123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1303 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1303  urease accessory protein UreF  100 
 
 		 240 aa  484  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1465  Urease accessory protein UreF  99.58 
 
 		 240 aa  481  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5118  Urease accessory protein UreF  87.08 
 
 		 240 aa  402  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1360  urease accessory protein UreF, putative  45.18 
 
 		 243 aa  196  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3558  urease accessory protein  45.78 
 
 		 228 aa  194  7e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.45506  normal  0.0231315 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1135  urease accessory protein UreF  45.78 
 
 		 228 aa  194  7e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1081  urease accessory protein UreF  45.33 
 
 		 228 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0751  urease accessory protein UreF  29.78 
 
 		 232 aa  97.8  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4416  Urease accessory protein UreF  30.32 
 
 		 232 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0061  Urease accessory protein UreF  31.25 
 
 		 239 aa  87  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2716  urease accessory protein UreF  30.91 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0245  urease accessory protein UreF  27.16 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0963  urease accessory protein UreF  26.09 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0374203 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2439  urease accessory protein UreF  29.96 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.280457  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1873  urease accessory protein UreF  24.22 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.674114  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2316  urease accessory protein UreF  23.89 
 
 		 229 aa  75.1  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.495239  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2359  urease accessory protein UreF  23.89 
 
 		 229 aa  75.1  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1476  Urease accessory protein UreF  26.55 
 
 		 228 aa  71.6  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0566307  normal  0.716543 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3532  urease accessory protein UreF  29.61 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510813  normal  0.516432 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0997  urease accessory protein UreF  25.21 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371175  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4635  urease accessory protein UreF  23.77 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00483851  normal  0.066113 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0327  urease accessory protein  23.42 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7006  urease accessory protein UreF  27.66 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4004  urease accessory protein UreF  27.12 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.471956 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0685  urease accessory protein UreF  22.67 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3660  urease accessory protein UreF  24.68 
 
 		 232 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.098957  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3690  urease accessory protein UreF  26.7 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2199  urease accessory protein UreF  28.03 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0590668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0972  urease accessory protein UreF  27.63 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4833  urease accessory protein UreF  24.11 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1960  putative urease accessory protein UreF  28.07 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4444  urease accessory protein UreF  31.53 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.8214 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1494  urease accessory protein UreF  26.75 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.36478  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1195  urease accessory protein UreF  29.73 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110316 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4247  Urease accessory protein UreF  25.86 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3106  Urease accessory protein UreF  26.07 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6191  urease accessory protein UreF  29.87 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00827459  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2030  urease accessory protein UreF  26.56 
 
 		 229 aa  62  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.859598  normal  0.139287 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2412  urease accessory protein UreF  26.18 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1070  urease accessory protein UreF  27.27 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03290  urease accessory protein UreF  29.63 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1702  Urease accessory protein UreF  29.6 
 
 		 225 aa  61.6  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278425 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1355  Urease accessory protein UreF  29.91 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4214  urease accessory protein UreF  28.21 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6442  putative urease accessory protein  29.82 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0548041  normal  0.22219 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4179  Urease accessory protein UreF  24.9 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0777  urease accessory protein UreF  28.45 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1553  Urease accessory protein UreF  27.66 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3014  urease accessory protein UreF  28.83 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0788  urease accessory protein UreF  27.62 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3696  putative urease accessory protein UreF  27.39 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.378168 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0664  urease accessory protein  28.93 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2492  urease accessory protein UreF  26.99 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03460  urease accessory protein UreF  23.31 
 
 		 238 aa  57  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1868  urease accessory protein UreF  27.47 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.113809  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3239  Urease accessory protein UreF  27.03 
 
 		 238 aa  57  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.525319 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3203  Urease accessory protein UreF  32.43 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3497  urease accessory protein UreF  28.81 
 
 		 288 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1814  urease accessory protein UreF  26.02 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0475  urease accessory protein UreF  21.74 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2262  urease accessory protein UreF  25.22 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.998709 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0926  Urease accessory protein UreF  24.89 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2182  Urease accessory protein UreF  25.65 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349664  normal  0.124246 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0974  hypothetical protein  29.55 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0303  urease accessory protein UreF  27.83 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1348  urease accessory protein UreF  24.46 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0394  Urease accessory protein UreF  25.23 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4050  hypothetical protein  29.09 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0419  urease accessory protein UreF  26.11 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.885315  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0898  urease accessory protein UreF  26.11 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4737  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0868  urease accessory protein UreF  26.13 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.947799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0337  urease accessory protein UreF, putative  23.87 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1134  Urease accessory protein UreF  27.93 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3407  urease accessory protein UreF  26.32 
 
 		 225 aa  55.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2996  urease accessory protein UreF  30.77 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0722  Urease accessory protein UreF  22.71 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1765  urease accessory protein UreF  24.11 
 
 		 227 aa  53.1  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.858852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2303  urease accessory protein UreF  28 
 
 		 230 aa  52.8  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0884  urease accessory protein UreF  26.22 
 
 		 235 aa  52.4  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.782823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1243  urease accessory protein UreF  23.15 
 
 		 226 aa  52.4  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1947  urease accessory protein UreF  27.39 
 
 		 210 aa  52.4  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1859  Urease accessory protein UreF  26.75 
 
 		 229 aa  52  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.148323 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2186  urease accessory protein UreF  26.99 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1425  urease accessory protein UreF  22.17 
 
 		 228 aa  51.2  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0381  urease accessory protein UreF  25 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2555  urease accessory protein UreF  26.99 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2064  Urease accessory protein UreF  28.82 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000168254  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1325  UreF  26.2 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3137  urease accessory protein  26.99 
 
 		 236 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0721  urease accessory protein UreF  26.99 
 
 		 236 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3078  urease accessory protein UreF  26.99 
 
 		 236 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3114  urease accessory protein UreF  26.99 
 
 		 236 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2059  urease accessory protein UreF  26.99 
 
 		 236 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.917688  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0991  urease accessory protein UreF  25.78 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2267  Urease accessory protein UreF  23.58 
 
 		 227 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1029  urease accessory protein UreF  25.32 
 
 		 231 aa  48.9  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.185094 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1191  urease accessory protein UreF  21.74 
 
 		 230 aa  48.5  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424033  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1724  urease accessory protein UreF  31.43 
 
 		 288 aa  47.8  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.616016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2362  putative urease accessory protein  24.11 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.875021 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48625  predicted protein  26.69 
 
 		 666 aa  48.5  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>