90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1262 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1262  urease accessory protein  100 
 
 		 233 aa  480  1e-135  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.614669 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0974  hypothetical protein  27.8 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4050  hypothetical protein  28.7 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1868  urease accessory protein UreF  22.78 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.113809  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_004310  BR1360  urease accessory protein UreF, putative  32.17 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7006  urease accessory protein UreF  26.81 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48625  predicted protein  25.2 
 
 		 666 aa  67  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1553  Urease accessory protein UreF  25.5 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2769  Urease accessory protein UreF  24.66 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4452  urease accessory protein UreF  24.36 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2996  urease accessory protein UreF  26.72 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0562  urease accessory protein UreF  23.38 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0665  urease accessory protein UreF  25 
 
 		 224 aa  57  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675417  normal  0.0233838 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1814  urease accessory protein UreF  21.59 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3407  urease accessory protein UreF  23.73 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3497  urease accessory protein UreF  23.65 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4833  urease accessory protein UreF  23.25 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29761  urease accessory protein UreF  24.05 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0381  urease accessory protein UreF  20.44 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11359  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4910  urease accessory protein UreF  24.14 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1702  Urease accessory protein UreF  21.43 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278425 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0475  urease accessory protein UreF  21.9 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1476  Urease accessory protein UreF  20.69 
 
 		 228 aa  53.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0566307  normal  0.716543 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3690  urease accessory protein UreF  23.4 
 
 		 241 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2878  urease accessory protein UreF  22.51 
 
 		 224 aa  52.8  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3078  urease accessory protein UreF  38.81 
 
 		 236 aa  52.4  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3114  urease accessory protein UreF  38.81 
 
 		 236 aa  52.4  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3303  Urease accessory protein UreF  23.94 
 
 		 223 aa  52.4  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.31623 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0721  urease accessory protein UreF  38.81 
 
 		 236 aa  52.4  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2059  urease accessory protein UreF  38.81 
 
 		 236 aa  52.4  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.917688  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3137  urease accessory protein  38.81 
 
 		 236 aa  52.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2555  urease accessory protein UreF  38.81 
 
 		 226 aa  52  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2186  urease accessory protein UreF  38.81 
 
 		 226 aa  52  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1494  urease accessory protein UreF  38.81 
 
 		 236 aa  52  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.36478  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0245  urease accessory protein UreF  21.49 
 
 		 225 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2316  urease accessory protein UreF  22.17 
 
 		 229 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.495239  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2359  urease accessory protein UreF  22.17 
 
 		 229 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3203  Urease accessory protein UreF  23.96 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4159  urease accessory protein UreF  25.11 
 
 		 309 aa  50.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.896165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3696  putative urease accessory protein UreF  39.06 
 
 		 226 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.378168 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0868  urease accessory protein UreF  37.88 
 
 		 226 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.947799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4444  urease accessory protein UreF  24.23 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.8214 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2492  urease accessory protein UreF  39.39 
 
 		 226 aa  50.1  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0722  Urease accessory protein UreF  43.18 
 
 		 240 aa  50.1  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0898  urease accessory protein UreF  37.88 
 
 		 226 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4737  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0751  urease accessory protein UreF  22.67 
 
 		 232 aa  50.1  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0419  urease accessory protein UreF  37.88 
 
 		 226 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.885315  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03460  urease accessory protein UreF  21.17 
 
 		 238 aa  49.7  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4416  Urease accessory protein UreF  22.12 
 
 		 232 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0926  Urease accessory protein UreF  37.5 
 
 		 226 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0337  urease accessory protein UreF, putative  21.15 
 
 		 228 aa  49.3  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0327  urease accessory protein  24.12 
 
 		 237 aa  49.3  0.00006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4004  urease accessory protein UreF  37.88 
 
 		 226 aa  48.9  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.471956 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0788  urease accessory protein UreF  37.88 
 
 		 226 aa  48.5  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2252  urease accessory protein F  25 
 
 		 223 aa  48.5  0.00009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4247  Urease accessory protein UreF  24.8 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0777  urease accessory protein UreF  37.88 
 
 		 226 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2303  urease accessory protein UreF  33.8 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1348  urease accessory protein UreF  22.92 
 
 		 233 aa  47.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1180  urease accessory protein UreF  45.24 
 
 		 238 aa  46.2  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801104  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0272  urease accessory protein UreF, putative  42 
 
 		 228 aa  46.6  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3469  urease accessory protein  26.18 
 
 		 230 aa  46.2  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03290  urease accessory protein UreF  23.27 
 
 		 243 aa  45.8  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3558  urease accessory protein  19.91 
 
 		 228 aa  45.8  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.45506  normal  0.0231315 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1135  urease accessory protein UreF  19.91 
 
 		 228 aa  45.8  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2686  urease accessory protein UreF  24.35 
 
 		 223 aa  45.4  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885864  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1081  urease accessory protein UreF  19.91 
 
 		 228 aa  45.4  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4635  urease accessory protein UreF  23.83 
 
 		 229 aa  45.4  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00483851  normal  0.066113 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3660  urease accessory protein UreF  20.78 
 
 		 232 aa  45.1  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.098957  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5118  Urease accessory protein UreF  47.5 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2378  urease accessory protein UreF  20.99 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.173139 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1873  urease accessory protein UreF  21.79 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.674114  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1070  urease accessory protein UreF  21.85 
 
 		 250 aa  43.9  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0664  urease accessory protein  55.88 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3239  Urease accessory protein UreF  25.11 
 
 		 238 aa  44.3  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.525319 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1465  Urease accessory protein UreF  31.08 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1303  urease accessory protein UreF  31.08 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3014  urease accessory protein UreF  25.34 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4179  Urease accessory protein UreF  21.81 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1325  UreF  33.93 
 
 		 224 aa  43.1  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09390  Urease accessory protein UreF  21.21 
 
 		 224 aa  43.5  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3351  urease accessory protein UreF  22.35 
 
 		 214 aa  43.5  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.742339  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08901  urease accessory protein UreF  20.36 
 
 		 228 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.460278  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0831  urease accessory protein UreF  19.46 
 
 		 228 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0286  putative urease accessory protein UreF  42.22 
 
 		 232 aa  42.7  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3532  urease accessory protein UreF  24.58 
 
 		 251 aa  42.4  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510813  normal  0.516432 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0963  urease accessory protein UreF  39.29 
 
 		 230 aa  42.4  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0374203 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0991  urease accessory protein UreF  40.48 
 
 		 210 aa  42  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08881  urease accessory protein UreF  19.46 
 
 		 228 aa  41.6  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.751902  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2622  urease accessory protein F  22.55 
 
 		 223 aa  41.6  0.01  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0673782  normal  0.796864 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>