235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_04341 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_04341  30S ribosomal protein S20  100 
 
 
100 aa  203  8e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16091  30S ribosomal protein S20  71.13 
 
 
100 aa  147  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2069  30S ribosomal protein S20  71.13 
 
 
98 aa  146  9e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0603  30S ribosomal protein S20  70.83 
 
 
98 aa  144  3e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1018  30S ribosomal protein S20  61.86 
 
 
98 aa  134  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.859687  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18881  30S ribosomal protein S20  61.86 
 
 
98 aa  134  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.825907  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1520  30S ribosomal protein S20  58.33 
 
 
98 aa  113  7.999999999999999e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16911  30S ribosomal protein S20  56.38 
 
 
97 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16781  30S ribosomal protein S20  54.26 
 
 
97 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1580  30S ribosomal protein S20  54.26 
 
 
97 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0739  30S ribosomal protein S20  57.61 
 
 
97 aa  103  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0490  ribosomal protein S20  54.55 
 
 
99 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2941  30S ribosomal protein S20  56.98 
 
 
112 aa  103  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.205918  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1019  30S ribosomal protein S20  58.24 
 
 
116 aa  102  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1753  30S ribosomal protein S20  55.43 
 
 
97 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1780  30S ribosomal protein S20  55.43 
 
 
97 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4205  30S ribosomal protein S20  52.75 
 
 
97 aa  97.1  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.885045 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16671  30S ribosomal protein S20  51.06 
 
 
97 aa  97.1  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  50.57 
 
 
95 aa  71.6  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0527  ribosomal protein S20  41.76 
 
 
88 aa  68.9  0.00000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1932  ribosomal protein S20  41.11 
 
 
88 aa  68.2  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000591631  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1755  30S ribosomal protein S20  45.56 
 
 
91 aa  63.5  0.0000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00299182  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 
94 aa  61.6  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  37 
 
 
96 aa  61.2  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000300859  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0700  ribosomal protein S20  40.21 
 
 
92 aa  60.5  0.000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000536683  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0818  30S ribosomal protein S20  40.45 
 
 
81 aa  60.1  0.000000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  36.36 
 
 
94 aa  58.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134662  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2188  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 
91 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220995  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1846  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 
91 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 
88 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  41.11 
 
 
85 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2835  ribosomal protein S20  42.35 
 
 
90 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.621113 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 
86 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000253249 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  39.56 
 
 
88 aa  58.2  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  42.05 
 
 
88 aa  57.8  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  40 
 
 
85 aa  57.4  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1134  30S ribosomal protein S20  36 
 
 
96 aa  57.4  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000567629  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4233  ribosomal protein S20  40.66 
 
 
87 aa  56.6  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000543427  hitchhiker  0.000000915309 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  38.89 
 
 
85 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  38.89 
 
 
85 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  38.89 
 
 
85 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  38.89 
 
 
85 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  38.89 
 
 
85 aa  56.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  38.89 
 
 
85 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  38.89 
 
 
85 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  38.89 
 
 
85 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2250  30S ribosomal protein S20  40.66 
 
 
92 aa  55.1  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375022  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  35.63 
 
 
88 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  39.78 
 
 
85 aa  54.7  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  43.96 
 
 
86 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  37.78 
 
 
85 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  43.96 
 
 
86 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  43.96 
 
 
86 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0947  ribosomal protein S20  38.2 
 
 
100 aa  53.9  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1184  ribosomal protein S20  41.67 
 
 
88 aa  54.3  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  41.3 
 
 
86 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  38.89 
 
 
89 aa  53.5  0.0000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1179  ribosomal protein S20  37.36 
 
 
86 aa  53.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3421  ribosomal protein S20  41.46 
 
 
86 aa  53.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144385  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0577  30S ribosomal protein S20  39.56 
 
 
86 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000729927  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3546  30S ribosomal protein S20  39.56 
 
 
89 aa  52.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  40.23 
 
 
88 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0126  30S ribosomal protein S20  36.26 
 
 
95 aa  52.8  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000563837  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0776  SSU ribosomal protein S20P  44.05 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38047  normal  0.149543 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  38.89 
 
 
86 aa  53.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0950  30S ribosomal protein S20  36.08 
 
 
92 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  38.3 
 
 
88 aa  52.8  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 
89 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  36.67 
 
 
86 aa  52.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12440  30S ribosomal protein S20  42.22 
 
 
86 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  38.64 
 
 
87 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  38.64 
 
 
87 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1150  30S ribosomal protein S20  40.66 
 
 
89 aa  52  0.000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  hitchhiker  0.00399464  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4315  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 
90 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000159944  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  36.67 
 
 
87 aa  52  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2223  ribosomal protein S20  41.11 
 
 
86 aa  52  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133967  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0416  30S ribosomal protein S20  37.5 
 
 
87 aa  52  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000443906  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  35.16 
 
 
91 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1039  ribosomal protein S20  34.74 
 
 
115 aa  51.6  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000562255  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  39.56 
 
 
86 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40720  30S ribosomal protein S20  36.26 
 
 
91 aa  51.6  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1106  30S ribosomal protein S20  34.04 
 
 
93 aa  51.6  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00644283  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  39.08 
 
 
86 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  38.89 
 
 
88 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 
89 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_9610  predicted protein  36.25 
 
 
84 aa  50.8  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.198308  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4514  30S ribosomal protein S20  36.26 
 
 
89 aa  50.8  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  39.08 
 
 
86 aa  50.4  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0546  30S ribosomal protein S20  34.44 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3076  30S ribosomal protein S20  33.33 
 
 
90 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000126326  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  39.08 
 
 
92 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2893  30S ribosomal protein S20  35.16 
 
 
88 aa  50.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.204979  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3274  ribosomal protein S20  35.16 
 
 
86 aa  49.7  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13310  SSU ribosomal protein S20P  40 
 
 
86 aa  50.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0211  30S ribosomal protein S20  38.89 
 
 
86 aa  50.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000112504  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3238  30S ribosomal protein S20  35.16 
 
 
88 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000254037  normal  0.534831 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2211  30S ribosomal protein S20  35.16 
 
 
87 aa  49.3  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.829407  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3181  30S ribosomal protein S20  38.46 
 
 
87 aa  48.9  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0928109  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  35.56 
 
 
87 aa  48.9  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004422  SSU ribosomal protein S20p  37.36 
 
 
86 aa  48.9  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000816133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>