120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1553 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1553  Urease accessory protein UreF  100 
 
 		 266 aa  529  1e-149  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0751  urease accessory protein UreF  32.92 
 
 		 232 aa  121  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4416  Urease accessory protein UreF  34.32 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1360  urease accessory protein UreF, putative  29.71 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2199  urease accessory protein UreF  30.74 
 
 		 243 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0590668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2716  urease accessory protein UreF  34.33 
 
 		 229 aa  106  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2412  urease accessory protein UreF  32.93 
 
 		 243 aa  105  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0245  urease accessory protein UreF  31.38 
 
 		 225 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0061  Urease accessory protein UreF  31.54 
 
 		 239 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1081  urease accessory protein UreF  26.97 
 
 		 228 aa  89  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3558  urease accessory protein  26.97 
 
 		 228 aa  89  8e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.45506  normal  0.0231315 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1135  urease accessory protein UreF  26.97 
 
 		 228 aa  89  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4833  urease accessory protein UreF  26.05 
 
 		 228 aa  88.2  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0394  Urease accessory protein UreF  31.09 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1814  urease accessory protein UreF  22.44 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1476  Urease accessory protein UreF  30.58 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0566307  normal  0.716543 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7006  urease accessory protein UreF  31.33 
 
 		 240 aa  81.6  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03460  urease accessory protein UreF  28.63 
 
 		 238 aa  81.6  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0685  urease accessory protein UreF  27.35 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0722  Urease accessory protein UreF  23.85 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6191  urease accessory protein UreF  30.54 
 
 		 227 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00827459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1960  putative urease accessory protein UreF  30.8 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1868  urease accessory protein UreF  31.2 
 
 		 237 aa  72  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.113809  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1303  urease accessory protein UreF  27.66 
 
 		 240 aa  72  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4635  urease accessory protein UreF  27.27 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00483851  normal  0.066113 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1465  Urease accessory protein UreF  27.66 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0475  urease accessory protein UreF  22.05 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5118  Urease accessory protein UreF  29.79 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3690  urease accessory protein UreF  29.18 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1195  urease accessory protein UreF  32.5 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110316 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2769  Urease accessory protein UreF  25.1 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1262  urease accessory protein  26.19 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.614669 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0327  urease accessory protein  22.69 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1355  Urease accessory protein UreF  32.08 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0963  urease accessory protein UreF  26.23 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0374203 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4247  Urease accessory protein UreF  27.16 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2267  Urease accessory protein UreF  24.36 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3660  urease accessory protein UreF  21.9 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.098957  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4444  urease accessory protein UreF  28.87 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.8214 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3497  urease accessory protein UreF  29.32 
 
 		 288 aa  65.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4004  urease accessory protein UreF  28.87 
 
 		 226 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.471956 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2064  Urease accessory protein UreF  35.63 
 
 		 233 aa  65.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000168254  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2303  urease accessory protein UreF  28.97 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1681  urease accessory protein UreF  30.71 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0997  urease accessory protein UreF  26.03 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371175  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3407  urease accessory protein UreF  23.87 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0419  urease accessory protein UreF  28.03 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.885315  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0898  urease accessory protein UreF  28.03 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4737  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0868  urease accessory protein UreF  28.51 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.947799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3696  putative urease accessory protein UreF  28.09 
 
 		 226 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.378168 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0788  urease accessory protein UreF  27.2 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1702  Urease accessory protein UreF  32.08 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278425 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1348  urease accessory protein UreF  23.72 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1765  urease accessory protein UreF  25.96 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.858852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4179  Urease accessory protein UreF  24.91 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1134  Urease accessory protein UreF  32.37 
 
 		 226 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348852  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1873  urease accessory protein UreF  19.92 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.674114  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1494  urease accessory protein UreF  27.16 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.36478  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3351  urease accessory protein UreF  29.17 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.742339  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2492  urease accessory protein UreF  27.62 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0884  urease accessory protein UreF  24.6 
 
 		 235 aa  57  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.782823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0777  urease accessory protein UreF  26.36 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0381  urease accessory protein UreF  27.27 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2362  putative urease accessory protein  29.87 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.875021 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1070  urease accessory protein UreF  23.72 
 
 		 250 aa  55.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0272  urease accessory protein UreF, putative  24.9 
 
 		 228 aa  54.7  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0991  urease accessory protein UreF  25.83 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2878  urease accessory protein UreF  25.11 
 
 		 224 aa  53.9  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1947  urease accessory protein UreF  26.72 
 
 		 210 aa  53.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0223  urease accessory protein UreF  23.68 
 
 		 221 aa  53.1  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3532  urease accessory protein UreF  24.28 
 
 		 251 aa  53.5  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510813  normal  0.516432 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2186  urease accessory protein UreF  27.57 
 
 		 226 aa  52.8  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3137  urease accessory protein  27.57 
 
 		 236 aa  52.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0721  urease accessory protein UreF  27.57 
 
 		 236 aa  52.8  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2555  urease accessory protein UreF  27.57 
 
 		 226 aa  52.8  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3078  urease accessory protein UreF  27.57 
 
 		 236 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3114  urease accessory protein UreF  27.57 
 
 		 236 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2059  urease accessory protein UreF  27.57 
 
 		 236 aa  52.8  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.917688  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0958  urease accessory protein UreF  23.68 
 
 		 230 aa  52.4  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0926  Urease accessory protein UreF  27.23 
 
 		 226 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0303  urease accessory protein UreF  26.72 
 
 		 210 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2991  urease accessory protein UreF  22.22 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.901747  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0972  urease accessory protein UreF  23.55 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1724  urease accessory protein UreF  24.81 
 
 		 288 aa  52  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.616016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3047  Urease accessory protein UreF  34.38 
 
 		 223 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3469  urease accessory protein  26.67 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2316  urease accessory protein UreF  20.92 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.495239  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2359  urease accessory protein UreF  20.92 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2378  urease accessory protein UreF  26.64 
 
 		 223 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.173139 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0831  urease accessory protein UreF  20.38 
 
 		 228 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0286  putative urease accessory protein UreF  24.5 
 
 		 232 aa  50.4  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0337  urease accessory protein UreF, putative  25.52 
 
 		 228 aa  50.4  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2420  urease accessory protein UreF  25.44 
 
 		 224 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0454768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3303  Urease accessory protein UreF  35.64 
 
 		 223 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.31623 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1180  urease accessory protein UreF  28.63 
 
 		 238 aa  49.3  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801104  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2030  urease accessory protein UreF  26.02 
 
 		 229 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.859598  normal  0.139287 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08901  urease accessory protein UreF  20.39 
 
 		 228 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.460278  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03290  urease accessory protein UreF  30.49 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3203  Urease accessory protein UreF  28.63 
 
 		 224 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1859  Urease accessory protein UreF  24.39 
 
 		 229 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.148323 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>