123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3469 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3469  urease accessory protein  100 
 
 		 230 aa  447  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3303  Urease accessory protein UreF  54.35 
 
 		 223 aa  221  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.31623 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3047  Urease accessory protein UreF  54.35 
 
 		 223 aa  210  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2378  urease accessory protein UreF  47.56 
 
 		 223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.173139 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0337  urease accessory protein UreF, putative  47.51 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0272  urease accessory protein UreF, putative  49.55 
 
 		 228 aa  181  6e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7006  urease accessory protein UreF  50 
 
 		 240 aa  180  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0286  putative urease accessory protein UreF  49.11 
 
 		 232 aa  180  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2686  urease accessory protein UreF  46.96 
 
 		 223 aa  172  5.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885864  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3690  urease accessory protein UreF  48.67 
 
 		 241 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1868  urease accessory protein UreF  46.93 
 
 		 237 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.113809  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3497  urease accessory protein UreF  48.26 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4179  Urease accessory protein UreF  46.81 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0381  urease accessory protein UreF  44.34 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2866  urease accessory protein UreF  45.06 
 
 		 229 aa  132  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669452  normal  0.213531 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3239  Urease accessory protein UreF  44.49 
 
 		 238 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.525319 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3014  urease accessory protein UreF  45.37 
 
 		 244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3203  Urease accessory protein UreF  42.73 
 
 		 224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4159  urease accessory protein UreF  43.48 
 
 		 309 aa  125  7e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.896165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2362  putative urease accessory protein  40.72 
 
 		 210 aa  125  8.000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.875021 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1947  urease accessory protein UreF  40.72 
 
 		 210 aa  122  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2120  urease accessory protein UreF  45.13 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0303  urease accessory protein UreF  40.72 
 
 		 210 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0991  urease accessory protein UreF  39.64 
 
 		 210 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1092  Urease accessory protein UreF  42.92 
 
 		 239 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.827823  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1702  Urease accessory protein UreF  38.89 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278425 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3260  urease accessory protein UreF  38.26 
 
 		 228 aa  101  8e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1755  urease accessory protein UreF  36.61 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  0.885594 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1029  urease accessory protein UreF  34.58 
 
 		 231 aa  95.1  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.185094 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1206  urease accessory protein UreF  36.48 
 
 		 215 aa  92.4  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2009  Urease accessory protein UreF  38.22 
 
 		 231 aa  90.9  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1494  urease accessory protein UreF  33.05 
 
 		 236 aa  87.8  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.36478  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4247  Urease accessory protein UreF  29.82 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3696  putative urease accessory protein UreF  33.19 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.378168 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4635  urease accessory protein UreF  27.2 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00483851  normal  0.066113 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4004  urease accessory protein UreF  32.62 
 
 		 226 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.471956 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1191  urease accessory protein UreF  28.27 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424033  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0223  urease accessory protein UreF  29.26 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1765  urease accessory protein UreF  30.43 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.858852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2303  urease accessory protein UreF  30.7 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1425  urease accessory protein UreF  32.43 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2439  urease accessory protein UreF  30.04 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.280457  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2492  urease accessory protein UreF  32.03 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2262  urease accessory protein UreF  32.61 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.998709 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3137  urease accessory protein  31.36 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3532  urease accessory protein UreF  31.91 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510813  normal  0.516432 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0721  urease accessory protein UreF  31.36 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3078  urease accessory protein UreF  31.36 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3114  urease accessory protein UreF  31.36 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2059  urease accessory protein UreF  31.36 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.917688  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3407  urease accessory protein UreF  29.74 
 
 		 225 aa  72  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0788  urease accessory protein UreF  31.33 
 
 		 226 aa  72  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1348  urease accessory protein UreF  29.44 
 
 		 233 aa  72  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2186  urease accessory protein UreF  31.33 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2555  urease accessory protein UreF  31.33 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0963  urease accessory protein UreF  31.47 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0374203 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0419  urease accessory protein UreF  31.06 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.885315  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0898  urease accessory protein UreF  31.06 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4737  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0868  urease accessory protein UreF  31.06 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.947799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0186  urease accessory protein UreF  30.04 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0777  urease accessory protein UreF  31.33 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4833  urease accessory protein UreF  24.12 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0926  Urease accessory protein UreF  31.42 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0997  urease accessory protein UreF  29.87 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371175  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1180  urease accessory protein UreF  30.86 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2996  urease accessory protein UreF  30.96 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1814  urease accessory protein UreF  24.79 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1325  UreF  30.8 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1476  Urease accessory protein UreF  27.87 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0566307  normal  0.716543 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0751  urease accessory protein UreF  28.07 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03460  urease accessory protein UreF  27.87 
 
 		 238 aa  65.1  0.0000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2267  Urease accessory protein UreF  26.61 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3106  Urease accessory protein UreF  31.62 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0972  urease accessory protein UreF  29.1 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1070  urease accessory protein UreF  29.6 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1243  urease accessory protein UreF  26.11 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0958  urease accessory protein UreF  27.78 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3941  Urease accessory protein UreF  32.3 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.552118  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0327  urease accessory protein  25.1 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0245  urease accessory protein UreF  25.89 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0394  Urease accessory protein UreF  26.11 
 
 		 227 aa  57  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1724  urease accessory protein UreF  26.91 
 
 		 288 aa  57  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.616016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0884  urease accessory protein UreF  27.35 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.782823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3468  urease accessory protein UreF  28.57 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000115011  normal  0.208076 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1859  Urease accessory protein UreF  30.36 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.148323 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3660  urease accessory protein UreF  20.73 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.098957  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2878  urease accessory protein UreF  25 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0664  urease accessory protein  32.02 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1873  urease accessory protein UreF  18.26 
 
 		 229 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.674114  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0831  urease accessory protein UreF  20.63 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2030  urease accessory protein UreF  31.09 
 
 		 229 aa  53.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.859598  normal  0.139287 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09390  Urease accessory protein UreF  28.33 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2316  urease accessory protein UreF  20 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.495239  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2359  urease accessory protein UreF  20 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2991  urease accessory protein UreF  27.63 
 
 		 231 aa  53.5  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.901747  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2848  urease accessory protein UreF  31.44 
 
 		 224 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2841  urease accessory protein UreF  30.36 
 
 		 224 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0665  urease accessory protein UreF  29.65 
 
 		 224 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675417  normal  0.0233838 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2412  urease accessory protein UreF  27.56 
 
 		 243 aa  52  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2252  urease accessory protein F  28.14 
 
 		 223 aa  52  0.000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>