130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1325 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1325  UreF  100 
 
 
224 aa  454  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3468  urease accessory protein UreF  70.09 
 
 
224 aa  289  3e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000115011  normal  0.208076 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2420  urease accessory protein UreF  54.76 
 
 
224 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0454768  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2841  urease accessory protein UreF  54.29 
 
 
224 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2848  urease accessory protein UreF  53.81 
 
 
224 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2932  urease accessory protein UreF  53.33 
 
 
224 aa  204  7e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.617644  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3106  Urease accessory protein UreF  42.22 
 
 
253 aa  161  8.000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0223  urease accessory protein UreF  40.28 
 
 
221 aa  159  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0186  urease accessory protein UreF  41.2 
 
 
228 aa  142  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2996  urease accessory protein UreF  38.36 
 
 
232 aa  142  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0958  urease accessory protein UreF  37.68 
 
 
230 aa  142  6e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1765  urease accessory protein UreF  36.52 
 
 
227 aa  141  9e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.858852  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0884  urease accessory protein UreF  38.64 
 
 
235 aa  137  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.782823  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2991  urease accessory protein UreF  38.74 
 
 
231 aa  136  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.901747  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00891  Urease accessory protein UreF  37.02 
 
 
208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.42714  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2303  urease accessory protein UreF  39.91 
 
 
230 aa  124  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1191  urease accessory protein UreF  35.27 
 
 
230 aa  124  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424033  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4247  Urease accessory protein UreF  36.16 
 
 
223 aa  120  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3407  urease accessory protein UreF  36.32 
 
 
225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2439  urease accessory protein UreF  34.56 
 
 
227 aa  115  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.280457  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1425  urease accessory protein UreF  38.79 
 
 
228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4635  urease accessory protein UreF  31.11 
 
 
229 aa  111  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00483851  normal  0.066113 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0788  urease accessory protein UreF  33.33 
 
 
226 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0997  urease accessory protein UreF  34.35 
 
 
230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371175  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1348  urease accessory protein UreF  34.53 
 
 
233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0963  urease accessory protein UreF  31.86 
 
 
230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0374203 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0777  urease accessory protein UreF  32.03 
 
 
226 aa  108  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2878  urease accessory protein UreF  34.38 
 
 
224 aa  107  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3532  urease accessory protein UreF  34.51 
 
 
251 aa  107  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510813  normal  0.516432 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4004  urease accessory protein UreF  32.47 
 
 
226 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.471956 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3941  Urease accessory protein UreF  37.5 
 
 
259 aa  106  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.552118  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2492  urease accessory protein UreF  31.17 
 
 
226 aa  105  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1868  urease accessory protein UreF  36.36 
 
 
237 aa  104  9e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.113809  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0419  urease accessory protein UreF  31.6 
 
 
226 aa  104  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.885315  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0898  urease accessory protein UreF  31.6 
 
 
226 aa  104  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4737  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1243  urease accessory protein UreF  33.8 
 
 
226 aa  104  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3696  putative urease accessory protein UreF  34.4 
 
 
226 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.378168 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0868  urease accessory protein UreF  31.6 
 
 
226 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.947799  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0665  urease accessory protein UreF  36.82 
 
 
224 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675417  normal  0.0233838 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0664  urease accessory protein  35.56 
 
 
237 aa  100  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4910  urease accessory protein UreF  36.07 
 
 
224 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4452  urease accessory protein UreF  38.18 
 
 
224 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2267  Urease accessory protein UreF  32.86 
 
 
227 aa  99  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0926  Urease accessory protein UreF  34.39 
 
 
226 aa  99  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1494  urease accessory protein UreF  31.25 
 
 
236 aa  98.6  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.36478  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0972  urease accessory protein UreF  32.74 
 
 
232 aa  98.2  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2030  urease accessory protein UreF  34.78 
 
 
229 aa  97.1  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.859598  normal  0.139287 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1702  Urease accessory protein UreF  35.81 
 
 
225 aa  96.7  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278425 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1070  urease accessory protein UreF  33.75 
 
 
250 aa  96.7  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2262  urease accessory protein UreF  31.7 
 
 
226 aa  95.9  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.998709 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7006  urease accessory protein UreF  33.03 
 
 
240 aa  95.5  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2186  urease accessory protein UreF  32.14 
 
 
226 aa  95.1  8e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3137  urease accessory protein  32.14 
 
 
236 aa  95.1  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0721  urease accessory protein UreF  32.14 
 
 
236 aa  95.1  8e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2555  urease accessory protein UreF  32.14 
 
 
226 aa  95.1  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2059  urease accessory protein UreF  32.14 
 
 
236 aa  95.1  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.917688  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3078  urease accessory protein UreF  32.14 
 
 
236 aa  95.1  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3114  urease accessory protein UreF  32.14 
 
 
236 aa  95.1  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1180  urease accessory protein UreF  34.5 
 
 
238 aa  94.4  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801104  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0562  urease accessory protein UreF  36.07 
 
 
224 aa  94  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3014  urease accessory protein UreF  33.03 
 
 
244 aa  92  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347135  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3239  Urease accessory protein UreF  32.13 
 
 
238 aa  91.7  9e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.525319 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1859  Urease accessory protein UreF  33.03 
 
 
229 aa  91.3  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.148323 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2182  Urease accessory protein UreF  34.08 
 
 
229 aa  90.9  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349664  normal  0.124246 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3203  Urease accessory protein UreF  33.78 
 
 
224 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4179  Urease accessory protein UreF  32.14 
 
 
240 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0984  urease accessory protein UreF  28.86 
 
 
269 aa  89.4  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.341569  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09390  Urease accessory protein UreF  34.86 
 
 
224 aa  89  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1724  urease accessory protein UreF  29.7 
 
 
288 aa  88.2  9e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.616016  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3690  urease accessory protein UreF  32.74 
 
 
241 aa  85.5  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1050  urease accessory protein ureF  28.44 
 
 
223 aa  84.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.713958  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64660  urease accessory protein UreF  37.33 
 
 
223 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0385936  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2252  urease accessory protein F  30.36 
 
 
223 aa  82  0.000000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5615  urease accessory protein UreF  36.87 
 
 
223 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19211  urease accessory protein UreF  27.56 
 
 
223 aa  81.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3497  urease accessory protein UreF  36.2 
 
 
288 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2866  urease accessory protein UreF  34.76 
 
 
229 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669452  normal  0.213531 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0381  urease accessory protein UreF  32.31 
 
 
214 aa  76.6  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11359  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29761  urease accessory protein UreF  27.54 
 
 
227 aa  74.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2622  urease accessory protein F  29.02 
 
 
223 aa  73.6  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0673782  normal  0.796864 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1029  urease accessory protein UreF  31.09 
 
 
231 aa  72.8  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.185094 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4159  urease accessory protein UreF  31.11 
 
 
309 aa  72.8  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.896165  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3260  urease accessory protein UreF  30.05 
 
 
228 aa  72.8  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2120  urease accessory protein UreF  33.48 
 
 
250 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4416  Urease accessory protein UreF  25.89 
 
 
232 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0327  urease accessory protein  23.38 
 
 
237 aa  69.7  0.00000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2009  Urease accessory protein UreF  32.55 
 
 
231 aa  67.8  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2362  putative urease accessory protein  28.45 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.875021 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3469  urease accessory protein  30.8 
 
 
230 aa  66.2  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1873  urease accessory protein UreF  24.78 
 
 
229 aa  64.7  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.674114  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0245  urease accessory protein UreF  29.39 
 
 
225 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1092  Urease accessory protein UreF  33.33 
 
 
239 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.827823  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0722  Urease accessory protein UreF  22.94 
 
 
240 aa  62.8  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0303  urease accessory protein UreF  26.27 
 
 
210 aa  62  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0751  urease accessory protein UreF  23.14 
 
 
232 aa  60.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0991  urease accessory protein UreF  29.95 
 
 
210 aa  59.7  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3660  urease accessory protein UreF  21.97 
 
 
232 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.098957  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0394  Urease accessory protein UreF  27.88 
 
 
227 aa  58.9  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03460  urease accessory protein UreF  25.1 
 
 
238 aa  57.8  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1947  urease accessory protein UreF  25.81 
 
 
210 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218708  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>