128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1859 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1859  Urease accessory protein UreF  100 
 
 		 229 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.148323 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2182  Urease accessory protein UreF  96.51 
 
 		 229 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349664  normal  0.124246 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2030  urease accessory protein UreF  84.28 
 
 		 229 aa  357  9.999999999999999e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.859598  normal  0.139287 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0997  urease accessory protein UreF  63.04 
 
 		 230 aa  276  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371175  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0963  urease accessory protein UreF  60.43 
 
 		 230 aa  260  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0374203 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0788  urease accessory protein UreF  57.52 
 
 		 226 aa  227  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0419  urease accessory protein UreF  57.96 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.885315  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0898  urease accessory protein UreF  57.96 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4737  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2492  urease accessory protein UreF  58.85 
 
 		 226 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0868  urease accessory protein UreF  57.52 
 
 		 226 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.947799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4004  urease accessory protein UreF  57.52 
 
 		 226 aa  221  9e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.471956 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1494  urease accessory protein UreF  55.84 
 
 		 236 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.36478  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0777  urease accessory protein UreF  57.52 
 
 		 226 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1191  urease accessory protein UreF  50.67 
 
 		 230 aa  217  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424033  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2186  urease accessory protein UreF  56.77 
 
 		 226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3137  urease accessory protein  56.77 
 
 		 236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0721  urease accessory protein UreF  56.77 
 
 		 236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2555  urease accessory protein UreF  56.77 
 
 		 226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3078  urease accessory protein UreF  56.77 
 
 		 236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3114  urease accessory protein UreF  56.77 
 
 		 236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2059  urease accessory protein UreF  56.77 
 
 		 236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.917688  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3696  putative urease accessory protein UreF  55.31 
 
 		 226 aa  211  9e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.378168 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0926  Urease accessory protein UreF  56.19 
 
 		 226 aa  209  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2262  urease accessory protein UreF  55.31 
 
 		 226 aa  207  8e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.998709 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1180  urease accessory protein UreF  54.78 
 
 		 238 aa  198  6e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1765  urease accessory protein UreF  43.04 
 
 		 227 aa  172  5e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.858852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3532  urease accessory protein UreF  49.57 
 
 		 251 aa  170  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510813  normal  0.516432 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3407  urease accessory protein UreF  46.15 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1243  urease accessory protein UreF  42.15 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0972  urease accessory protein UreF  48.28 
 
 		 232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1425  urease accessory protein UreF  47 
 
 		 228 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3941  Urease accessory protein UreF  50.89 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.552118  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0664  urease accessory protein  48.26 
 
 		 237 aa  159  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4247  Urease accessory protein UreF  44.35 
 
 		 223 aa  155  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1348  urease accessory protein UreF  44.74 
 
 		 233 aa  153  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2878  urease accessory protein UreF  41.96 
 
 		 224 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0223  urease accessory protein UreF  40.43 
 
 		 221 aa  141  8e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09390  Urease accessory protein UreF  43.86 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2991  urease accessory protein UreF  41.78 
 
 		 231 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.901747  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4452  urease accessory protein UreF  41.85 
 
 		 224 aa  135  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0562  urease accessory protein UreF  41.89 
 
 		 224 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0665  urease accessory protein UreF  43.05 
 
 		 224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675417  normal  0.0233838 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4910  urease accessory protein UreF  40.97 
 
 		 224 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0884  urease accessory protein UreF  38.67 
 
 		 235 aa  129  3e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.782823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2439  urease accessory protein UreF  40.53 
 
 		 227 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.280457  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3106  Urease accessory protein UreF  43.05 
 
 		 253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1070  urease accessory protein UreF  38.74 
 
 		 250 aa  126  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2303  urease accessory protein UreF  41.52 
 
 		 230 aa  125  8.000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64660  urease accessory protein UreF  43.17 
 
 		 223 aa  121  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0385936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2996  urease accessory protein UreF  34.67 
 
 		 232 aa  119  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5615  urease accessory protein UreF  43.17 
 
 		 223 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0186  urease accessory protein UreF  40.09 
 
 		 228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4635  urease accessory protein UreF  35.75 
 
 		 229 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00483851  normal  0.066113 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00891  Urease accessory protein UreF  34.6 
 
 		 208 aa  110  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.42714  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0984  urease accessory protein UreF  33.97 
 
 		 269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.341569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2420  urease accessory protein UreF  38.71 
 
 		 224 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0454768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0958  urease accessory protein UreF  36.45 
 
 		 230 aa  105  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2848  urease accessory protein UreF  39.17 
 
 		 224 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2841  urease accessory protein UreF  38.71 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2267  Urease accessory protein UreF  35.51 
 
 		 227 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1702  Urease accessory protein UreF  38.46 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278425 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29761  urease accessory protein UreF  35.19 
 
 		 227 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2932  urease accessory protein UreF  37.79 
 
 		 224 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.617644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1325  UreF  33.48 
 
 		 224 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2252  urease accessory protein F  35.65 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0245  urease accessory protein UreF  36.75 
 
 		 225 aa  95.5  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3468  urease accessory protein UreF  35.29 
 
 		 224 aa  91.3  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000115011  normal  0.208076 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2622  urease accessory protein F  35.34 
 
 		 223 aa  89.4  5e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0673782  normal  0.796864 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1868  urease accessory protein UreF  35.65 
 
 		 237 aa  89  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.113809  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0394  Urease accessory protein UreF  35.09 
 
 		 227 aa  88.6  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3239  Urease accessory protein UreF  39.17 
 
 		 238 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.525319 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2866  urease accessory protein UreF  38.2 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669452  normal  0.213531 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3014  urease accessory protein UreF  37.75 
 
 		 244 aa  87  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7006  urease accessory protein UreF  32.73 
 
 		 240 aa  86.3  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3203  Urease accessory protein UreF  40.6 
 
 		 224 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2120  urease accessory protein UreF  39.11 
 
 		 250 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2686  urease accessory protein UreF  32.65 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885864  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4159  urease accessory protein UreF  34.82 
 
 		 309 aa  82  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.896165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3497  urease accessory protein UreF  35.93 
 
 		 288 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1092  Urease accessory protein UreF  39.46 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.827823  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08901  urease accessory protein UreF  24.78 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.460278  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19211  urease accessory protein UreF  30.13 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0722  Urease accessory protein UreF  25.11 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08881  urease accessory protein UreF  25.22 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.751902  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0831  urease accessory protein UreF  25.94 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4833  urease accessory protein UreF  25.99 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1814  urease accessory protein UreF  24.9 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1050  urease accessory protein ureF  29.26 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.713958  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3690  urease accessory protein UreF  33.33 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1029  urease accessory protein UreF  33.06 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.185094 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1724  urease accessory protein UreF  45.63 
 
 		 288 aa  75.5  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.616016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2009  Urease accessory protein UreF  33.47 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4179  Urease accessory protein UreF  29.82 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3047  Urease accessory protein UreF  31.2 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3303  Urease accessory protein UreF  31.78 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.31623 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0381  urease accessory protein UreF  32.75 
 
 		 214 aa  71.6  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1476  Urease accessory protein UreF  28.95 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0566307  normal  0.716543 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0991  urease accessory protein UreF  32.89 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03460  urease accessory protein UreF  30.47 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0327  urease accessory protein  24.15 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>