124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0337 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0337  urease accessory protein UreF, putative  100 
 
 
228 aa  466  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0272  urease accessory protein UreF, putative  78.51 
 
 
228 aa  344  8e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0286  putative urease accessory protein UreF  78.64 
 
 
232 aa  334  7.999999999999999e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3303  Urease accessory protein UreF  56.74 
 
 
223 aa  237  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.31623 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3047  Urease accessory protein UreF  55.35 
 
 
223 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159294  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2378  urease accessory protein UreF  51.82 
 
 
223 aa  209  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.173139 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3469  urease accessory protein  47.32 
 
 
230 aa  186  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1868  urease accessory protein UreF  44.98 
 
 
237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.113809  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7006  urease accessory protein UreF  46.85 
 
 
240 aa  176  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3690  urease accessory protein UreF  45.21 
 
 
241 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2686  urease accessory protein UreF  44.14 
 
 
223 aa  171  5.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885864  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3239  Urease accessory protein UreF  47.28 
 
 
238 aa  170  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.525319 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3014  urease accessory protein UreF  48.12 
 
 
244 aa  167  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347135  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3497  urease accessory protein UreF  42.98 
 
 
288 aa  165  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3203  Urease accessory protein UreF  47.27 
 
 
224 aa  164  8e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0381  urease accessory protein UreF  42.66 
 
 
214 aa  159  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11359  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4179  Urease accessory protein UreF  42.86 
 
 
240 aa  157  9e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4159  urease accessory protein UreF  42.92 
 
 
309 aa  151  8.999999999999999e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.896165  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2866  urease accessory protein UreF  44.55 
 
 
229 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669452  normal  0.213531 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2362  putative urease accessory protein  41.86 
 
 
210 aa  145  6e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.875021 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1702  Urease accessory protein UreF  39.46 
 
 
225 aa  137  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278425 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1092  Urease accessory protein UreF  40.45 
 
 
239 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.827823  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3260  urease accessory protein UreF  40.27 
 
 
228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1947  urease accessory protein UreF  38.74 
 
 
210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218708  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0991  urease accessory protein UreF  40.09 
 
 
210 aa  132  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0303  urease accessory protein UreF  38.74 
 
 
210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2120  urease accessory protein UreF  40 
 
 
250 aa  129  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1029  urease accessory protein UreF  32.91 
 
 
231 aa  115  5e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.185094 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2009  Urease accessory protein UreF  38.33 
 
 
231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1755  urease accessory protein UreF  36.41 
 
 
220 aa  109  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  0.885594 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1206  urease accessory protein UreF  36.49 
 
 
215 aa  99.8  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2267  Urease accessory protein UreF  27.96 
 
 
227 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0751  urease accessory protein UreF  29.33 
 
 
232 aa  77.8  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4416  Urease accessory protein UreF  29.2 
 
 
232 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1814  urease accessory protein UreF  22.55 
 
 
240 aa  71.6  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4910  urease accessory protein UreF  30.09 
 
 
224 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4452  urease accessory protein UreF  29.39 
 
 
224 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1765  urease accessory protein UreF  27.35 
 
 
227 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.858852  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1191  urease accessory protein UreF  28.38 
 
 
230 aa  70.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424033  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0223  urease accessory protein UreF  27.15 
 
 
221 aa  68.9  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4635  urease accessory protein UreF  24.24 
 
 
229 aa  68.9  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00483851  normal  0.066113 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09390  Urease accessory protein UreF  30.84 
 
 
224 aa  68.9  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0685  urease accessory protein UreF  24.89 
 
 
228 aa  68.6  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1425  urease accessory protein UreF  26.98 
 
 
228 aa  67.8  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0664  urease accessory protein  29.39 
 
 
237 aa  68.2  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3407  urease accessory protein UreF  28.32 
 
 
225 aa  67  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4247  Urease accessory protein UreF  29 
 
 
223 aa  65.9  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2991  urease accessory protein UreF  26.92 
 
 
231 aa  65.9  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.901747  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2622  urease accessory protein F  27.5 
 
 
223 aa  65.1  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0673782  normal  0.796864 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0972  urease accessory protein UreF  29 
 
 
232 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3660  urease accessory protein UreF  23.45 
 
 
232 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.098957  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2878  urease accessory protein UreF  28.38 
 
 
224 aa  62.8  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3106  Urease accessory protein UreF  28.33 
 
 
253 aa  62.4  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1348  urease accessory protein UreF  28.33 
 
 
233 aa  62.4  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2303  urease accessory protein UreF  28.57 
 
 
230 aa  62  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1476  Urease accessory protein UreF  24.65 
 
 
228 aa  61.6  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0566307  normal  0.716543 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1724  urease accessory protein UreF  26.2 
 
 
288 aa  61.6  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.616016  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0665  urease accessory protein UreF  31 
 
 
224 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675417  normal  0.0233838 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4833  urease accessory protein UreF  21.36 
 
 
228 aa  61.2  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3941  Urease accessory protein UreF  31.11 
 
 
259 aa  60.5  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.552118  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1243  urease accessory protein UreF  24.19 
 
 
226 aa  60.1  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0186  urease accessory protein UreF  27.47 
 
 
228 aa  60.1  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2439  urease accessory protein UreF  29.57 
 
 
227 aa  60.1  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.280457  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0884  urease accessory protein UreF  25.85 
 
 
235 aa  59.7  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.782823  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0562  urease accessory protein UreF  29.65 
 
 
224 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3532  urease accessory protein UreF  27.19 
 
 
251 aa  58.9  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510813  normal  0.516432 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0394  Urease accessory protein UreF  26.94 
 
 
227 aa  59.3  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1494  urease accessory protein UreF  26.56 
 
 
236 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.36478  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1325  UreF  28.7 
 
 
224 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29761  urease accessory protein UreF  24.89 
 
 
227 aa  55.5  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2199  urease accessory protein UreF  25 
 
 
243 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0590668  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0997  urease accessory protein UreF  27.73 
 
 
230 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371175  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0958  urease accessory protein UreF  27.35 
 
 
230 aa  54.3  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1180  urease accessory protein UreF  30.13 
 
 
238 aa  54.7  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801104  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1303  urease accessory protein UreF  23.87 
 
 
240 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2420  urease accessory protein UreF  27.44 
 
 
224 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0454768  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3696  putative urease accessory protein UreF  29.31 
 
 
226 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.378168 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0245  urease accessory protein UreF  25.94 
 
 
225 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3468  urease accessory protein UreF  28.07 
 
 
224 aa  53.9  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000115011  normal  0.208076 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2252  urease accessory protein F  26.27 
 
 
223 aa  52.8  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1360  urease accessory protein UreF, putative  24.55 
 
 
243 aa  52.4  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1465  Urease accessory protein UreF  23.42 
 
 
240 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0722  Urease accessory protein UreF  24.07 
 
 
240 aa  52.4  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2769  Urease accessory protein UreF  24.64 
 
 
225 aa  52.4  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1859  Urease accessory protein UreF  28.63 
 
 
229 aa  52  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.148323 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00891  Urease accessory protein UreF  23.22 
 
 
208 aa  52  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.42714  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4004  urease accessory protein UreF  29.2 
 
 
226 aa  52  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.471956 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0963  urease accessory protein UreF  27.27 
 
 
230 aa  51.6  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0374203 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1262  urease accessory protein  20.94 
 
 
233 aa  51.2  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.614669 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3137  urease accessory protein  26.42 
 
 
236 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0721  urease accessory protein UreF  26.42 
 
 
236 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3078  urease accessory protein UreF  26 
 
 
236 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3114  urease accessory protein UreF  26 
 
 
236 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2059  urease accessory protein UreF  26.42 
 
 
236 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.917688  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2456  urease accessory protein UreF  24.11 
 
 
245 aa  50.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2182  Urease accessory protein UreF  28.63 
 
 
229 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349664  normal  0.124246 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1553  Urease accessory protein UreF  31.91 
 
 
266 aa  49.7  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0419  urease accessory protein UreF  27.88 
 
 
226 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.885315  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0898  urease accessory protein UreF  27.88 
 
 
226 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4737  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0788  urease accessory protein UreF  27.8 
 
 
226 aa  48.9  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>