 153 aa  163  9e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0845  3-dehydroquinate dehydratase, type II  57.46 
 
 		 145 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  53.42 
 
 		 144 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  53.47 
 
 		 149 aa  161  3e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2754  3-dehydroquinate dehydratase  54.07 
 
 		 151 aa  159  8.000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  51.72 
 
 		 150 aa  159  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.78 
 
 		 144 aa  157  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03924  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase) (Type II DHQase)  47.95 
 
 		 146 aa  157  6e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.252405  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0231  3-dehydroquinate dehydratase  51.39 
 
 		 149 aa  157  7e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.447722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0768  3-dehydroquinate dehydratase  50.34 
 
 		 167 aa  155  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000317323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 149 aa  153  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0088  3-dehydroquinate dehydratase  48.28 
 
 		 161 aa  153  7e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  52.99 
 
 		 162 aa  153  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 150 aa  153  9e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0530  3-dehydroquinate dehydratase  52.82 
 
 		 145 aa  152  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0183  3-dehydroquinate dehydratase  47.26 
 
 		 172 aa  152  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0858965 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  48.59 
 
 		 149 aa  152  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0502  3-dehydroquinate dehydratase  53.54 
 
 		 146 aa  152  1e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0028378  normal  0.126583 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3121  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50 
 
 		 149 aa  152  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3174  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 153 aa  152  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.715681 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.66 
 
 		 152 aa  152  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 158 aa  152  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.05 
 
 		 150 aa  151  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0506  3-dehydroquinate dehydratase  52.82 
 
 		 145 aa  152  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  47.59 
 
 		 147 aa  152  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0511  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 		 144 aa  152  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3520  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 		 144 aa  152  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4214  3-dehydroquinate dehydratase  52.9 
 
 		 163 aa  151  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3692  3-dehydroquinate dehydratase  51.41 
 
 		 150 aa  151  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.526895  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0512  3-dehydroquinate dehydratase  51.41 
 
 		 146 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2715  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 151 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  48.59 
 
 		 149 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1833  3-dehydroquinate dehydratase  52.34 
 
 		 146 aa  151  2.9999999999999998e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.120538  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2785  3-dehydroquinate dehydratase  50.37 
 
 		 156 aa  150  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0511  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 		 144 aa  150  4e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0533  3-dehydroquinate dehydratase  52.59 
 
 		 151 aa  150  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.665564 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0445  3-dehydroquinate dehydratase  54.23 
 
 		 144 aa  150  7e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1164  3-dehydroquinate dehydratase  50.34 
 
 		 207 aa  150  7e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2620  3-dehydroquinate dehydratase  48.59 
 
 		 155 aa  150  7e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.535696 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0948  3-dehydroquinate dehydratase  49.32 
 
 		 153 aa  149  8e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00455713  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3348  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 144 aa  149  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2500  3-dehydroquinate dehydratase  50.34 
 
 		 150 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.263847  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0941  3-dehydroquinate dehydratase  51.8 
 
 		 178 aa  149  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3499  3-dehydroquinate dehydratase  50.34 
 
 		 207 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3502  3-dehydroquinate dehydratase  50.34 
 
 		 150 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248237  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0421  3-dehydroquinate dehydratase  50.34 
 
 		 207 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3464  3-dehydroquinate dehydratase  50.34 
 
 		 150 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2433  3-dehydroquinate dehydratase  49.28 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1280  3-dehydroquinate dehydratase  50.34 
 
 		 150 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3284  3-dehydroquinate dehydratase  50.34 
 
 		 150 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3030  3-dehydroquinate dehydratase  49.63 
 
 		 155 aa  149  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3425  3-dehydroquinate dehydratase  51.85 
 
 		 151 aa  149  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112625  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03007  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 148 aa  147  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  45.89 
 
 		 159 aa  147  3e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2690  3-dehydroquinate dehydratase  48.97 
 
 		 150 aa  148  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000775969  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  47.89 
 
 		 150 aa  148  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  50.74 
 
 		 152 aa  148  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2628  3-dehydroquinate dehydratase  51.91 
 
 		 154 aa  148  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.95 
 
 		 184 aa  147  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  46.58 
 
 		 159 aa  148  3e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0570  3-dehydroquinate dehydratase  48.61 
 
 		 150 aa  148  3e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3854  3-dehydroquinate dehydratase  49.31 
 
 		 146 aa  147  4e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.31735  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3798  3-dehydroquinate dehydratase  49.31 
 
 		 146 aa  147  4e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000334533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3860  3-dehydroquinate dehydratase  48.55 
 
 		 148 aa  147  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0470796 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0470  3-dehydroquinate dehydratase  49.31 
 
 		 146 aa  147  4e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000102213  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2778  3-dehydroquinate dehydratase  50.34 
 
 		 150 aa  147  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3018  3-dehydroquinate dehydratase  48.55 
 
 		 151 aa  147  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1505  3-dehydroquinate dehydratase  45.21 
 
 		 159 aa  147  5e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3288  3-dehydroquinate dehydratase  45.45 
 
 		 152 aa  147  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  45.45 
 
 		 149 aa  147  7e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3940  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 141 aa  146  7e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000739911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3980  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 		 146 aa  146  7e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0123  3-dehydroquinate dehydratase  49.66 
 
 		 150 aa  146  8e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0606  3-dehydroquinate dehydratase  49.66 
 
 		 150 aa  146  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0575  3-dehydroquinate dehydratase  49.66 
 
 		 150 aa  146  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  46.48 
 
 		 146 aa  146  9e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4859  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.7 
 
 		 150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4399  3-dehydroquinate dehydratase  50.7 
 
 		 150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0532  3-dehydroquinate dehydratase  49.66 
 
 		 150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.68766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  41.61 
 
 		 151 aa  145  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2834  3-dehydroquinate dehydratase  47.18 
 
 		 149 aa  146  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0506337  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  48.91 
 
 		 145 aa  146  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  45.21 
 
 		 147 aa  145  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06130  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.94 
 
 		 148 aa  145  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1476  3-dehydroquinate dehydratase  51.08 
 
 		 178 aa  145  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.657033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2703  3-dehydroquinate dehydratase  50.74 
 
 		 145 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3593  3-dehydroquinate dehydratase  47.22 
 
 		 148 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>