133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1243 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1243  urease accessory protein UreF  100 
 
 
226 aa  456  1e-127  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0963  urease accessory protein UreF  47.77 
 
 
230 aa  198  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0374203 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0419  urease accessory protein UreF  47.51 
 
 
226 aa  181  6e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.885315  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0898  urease accessory protein UreF  47.51 
 
 
226 aa  181  6e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4737  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0997  urease accessory protein UreF  45.45 
 
 
230 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371175  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1494  urease accessory protein UreF  46.61 
 
 
236 aa  180  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.36478  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2492  urease accessory protein UreF  47.51 
 
 
226 aa  179  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0868  urease accessory protein UreF  47.06 
 
 
226 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.947799  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0788  urease accessory protein UreF  45.25 
 
 
226 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4004  urease accessory protein UreF  46.15 
 
 
226 aa  175  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.471956 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0777  urease accessory protein UreF  46.15 
 
 
226 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3696  putative urease accessory protein UreF  45.7 
 
 
226 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.378168 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2030  urease accessory protein UreF  46.32 
 
 
229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.859598  normal  0.139287 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0926  Urease accessory protein UreF  45.25 
 
 
226 aa  170  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2878  urease accessory protein UreF  43.5 
 
 
224 aa  168  6e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3137  urease accessory protein  45.25 
 
 
236 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0721  urease accessory protein UreF  45.25 
 
 
236 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3078  urease accessory protein UreF  45.25 
 
 
236 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3114  urease accessory protein UreF  45.25 
 
 
236 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2059  urease accessory protein UreF  45.25 
 
 
236 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.917688  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2186  urease accessory protein UreF  45.25 
 
 
226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2555  urease accessory protein UreF  45.25 
 
 
226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1765  urease accessory protein UreF  39.21 
 
 
227 aa  165  5e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.858852  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2182  Urease accessory protein UreF  42.19 
 
 
229 aa  164  9e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349664  normal  0.124246 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3941  Urease accessory protein UreF  46.3 
 
 
259 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.552118  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2262  urease accessory protein UreF  44.8 
 
 
226 aa  161  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.998709 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1425  urease accessory protein UreF  42.33 
 
 
228 aa  159  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0884  urease accessory protein UreF  40.99 
 
 
235 aa  159  4e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.782823  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1859  Urease accessory protein UreF  43.04 
 
 
229 aa  157  9e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.148323 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1191  urease accessory protein UreF  40.18 
 
 
230 aa  155  7e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424033  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3106  Urease accessory protein UreF  40.37 
 
 
253 aa  150  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1180  urease accessory protein UreF  43.78 
 
 
238 aa  149  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801104  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3407  urease accessory protein UreF  40.99 
 
 
225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4247  Urease accessory protein UreF  39.65 
 
 
223 aa  145  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0223  urease accessory protein UreF  35.68 
 
 
221 aa  144  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2991  urease accessory protein UreF  38.5 
 
 
231 aa  144  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.901747  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09390  Urease accessory protein UreF  44.14 
 
 
224 aa  142  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2303  urease accessory protein UreF  40.99 
 
 
230 aa  142  5e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3532  urease accessory protein UreF  39.91 
 
 
251 aa  141  7e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510813  normal  0.516432 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4452  urease accessory protein UreF  41.33 
 
 
224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4910  urease accessory protein UreF  40.89 
 
 
224 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2439  urease accessory protein UreF  37.1 
 
 
227 aa  137  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.280457  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0665  urease accessory protein UreF  42.47 
 
 
224 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675417  normal  0.0233838 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0562  urease accessory protein UreF  41.1 
 
 
224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5615  urease accessory protein UreF  44.59 
 
 
223 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1348  urease accessory protein UreF  39.11 
 
 
233 aa  131  7.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0186  urease accessory protein UreF  41.1 
 
 
228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1070  urease accessory protein UreF  37.34 
 
 
250 aa  129  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64660  urease accessory protein UreF  44.59 
 
 
223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0385936  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2420  urease accessory protein UreF  38.79 
 
 
224 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0454768  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2848  urease accessory protein UreF  38.79 
 
 
224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2841  urease accessory protein UreF  38.79 
 
 
224 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0664  urease accessory protein  38.57 
 
 
237 aa  124  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0972  urease accessory protein UreF  36.04 
 
 
232 aa  123  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1724  urease accessory protein UreF  35.61 
 
 
288 aa  122  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.616016  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4635  urease accessory protein UreF  37.56 
 
 
229 aa  119  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00483851  normal  0.066113 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2996  urease accessory protein UreF  32.57 
 
 
232 aa  115  6e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2932  urease accessory protein UreF  38.79 
 
 
224 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.617644  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4833  urease accessory protein UreF  32.44 
 
 
228 aa  111  8.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00891  Urease accessory protein UreF  32.21 
 
 
208 aa  111  8.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.42714  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0984  urease accessory protein UreF  34.8 
 
 
269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.341569  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1325  UreF  34.55 
 
 
224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2267  Urease accessory protein UreF  37.61 
 
 
227 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1868  urease accessory protein UreF  32.86 
 
 
237 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.113809  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1947  urease accessory protein UreF  37.56 
 
 
210 aa  106  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218708  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0303  urease accessory protein UreF  37.1 
 
 
210 aa  105  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0958  urease accessory protein UreF  30.81 
 
 
230 aa  105  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4179  Urease accessory protein UreF  30.97 
 
 
240 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0722  Urease accessory protein UreF  30.04 
 
 
240 aa  105  7e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3497  urease accessory protein UreF  32.86 
 
 
288 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3690  urease accessory protein UreF  30.99 
 
 
241 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2009  Urease accessory protein UreF  36.77 
 
 
231 aa  101  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3468  urease accessory protein UreF  34.05 
 
 
224 aa  100  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000115011  normal  0.208076 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0991  urease accessory protein UreF  35.59 
 
 
210 aa  96.3  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4159  urease accessory protein UreF  33.48 
 
 
309 aa  96.7  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.896165  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0394  Urease accessory protein UreF  31.08 
 
 
227 aa  95.5  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0245  urease accessory protein UreF  31.56 
 
 
225 aa  95.1  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2252  urease accessory protein F  30.9 
 
 
223 aa  95.1  8e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1814  urease accessory protein UreF  27.07 
 
 
240 aa  94.4  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1702  Urease accessory protein UreF  33.77 
 
 
225 aa  94  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278425 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29761  urease accessory protein UreF  31.3 
 
 
227 aa  92.8  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7006  urease accessory protein UreF  30.42 
 
 
240 aa  91.7  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1476  Urease accessory protein UreF  33.19 
 
 
228 aa  90.5  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0566307  normal  0.716543 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1092  Urease accessory protein UreF  34.8 
 
 
239 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.827823  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2622  urease accessory protein F  34.04 
 
 
223 aa  84.3  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0673782  normal  0.796864 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2866  urease accessory protein UreF  32.89 
 
 
229 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669452  normal  0.213531 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2120  urease accessory protein UreF  33.78 
 
 
250 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3203  Urease accessory protein UreF  31.7 
 
 
224 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03460  urease accessory protein UreF  28.88 
 
 
238 aa  77.4  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1050  urease accessory protein ureF  28.63 
 
 
223 aa  76.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.713958  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19211  urease accessory protein UreF  28.19 
 
 
223 aa  76.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2686  urease accessory protein UreF  29.33 
 
 
223 aa  75.5  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885864  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1029  urease accessory protein UreF  29.46 
 
 
231 aa  74.3  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.185094 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3303  Urease accessory protein UreF  28.82 
 
 
223 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.31623 
 
 
-
 
NC_004310  BR1360  urease accessory protein UreF, putative  24.67 
 
 
243 aa  72  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3014  urease accessory protein UreF  29.31 
 
 
244 aa  71.6  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347135  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3660  urease accessory protein UreF  25.78 
 
 
232 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.098957  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08901  urease accessory protein UreF  22.57 
 
 
228 aa  70.1  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.460278  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3047  Urease accessory protein UreF  27.88 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159294  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2359  urease accessory protein UreF  25.22 
 
 
229 aa  69.3  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>