137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1868 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1868  urease accessory protein UreF  100 
 
 		 237 aa  467  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.113809  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3497  urease accessory protein UreF  89.03 
 
 		 288 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4179  Urease accessory protein UreF  79.66 
 
 		 240 aa  355  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3690  urease accessory protein UreF  79.09 
 
 		 241 aa  342  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7006  urease accessory protein UreF  72.97 
 
 		 240 aa  319  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4159  urease accessory protein UreF  54.5 
 
 		 309 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.896165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3014  urease accessory protein UreF  52.51 
 
 		 244 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3239  Urease accessory protein UreF  51.6 
 
 		 238 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.525319 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3203  Urease accessory protein UreF  51.14 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1702  Urease accessory protein UreF  50.22 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278425 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0381  urease accessory protein UreF  47.03 
 
 		 214 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11359  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0272  urease accessory protein UreF, putative  47.39 
 
 		 228 aa  178  5.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0337  urease accessory protein UreF, putative  46.19 
 
 		 228 aa  178  7e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2866  urease accessory protein UreF  49.77 
 
 		 229 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669452  normal  0.213531 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1092  Urease accessory protein UreF  46.78 
 
 		 239 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.827823  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2120  urease accessory protein UreF  48.62 
 
 		 250 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0286  putative urease accessory protein UreF  48.2 
 
 		 232 aa  172  2.9999999999999996e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2009  Urease accessory protein UreF  49.12 
 
 		 231 aa  169  5e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2378  urease accessory protein UreF  47.75 
 
 		 223 aa  166  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.173139 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3303  Urease accessory protein UreF  47.09 
 
 		 223 aa  165  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.31623 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1029  urease accessory protein UreF  43.86 
 
 		 231 aa  164  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.185094 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3469  urease accessory protein  46.93 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0303  urease accessory protein UreF  45.29 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1947  urease accessory protein UreF  45.29 
 
 		 210 aa  156  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2686  urease accessory protein UreF  44.59 
 
 		 223 aa  155  7e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885864  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3047  Urease accessory protein UreF  46.4 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0991  urease accessory protein UreF  39.64 
 
 		 210 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3260  urease accessory protein UreF  42.34 
 
 		 228 aa  139  4.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2362  putative urease accessory protein  40.53 
 
 		 210 aa  138  8.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.875021 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1206  urease accessory protein UreF  43.5 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1755  urease accessory protein UreF  37.23 
 
 		 220 aa  118  7e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  0.885594 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2267  Urease accessory protein UreF  34.86 
 
 		 227 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4635  urease accessory protein UreF  36.28 
 
 		 229 aa  112  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00483851  normal  0.066113 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2439  urease accessory protein UreF  35.14 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.280457  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2303  urease accessory protein UreF  36.09 
 
 		 230 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1243  urease accessory protein UreF  32.86 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3106  Urease accessory protein UreF  35.02 
 
 		 253 aa  105  8e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1325  UreF  36.36 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0223  urease accessory protein UreF  31.53 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0186  urease accessory protein UreF  34.2 
 
 		 228 aa  102  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3407  urease accessory protein UreF  34.82 
 
 		 225 aa  101  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2996  urease accessory protein UreF  31.22 
 
 		 232 aa  101  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3696  putative urease accessory protein UreF  35.87 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.378168 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0884  urease accessory protein UreF  33.05 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.782823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1765  urease accessory protein UreF  31.3 
 
 		 227 aa  99.4  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.858852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4247  Urease accessory protein UreF  34.53 
 
 		 223 aa  99.4  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1494  urease accessory protein UreF  34.98 
 
 		 236 aa  97.4  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.36478  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2991  urease accessory protein UreF  32.48 
 
 		 231 aa  98.2  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.901747  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3468  urease accessory protein UreF  32.61 
 
 		 224 aa  96.3  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000115011  normal  0.208076 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2420  urease accessory protein UreF  36.7 
 
 		 224 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0454768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0245  urease accessory protein UreF  34.58 
 
 		 225 aa  95.1  8e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3532  urease accessory protein UreF  36.17 
 
 		 251 aa  94.7  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510813  normal  0.516432 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1348  urease accessory protein UreF  34.44 
 
 		 233 aa  93.6  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0419  urease accessory protein UreF  36.62 
 
 		 226 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.885315  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0898  urease accessory protein UreF  36.62 
 
 		 226 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4737  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0664  urease accessory protein  38.63 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2841  urease accessory protein UreF  37.9 
 
 		 224 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3941  Urease accessory protein UreF  36.94 
 
 		 259 aa  93.6  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.552118  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0868  urease accessory protein UreF  36.62 
 
 		 226 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.947799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0788  urease accessory protein UreF  36.92 
 
 		 226 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3660  urease accessory protein UreF  25.11 
 
 		 232 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.098957  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2878  urease accessory protein UreF  31.7 
 
 		 224 aa  93.6  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09390  Urease accessory protein UreF  35.14 
 
 		 224 aa  92.8  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1425  urease accessory protein UreF  33.18 
 
 		 228 aa  92.8  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4004  urease accessory protein UreF  36.15 
 
 		 226 aa  92.4  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.471956 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2848  urease accessory protein UreF  37.44 
 
 		 224 aa  92  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1724  urease accessory protein UreF  31.46 
 
 		 288 aa  92  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.616016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0777  urease accessory protein UreF  36.92 
 
 		 226 aa  92  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0997  urease accessory protein UreF  33.63 
 
 		 230 aa  91.7  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371175  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00891  Urease accessory protein UreF  32.72 
 
 		 208 aa  91.7  9e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.42714  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0963  urease accessory protein UreF  32 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0374203 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0926  Urease accessory protein UreF  34.98 
 
 		 226 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0665  urease accessory protein UreF  31.46 
 
 		 224 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675417  normal  0.0233838 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4833  urease accessory protein UreF  24.89 
 
 		 228 aa  90.1  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2492  urease accessory protein UreF  35.29 
 
 		 226 aa  90.9  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0972  urease accessory protein UreF  34.65 
 
 		 232 aa  90.1  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2182  Urease accessory protein UreF  37.23 
 
 		 229 aa  89  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349664  normal  0.124246 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2262  urease accessory protein UreF  34.53 
 
 		 226 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.998709 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0751  urease accessory protein UreF  28.64 
 
 		 232 aa  87.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1070  urease accessory protein UreF  33.33 
 
 		 250 aa  86.3  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29761  urease accessory protein UreF  30.26 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1814  urease accessory protein UreF  24.89 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0958  urease accessory protein UreF  29.11 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0394  Urease accessory protein UreF  30 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1180  urease accessory protein UreF  33.63 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1859  Urease accessory protein UreF  35.65 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.148323 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1476  Urease accessory protein UreF  28.07 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0566307  normal  0.716543 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2932  urease accessory protein UreF  36.7 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.617644  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4910  urease accessory protein UreF  30.52 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2769  Urease accessory protein UreF  28.64 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0685  urease accessory protein UreF  23.42 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0562  urease accessory protein UreF  31.31 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2186  urease accessory protein UreF  34.08 
 
 		 226 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4452  urease accessory protein UreF  30.52 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2555  urease accessory protein UreF  34.08 
 
 		 226 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3137  urease accessory protein  34.08 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0721  urease accessory protein UreF  34.08 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2059  urease accessory protein UreF  34.08 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.917688  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4416  Urease accessory protein UreF  27.03 
 
 		 232 aa  78.2  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3114  urease accessory protein UreF  34.08 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>