119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4416 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4416  Urease accessory protein UreF  100 
 
 		 232 aa  472  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0751  urease accessory protein UreF  58.62 
 
 		 232 aa  282  3.0000000000000004e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1553  Urease accessory protein UreF  34.32 
 
 		 266 aa  107  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1303  urease accessory protein UreF  30.32 
 
 		 240 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1465  Urease accessory protein UreF  30.32 
 
 		 240 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0245  urease accessory protein UreF  28.38 
 
 		 225 aa  95.9  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1960  putative urease accessory protein UreF  29.65 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2199  urease accessory protein UreF  30.96 
 
 		 243 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0590668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6191  urease accessory protein UreF  29.69 
 
 		 227 aa  92  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00827459  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1360  urease accessory protein UreF, putative  28.63 
 
 		 243 aa  91.7  9e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7006  urease accessory protein UreF  27.27 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2716  urease accessory protein UreF  29.63 
 
 		 229 aa  89.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2769  Urease accessory protein UreF  29.63 
 
 		 225 aa  89.7  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03460  urease accessory protein UreF  25.34 
 
 		 238 aa  89.4  5e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2412  urease accessory protein UreF  28.76 
 
 		 243 aa  87  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1873  urease accessory protein UreF  24.32 
 
 		 229 aa  86.3  4e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.674114  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4179  Urease accessory protein UreF  28.64 
 
 		 240 aa  85.5  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1081  urease accessory protein UreF  26.46 
 
 		 228 aa  85.1  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3558  urease accessory protein  26.46 
 
 		 228 aa  85.1  8e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.45506  normal  0.0231315 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1135  urease accessory protein UreF  26.46 
 
 		 228 aa  85.1  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3690  urease accessory protein UreF  26.82 
 
 		 241 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0685  urease accessory protein UreF  29.28 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1702  Urease accessory protein UreF  29.07 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278425 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2316  urease accessory protein UreF  26.55 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.495239  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2359  urease accessory protein UreF  26.55 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0394  Urease accessory protein UreF  28.38 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1868  urease accessory protein UreF  27.03 
 
 		 237 aa  78.2  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.113809  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4833  urease accessory protein UreF  25 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5118  Urease accessory protein UreF  28.96 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0337  urease accessory protein UreF, putative  29.2 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1765  urease accessory protein UreF  25.33 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.858852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4444  urease accessory protein UreF  30.7 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.8214 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1355  Urease accessory protein UreF  31.58 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1814  urease accessory protein UreF  23.11 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1195  urease accessory protein UreF  30.67 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110316 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0061  Urease accessory protein UreF  28.51 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3660  urease accessory protein UreF  23.48 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.098957  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6442  putative urease accessory protein  29.07 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0548041  normal  0.22219 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0327  urease accessory protein  24 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1476  Urease accessory protein UreF  26.03 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0566307  normal  0.716543 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1325  UreF  25.89 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0286  putative urease accessory protein UreF  29.73 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3497  urease accessory protein UreF  26.82 
 
 		 288 aa  68.6  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0272  urease accessory protein UreF, putative  29.73 
 
 		 228 aa  68.2  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0381  urease accessory protein UreF  27.43 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1029  urease accessory protein UreF  27.23 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.185094 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2064  Urease accessory protein UreF  31.46 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000168254  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3303  Urease accessory protein UreF  27.57 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.31623 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1134  Urease accessory protein UreF  30.67 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03290  urease accessory protein UreF  29.83 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0223  urease accessory protein UreF  24.67 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4050  hypothetical protein  31.98 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0991  urease accessory protein UreF  27.23 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0722  Urease accessory protein UreF  25.75 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2996  urease accessory protein UreF  25.68 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3351  urease accessory protein UreF  28.14 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.742339  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1947  urease accessory protein UreF  26.58 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11879  urease accessory protein ureF  28.32 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4159  urease accessory protein UreF  26.98 
 
 		 309 aa  62  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.896165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0475  urease accessory protein UreF  23.32 
 
 		 235 aa  62  0.000000007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0303  urease accessory protein UreF  26.58 
 
 		 210 aa  62  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29761  urease accessory protein UreF  25.32 
 
 		 227 aa  62  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1348  urease accessory protein UreF  23.08 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3468  urease accessory protein UreF  25.23 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000115011  normal  0.208076 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4247  Urease accessory protein UreF  24.05 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0974  hypothetical protein  28.51 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2303  urease accessory protein UreF  24.2 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1681  urease accessory protein UreF  26.92 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2362  putative urease accessory protein  24.78 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.875021 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2378  urease accessory protein UreF  29.86 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.173139 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4635  urease accessory protein UreF  24.43 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00483851  normal  0.066113 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2267  Urease accessory protein UreF  26.73 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2439  urease accessory protein UreF  24.37 
 
 		 227 aa  55.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.280457  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3014  urease accessory protein UreF  23.68 
 
 		 244 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3203  Urease accessory protein UreF  23.11 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0186  urease accessory protein UreF  25.76 
 
 		 228 aa  53.5  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3239  Urease accessory protein UreF  23.25 
 
 		 238 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.525319 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3047  Urease accessory protein UreF  24.66 
 
 		 223 aa  52.4  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2686  urease accessory protein UreF  24.32 
 
 		 223 aa  52  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885864  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2841  urease accessory protein UreF  23.94 
 
 		 224 aa  52  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2420  urease accessory protein UreF  24.17 
 
 		 224 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0454768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0831  putative urease accessory protein  23.23 
 
 		 265 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2456  urease accessory protein UreF  24.79 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2009  Urease accessory protein UreF  27.63 
 
 		 231 aa  50.4  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48625  predicted protein  25.2 
 
 		 666 aa  50.1  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1262  urease accessory protein  22.12 
 
 		 233 aa  49.7  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.614669 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1494  urease accessory protein UreF  22.57 
 
 		 236 aa  49.3  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.36478  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1755  urease accessory protein UreF  21.15 
 
 		 220 aa  48.9  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  0.885594 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2252  urease accessory protein F  23.11 
 
 		 223 aa  48.9  0.00007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3469  urease accessory protein  26.43 
 
 		 230 aa  48.9  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2848  urease accessory protein UreF  23 
 
 		 224 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0972  urease accessory protein UreF  21.72 
 
 		 232 aa  47.8  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2831  urease accessory protein UreF  28.57 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2866  urease accessory protein UreF  21.88 
 
 		 229 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669452  normal  0.213531 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3407  urease accessory protein UreF  22.17 
 
 		 225 aa  47.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0192  urease accessory protein UreF  25.28 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2804  urease accessory protein UreF  28.57 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2848  urease accessory protein UreF  28.57 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5698  urease accessory protein UreF  26.09 
 
 		 244 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1092  Urease accessory protein UreF  21.03 
 
 		 239 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.827823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>