135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1814 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1814  urease accessory protein UreF  100 
 
 		 240 aa  494  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4833  urease accessory protein UreF  41.33 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1476  Urease accessory protein UreF  39.11 
 
 		 228 aa  162  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0566307  normal  0.716543 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0722  Urease accessory protein UreF  36.44 
 
 		 240 aa  160  2e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0245  urease accessory protein UreF  29.73 
 
 		 225 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03460  urease accessory protein UreF  26.47 
 
 		 238 aa  118  9e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1873  urease accessory protein UreF  27.03 
 
 		 229 aa  116  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.674114  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0685  urease accessory protein UreF  26.91 
 
 		 228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2316  urease accessory protein UreF  27.03 
 
 		 229 aa  112  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.495239  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2359  urease accessory protein UreF  27.03 
 
 		 229 aa  112  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0327  urease accessory protein  25.33 
 
 		 237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0394  Urease accessory protein UreF  30.04 
 
 		 227 aa  109  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0475  urease accessory protein UreF  30.74 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3660  urease accessory protein UreF  30.36 
 
 		 232 aa  106  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.098957  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2769  Urease accessory protein UreF  26.61 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4635  urease accessory protein UreF  26.67 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00483851  normal  0.066113 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1243  urease accessory protein UreF  27.27 
 
 		 226 aa  90.1  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7006  urease accessory protein UreF  25.11 
 
 		 240 aa  88.2  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3497  urease accessory protein UreF  28.07 
 
 		 288 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2878  urease accessory protein UreF  25.66 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1868  urease accessory protein UreF  24.89 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.113809  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1191  urease accessory protein UreF  25.96 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424033  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0665  urease accessory protein UreF  26.64 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675417  normal  0.0233838 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1765  urease accessory protein UreF  24.66 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.858852  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4910  urease accessory protein UreF  24.55 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4452  urease accessory protein UreF  24.55 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1553  Urease accessory protein UreF  22.44 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4159  urease accessory protein UreF  25.55 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.896165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0562  urease accessory protein UreF  23.01 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1348  urease accessory protein UreF  24.24 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1360  urease accessory protein UreF, putative  22.67 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1702  Urease accessory protein UreF  24.35 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278425 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3407  urease accessory protein UreF  24.35 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0751  urease accessory protein UreF  23.18 
 
 		 232 aa  78.2  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3260  urease accessory protein UreF  24.36 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09390  Urease accessory protein UreF  25.44 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2439  urease accessory protein UreF  22.65 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.280457  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3690  urease accessory protein UreF  24.78 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0997  urease accessory protein UreF  26.2 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371175  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3532  urease accessory protein UreF  22.22 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510813  normal  0.516432 
 
 
-
 
NC_004310  BR0272  urease accessory protein UreF, putative  24.58 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2456  urease accessory protein UreF  25.21 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3558  urease accessory protein  22.81 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.45506  normal  0.0231315 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1135  urease accessory protein UreF  22.81 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1081  urease accessory protein UreF  22.81 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4416  Urease accessory protein UreF  23.11 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3239  Urease accessory protein UreF  25.64 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.525319 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2030  urease accessory protein UreF  24.78 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.859598  normal  0.139287 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0963  urease accessory protein UreF  25.21 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0374203 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0286  putative urease accessory protein UreF  24.34 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4247  Urease accessory protein UreF  22.52 
 
 		 223 aa  72  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3303  Urease accessory protein UreF  25.93 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.31623 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0337  urease accessory protein UreF, putative  22.77 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4179  Urease accessory protein UreF  23.35 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1859  Urease accessory protein UreF  25.21 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.148323 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1180  urease accessory protein UreF  26.82 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0972  urease accessory protein UreF  23.48 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3203  Urease accessory protein UreF  23.25 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3014  urease accessory protein UreF  26.23 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29761  urease accessory protein UreF  22.41 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1029  urease accessory protein UreF  23.42 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.185094 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2182  Urease accessory protein UreF  23.01 
 
 		 229 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349664  normal  0.124246 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1947  urease accessory protein UreF  25.11 
 
 		 210 aa  68.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2267  Urease accessory protein UreF  24.88 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2996  urease accessory protein UreF  22.87 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3469  urease accessory protein  24.79 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0664  urease accessory protein  25.7 
 
 		 237 aa  67  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2716  urease accessory protein UreF  25.53 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2378  urease accessory protein UreF  24.54 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.173139 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00891  Urease accessory protein UreF  21.7 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.42714  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2686  urease accessory protein UreF  28.63 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885864  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5118  Urease accessory protein UreF  24.77 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0958  urease accessory protein UreF  21.5 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0303  urease accessory protein UreF  23.32 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3047  Urease accessory protein UreF  25 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4214  urease accessory protein UreF  27.56 
 
 		 247 aa  65.1  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3106  Urease accessory protein UreF  23.11 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0381  urease accessory protein UreF  21.97 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2303  urease accessory protein UreF  21.62 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0186  urease accessory protein UreF  22.97 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1070  urease accessory protein UreF  21.86 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4004  urease accessory protein UreF  21.1 
 
 		 226 aa  62  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.471956 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1494  urease accessory protein UreF  22.36 
 
 		 236 aa  62  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.36478  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1425  urease accessory protein UreF  21.82 
 
 		 228 aa  62  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0788  urease accessory protein UreF  21.52 
 
 		 226 aa  62  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0991  urease accessory protein UreF  25.33 
 
 		 210 aa  61.6  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0831  urease accessory protein UreF  22.47 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08901  urease accessory protein UreF  22.22 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.460278  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2866  urease accessory protein UreF  22.07 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669452  normal  0.213531 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2492  urease accessory protein UreF  21.37 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3941  Urease accessory protein UreF  24.66 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.552118  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0419  urease accessory protein UreF  21.1 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.885315  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0898  urease accessory protein UreF  21.1 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4737  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0868  urease accessory protein UreF  21.1 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.947799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1092  Urease accessory protein UreF  21.69 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.827823  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2252  urease accessory protein F  22.51 
 
 		 223 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08881  urease accessory protein UreF  22.32 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.751902  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0884  urease accessory protein UreF  20.09 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.782823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0777  urease accessory protein UreF  21.1 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1206  urease accessory protein UreF  25.56 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>