133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3239 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_3239  Urease accessory protein UreF  100 
 
 
238 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.525319 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3014  urease accessory protein UreF  97.06 
 
 
244 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347135  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3203  Urease accessory protein UreF  87.5 
 
 
224 aa  362  2e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2866  urease accessory protein UreF  73.54 
 
 
229 aa  287  9e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669452  normal  0.213531 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2120  urease accessory protein UreF  71.17 
 
 
250 aa  261  8e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1092  Urease accessory protein UreF  68.44 
 
 
239 aa  257  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.827823  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4159  urease accessory protein UreF  61.88 
 
 
309 aa  255  5e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.896165  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1868  urease accessory protein UreF  51.6 
 
 
237 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.113809  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3497  urease accessory protein UreF  51.14 
 
 
288 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7006  urease accessory protein UreF  49.32 
 
 
240 aa  199  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_004310  BR0272  urease accessory protein UreF, putative  50.43 
 
 
228 aa  190  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0337  urease accessory protein UreF, putative  48.64 
 
 
228 aa  187  8e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3690  urease accessory protein UreF  48.4 
 
 
241 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0286  putative urease accessory protein UreF  50.22 
 
 
232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4179  Urease accessory protein UreF  48.64 
 
 
240 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3260  urease accessory protein UreF  46.36 
 
 
228 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0303  urease accessory protein UreF  48.18 
 
 
210 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3303  Urease accessory protein UreF  46.36 
 
 
223 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.31623 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0381  urease accessory protein UreF  46.4 
 
 
214 aa  161  8.000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11359  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2686  urease accessory protein UreF  44.54 
 
 
223 aa  160  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885864  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1702  Urease accessory protein UreF  45.45 
 
 
225 aa  156  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278425 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1947  urease accessory protein UreF  47.27 
 
 
210 aa  156  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218708  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1029  urease accessory protein UreF  39.29 
 
 
231 aa  152  5e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.185094 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0991  urease accessory protein UreF  44.09 
 
 
210 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2009  Urease accessory protein UreF  46.55 
 
 
231 aa  144  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3469  urease accessory protein  44.49 
 
 
230 aa  144  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3047  Urease accessory protein UreF  45 
 
 
223 aa  142  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159294  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2378  urease accessory protein UreF  41.82 
 
 
223 aa  142  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.173139 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2362  putative urease accessory protein  39.55 
 
 
210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.875021 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1425  urease accessory protein UreF  38.14 
 
 
228 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3407  urease accessory protein UreF  34.38 
 
 
225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4247  Urease accessory protein UreF  37.28 
 
 
223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1755  urease accessory protein UreF  39.09 
 
 
220 aa  108  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  0.885594 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3532  urease accessory protein UreF  37.72 
 
 
251 aa  109  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510813  normal  0.516432 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3941  Urease accessory protein UreF  39.82 
 
 
259 aa  108  8.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.552118  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0972  urease accessory protein UreF  36.24 
 
 
232 aa  108  8.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1348  urease accessory protein UreF  34.8 
 
 
233 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1765  urease accessory protein UreF  31.67 
 
 
227 aa  105  7e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.858852  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2303  urease accessory protein UreF  37.44 
 
 
230 aa  102  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1191  urease accessory protein UreF  32.88 
 
 
230 aa  102  8e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424033  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0963  urease accessory protein UreF  35.32 
 
 
230 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0374203 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2439  urease accessory protein UreF  31.36 
 
 
227 aa  97.4  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.280457  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1206  urease accessory protein UreF  38.16 
 
 
215 aa  96.7  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1180  urease accessory protein UreF  39.21 
 
 
238 aa  96.3  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801104  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0223  urease accessory protein UreF  32.43 
 
 
221 aa  95.9  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0884  urease accessory protein UreF  33.33 
 
 
235 aa  95.5  7e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.782823  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0664  urease accessory protein  39.91 
 
 
237 aa  95.5  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1494  urease accessory protein UreF  35.17 
 
 
236 aa  94.4  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.36478  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4635  urease accessory protein UreF  30.9 
 
 
229 aa  93.6  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00483851  normal  0.066113 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1325  UreF  32.13 
 
 
224 aa  94  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0997  urease accessory protein UreF  34.35 
 
 
230 aa  93.6  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371175  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1724  urease accessory protein UreF  33.21 
 
 
288 aa  92  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.616016  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1070  urease accessory protein UreF  32.91 
 
 
250 aa  90.9  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2267  Urease accessory protein UreF  32.7 
 
 
227 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0788  urease accessory protein UreF  34.87 
 
 
226 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4452  urease accessory protein UreF  33.63 
 
 
224 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0665  urease accessory protein UreF  32.42 
 
 
224 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675417  normal  0.0233838 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4910  urease accessory protein UreF  33.03 
 
 
224 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2991  urease accessory protein UreF  33.33 
 
 
231 aa  89.4  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.901747  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0419  urease accessory protein UreF  35.06 
 
 
226 aa  88.6  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.885315  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0898  urease accessory protein UreF  35.06 
 
 
226 aa  88.6  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4737  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2030  urease accessory protein UreF  38.81 
 
 
229 aa  88.2  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.859598  normal  0.139287 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0868  urease accessory protein UreF  35.06 
 
 
226 aa  88.6  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.947799  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0777  urease accessory protein UreF  35.04 
 
 
226 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2420  urease accessory protein UreF  31.46 
 
 
224 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0454768  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0958  urease accessory protein UreF  27.78 
 
 
230 aa  86.7  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0186  urease accessory protein UreF  29.65 
 
 
228 aa  85.9  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3696  putative urease accessory protein UreF  36.57 
 
 
226 aa  85.5  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.378168 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1859  Urease accessory protein UreF  38.7 
 
 
229 aa  85.5  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.148323 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09390  Urease accessory protein UreF  32.42 
 
 
224 aa  85.5  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2492  urease accessory protein UreF  34.63 
 
 
226 aa  85.1  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4004  urease accessory protein UreF  34.63 
 
 
226 aa  85.1  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.471956 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2186  urease accessory protein UreF  37.44 
 
 
226 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3137  urease accessory protein  37.44 
 
 
236 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3106  Urease accessory protein UreF  28.11 
 
 
253 aa  84.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0721  urease accessory protein UreF  37.44 
 
 
236 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2555  urease accessory protein UreF  37.44 
 
 
226 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3078  urease accessory protein UreF  37.44 
 
 
236 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3114  urease accessory protein UreF  37.44 
 
 
236 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2059  urease accessory protein UreF  37.44 
 
 
236 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.917688  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1814  urease accessory protein UreF  25.64 
 
 
240 aa  83.2  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2841  urease accessory protein UreF  32.87 
 
 
224 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2182  Urease accessory protein UreF  39.15 
 
 
229 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349664  normal  0.124246 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0926  Urease accessory protein UreF  35.81 
 
 
226 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2848  urease accessory protein UreF  32.41 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2878  urease accessory protein UreF  30.18 
 
 
224 aa  81.6  0.000000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1243  urease accessory protein UreF  28.9 
 
 
226 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3468  urease accessory protein UreF  31.42 
 
 
224 aa  80.5  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000115011  normal  0.208076 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2262  urease accessory protein UreF  37.5 
 
 
226 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.998709 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2996  urease accessory protein UreF  25.45 
 
 
232 aa  78.2  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0245  urease accessory protein UreF  28.77 
 
 
225 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0685  urease accessory protein UreF  25.55 
 
 
228 aa  77  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00891  Urease accessory protein UreF  24.88 
 
 
208 aa  74.3  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.42714  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2932  urease accessory protein UreF  31.78 
 
 
224 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.617644  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64660  urease accessory protein UreF  32.19 
 
 
223 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0385936  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2769  Urease accessory protein UreF  28.96 
 
 
225 aa  73.6  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0562  urease accessory protein UreF  30.91 
 
 
224 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2316  urease accessory protein UreF  24.89 
 
 
229 aa  73.2  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.495239  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2359  urease accessory protein UreF  24.89 
 
 
229 aa  73.2  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0751  urease accessory protein UreF  24.34 
 
 
232 aa  72.4  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>