131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1092 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1092  Urease accessory protein UreF  100 
 
 
239 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.827823  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2120  urease accessory protein UreF  86.34 
 
 
250 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2866  urease accessory protein UreF  73.36 
 
 
229 aa  286  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669452  normal  0.213531 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3203  Urease accessory protein UreF  70.4 
 
 
224 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3014  urease accessory protein UreF  67.36 
 
 
244 aa  270  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347135  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3239  Urease accessory protein UreF  67.38 
 
 
238 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.525319 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4159  urease accessory protein UreF  65.45 
 
 
309 aa  259  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.896165  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7006  urease accessory protein UreF  50.46 
 
 
240 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3690  urease accessory protein UreF  50.46 
 
 
241 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3497  urease accessory protein UreF  50 
 
 
288 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1868  urease accessory protein UreF  46.78 
 
 
237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.113809  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4179  Urease accessory protein UreF  48.62 
 
 
240 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1947  urease accessory protein UreF  48.87 
 
 
210 aa  165  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218708  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1702  Urease accessory protein UreF  47.95 
 
 
225 aa  164  8e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278425 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0303  urease accessory protein UreF  48.18 
 
 
210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0381  urease accessory protein UreF  43.69 
 
 
214 aa  162  6e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11359  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0337  urease accessory protein UreF, putative  42.99 
 
 
228 aa  161  7e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0272  urease accessory protein UreF, putative  42.86 
 
 
228 aa  158  6e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3303  Urease accessory protein UreF  45.5 
 
 
223 aa  158  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.31623 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0991  urease accessory protein UreF  45.98 
 
 
210 aa  155  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2686  urease accessory protein UreF  44.5 
 
 
223 aa  154  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885864  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3260  urease accessory protein UreF  44.93 
 
 
228 aa  153  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2009  Urease accessory protein UreF  47.51 
 
 
231 aa  152  7e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0286  putative urease accessory protein UreF  42.67 
 
 
232 aa  151  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1029  urease accessory protein UreF  38.84 
 
 
231 aa  145  7.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.185094 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3047  Urease accessory protein UreF  44.14 
 
 
223 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159294  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2378  urease accessory protein UreF  43.04 
 
 
223 aa  143  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.173139 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3469  urease accessory protein  44.25 
 
 
230 aa  142  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2362  putative urease accessory protein  42.27 
 
 
210 aa  137  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.875021 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3532  urease accessory protein UreF  41.07 
 
 
251 aa  122  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510813  normal  0.516432 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1425  urease accessory protein UreF  38.14 
 
 
228 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2303  urease accessory protein UreF  39.91 
 
 
230 aa  118  7.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1755  urease accessory protein UreF  43.18 
 
 
220 aa  115  5e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  0.885594 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4247  Urease accessory protein UreF  37.44 
 
 
223 aa  113  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3941  Urease accessory protein UreF  41.1 
 
 
259 aa  112  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.552118  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2267  Urease accessory protein UreF  33.01 
 
 
227 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4635  urease accessory protein UreF  30.99 
 
 
229 aa  108  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00483851  normal  0.066113 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0223  urease accessory protein UreF  33.49 
 
 
221 aa  107  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1191  urease accessory protein UreF  34.56 
 
 
230 aa  107  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424033  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1070  urease accessory protein UreF  37.94 
 
 
250 aa  105  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0664  urease accessory protein  42.6 
 
 
237 aa  104  9e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3106  Urease accessory protein UreF  34.57 
 
 
253 aa  105  9e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1348  urease accessory protein UreF  36.91 
 
 
233 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2439  urease accessory protein UreF  33.91 
 
 
227 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.280457  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0868  urease accessory protein UreF  39.47 
 
 
226 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.947799  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0419  urease accessory protein UreF  40.18 
 
 
226 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.885315  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0898  urease accessory protein UreF  40.18 
 
 
226 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4737  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1243  urease accessory protein UreF  35.02 
 
 
226 aa  101  9e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3407  urease accessory protein UreF  34.36 
 
 
225 aa  101  9e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1724  urease accessory protein UreF  35.23 
 
 
288 aa  101  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.616016  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1206  urease accessory protein UreF  40.17 
 
 
215 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0972  urease accessory protein UreF  37.84 
 
 
232 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0788  urease accessory protein UreF  37.67 
 
 
226 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1765  urease accessory protein UreF  32.03 
 
 
227 aa  100  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.858852  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2878  urease accessory protein UreF  33.33 
 
 
224 aa  99.4  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09390  Urease accessory protein UreF  38.18 
 
 
224 aa  99.8  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2492  urease accessory protein UreF  39.29 
 
 
226 aa  99.4  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1494  urease accessory protein UreF  37.5 
 
 
236 aa  99  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.36478  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0777  urease accessory protein UreF  37.67 
 
 
226 aa  99  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2030  urease accessory protein UreF  40.81 
 
 
229 aa  98.2  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.859598  normal  0.139287 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3696  putative urease accessory protein UreF  37.27 
 
 
226 aa  96.7  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.378168 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0186  urease accessory protein UreF  33.64 
 
 
228 aa  95.5  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4004  urease accessory protein UreF  37.95 
 
 
226 aa  95.5  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.471956 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4452  urease accessory protein UreF  35.48 
 
 
224 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0884  urease accessory protein UreF  32.59 
 
 
235 aa  95.1  8e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.782823  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2991  urease accessory protein UreF  32.92 
 
 
231 aa  95.1  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.901747  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2420  urease accessory protein UreF  34.39 
 
 
224 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0454768  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0963  urease accessory protein UreF  34.07 
 
 
230 aa  93.6  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0374203 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4910  urease accessory protein UreF  34.56 
 
 
224 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0926  Urease accessory protein UreF  37.73 
 
 
226 aa  92  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0665  urease accessory protein UreF  35.45 
 
 
224 aa  92  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675417  normal  0.0233838 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2262  urease accessory protein UreF  38.39 
 
 
226 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.998709 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0997  urease accessory protein UreF  33.62 
 
 
230 aa  90.1  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371175  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0562  urease accessory protein UreF  33.64 
 
 
224 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2186  urease accessory protein UreF  36.82 
 
 
226 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3137  urease accessory protein  36.82 
 
 
236 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0721  urease accessory protein UreF  36.82 
 
 
236 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2555  urease accessory protein UreF  36.82 
 
 
226 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3078  urease accessory protein UreF  36.82 
 
 
236 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3114  urease accessory protein UreF  36.82 
 
 
236 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2059  urease accessory protein UreF  36.82 
 
 
236 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.917688  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00891  Urease accessory protein UreF  30.48 
 
 
208 aa  87  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.42714  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0958  urease accessory protein UreF  26.54 
 
 
230 aa  86.7  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1180  urease accessory protein UreF  36.56 
 
 
238 aa  86.3  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801104  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1859  Urease accessory protein UreF  37.56 
 
 
229 aa  85.9  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.148323 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1325  UreF  33.33 
 
 
224 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2848  urease accessory protein UreF  34.58 
 
 
224 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2182  Urease accessory protein UreF  39.46 
 
 
229 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349664  normal  0.124246 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2841  urease accessory protein UreF  33.33 
 
 
224 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0245  urease accessory protein UreF  30.37 
 
 
225 aa  79.7  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2622  urease accessory protein F  33.04 
 
 
223 aa  79.7  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0673782  normal  0.796864 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3468  urease accessory protein UreF  32.03 
 
 
224 aa  79.3  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000115011  normal  0.208076 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4833  urease accessory protein UreF  25.33 
 
 
228 aa  79.3  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64660  urease accessory protein UreF  35.14 
 
 
223 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0385936  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5615  urease accessory protein UreF  35.48 
 
 
223 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0751  urease accessory protein UreF  22.32 
 
 
232 aa  76.3  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0831  urease accessory protein UreF  24.12 
 
 
228 aa  75.9  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2932  urease accessory protein UreF  33.64 
 
 
224 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.617644  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2996  urease accessory protein UreF  27.51 
 
 
232 aa  75.1  0.0000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2252  urease accessory protein F  30.87 
 
 
223 aa  74.7  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>