158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0114 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0114  response regulator receiver protein  100 
 
 
127 aa  249  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.273159  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0099  putative response regulator  85.12 
 
 
124 aa  207  4e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0102  response regulator, putative  84.3 
 
 
125 aa  205  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.248594  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2338  response regulator receiver protein  42.74 
 
 
127 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0449719  normal  0.223899 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0272  response regulator receiver protein  43.75 
 
 
128 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.820027  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5235  response regulator receiver protein  42.2 
 
 
131 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0801642 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1784  response regulator receiver domain-containing protein  42.72 
 
 
124 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.474362  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0431  response regulator receiver protein  41.75 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0769354  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6449  response regulator receiver protein  43.81 
 
 
121 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4234  response regulator receiver protein  39.82 
 
 
121 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0312747 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1396  response regulator receiver domain-containing protein  38.26 
 
 
117 aa  72  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.230809  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4798  response regulator receiver protein  40.74 
 
 
120 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.107601  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0109  response regulator receiver  39.81 
 
 
120 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2986  response regulator receiver protein  37.29 
 
 
124 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.347118  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0604  response regulator receiver protein  40.59 
 
 
147 aa  67  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3363  response regulator receiver protein  34.17 
 
 
133 aa  67  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.387857 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5270  signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 
559 aa  66.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4846  response regulator receiver protein  41.74 
 
 
126 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211413  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1920  response regulator receiver protein  39.83 
 
 
126 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.170402 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3759  response regulator receiver protein  36.89 
 
 
127 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.514361  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7970  response regulator receiver and SARP domain protein  38.53 
 
 
160 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304155  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5777  response regulator receiver protein  37.62 
 
 
136 aa  64.3  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0732019  hitchhiker  0.00995229 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2241  response regulator receiver protein  39.82 
 
 
126 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.926249 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0773  response regulator receiver  39.68 
 
 
149 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1965  response regulator receiver  39.82 
 
 
126 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.132523  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5238  response regulator receiver protein  37.61 
 
 
127 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.516097  normal  0.262734 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2866  response regulator receiver  38.98 
 
 
124 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0060  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.04 
 
 
384 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3385  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.04 
 
 
384 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0708  response regulator receiver protein  38.37 
 
 
123 aa  62  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.795364  normal  0.880104 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3092  response regulator receiver protein  37.19 
 
 
124 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0555687  normal  0.395265 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1296  response regulator receiver protein  35.65 
 
 
136 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2363  response regulator receiver protein  34.51 
 
 
122 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.549917  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3337  hypothetical protein  36.28 
 
 
130 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244169  normal  0.34569 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4279  response regulator receiver protein  34.82 
 
 
120 aa  58.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718019  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2532  response regulator receiver protein  33.91 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3299  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
123 aa  58.9  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414312 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0470  response regulator receiver protein  33.9 
 
 
133 aa  58.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6265  response regulator receiver protein  33.86 
 
 
136 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1629  response regulator receiver domain-containing protein  34.45 
 
 
129 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324074  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7150  response regulator  38.1 
 
 
146 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6401  response regulator receiver protein  35.71 
 
 
126 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0621  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
120 aa  57  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5004  response regulator receiver protein  32.48 
 
 
118 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.325761  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2023  response regulator receiver protein  37.29 
 
 
159 aa  56.6  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0939204  normal  0.968357 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4933  response regulator receiver protein  33.61 
 
 
121 aa  55.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.124626  normal  0.430513 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6261  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  37.72 
 
 
121 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5600  response regulator receiver protein  34.02 
 
 
124 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0074  response regulator receiver protein  28.45 
 
 
129 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2032  response regulator receiver protein  32.17 
 
 
125 aa  54.3  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5233  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.67 
 
 
384 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.222219 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2937  response regulator receiver protein  32.76 
 
 
129 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.972944  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7958  response regulator receiver protein  31.96 
 
 
124 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1241  signal transduction histidine kinase  36.47 
 
 
631 aa  53.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0246477 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6002  response regulator  36.89 
 
 
136 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.282143 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4155  response regulator receiver domain-containing protein  32.95 
 
 
123 aa  51.6  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.918011  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  30.28 
 
 
846 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4542  PAS sensor protein  31.15 
 
 
1096 aa  52  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220973  normal  0.0899725 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5707  response regulator receiver protein  35.48 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0475  response regulator receiver protein  31.62 
 
 
129 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0286  two-component response regulator  32.54 
 
 
274 aa  51.2  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173395 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5055  signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 
1111 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372822  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5902  response regulator receiver and SARP domain protein  35.06 
 
 
152 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2520  response regulator receiver domain-containing protein  31.9 
 
 
125 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.113297  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2783  response regulator receiver  31.53 
 
 
123 aa  50.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2485  response regulator  33.33 
 
 
125 aa  50.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2183  response regulator receiver protein  29.41 
 
 
134 aa  50.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2323  response regulator receiver protein  33.91 
 
 
121 aa  50.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.03657 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0019  response regulator receiver protein  31.3 
 
 
129 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0611118 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2179  response regulator receiver protein  28.33 
 
 
132 aa  49.7  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.896157  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6000  two-component response regulator  31.2 
 
 
264 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2738  response regulator receiver domain-containing protein  31.19 
 
 
123 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4411  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  29.82 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2091  response regulator receiver protein  28.33 
 
 
132 aa  49.7  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.494931  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5541  response regulator  40.26 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3180  response regulator receiver protein  31.78 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0167969  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6551  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  28.83 
 
 
129 aa  48.9  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3364  response regulator  31.96 
 
 
847 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0022  response regulator receiver and SARP domain protein  31.3 
 
 
142 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000346597  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5346  response regulator receiver protein  34.34 
 
 
118 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2024  two-component response regulator  30.33 
 
 
263 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.363014  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3509  signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 
125 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316868  normal  0.542318 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2394  putative GAF sensor protein  30.93 
 
 
847 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25898  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4303  putative two-component response regulator protein  38.57 
 
 
130 aa  47.4  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3029  two-component response regulator  32.48 
 
 
267 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.268272  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5569  response regulator receiver protein  29.41 
 
 
139 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.097054 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 
602 aa  47  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0783  cyclic nucleotide-binding  27.88 
 
 
376 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0359827  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3239  two-component response regulator  33.06 
 
 
235 aa  47  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2608  response regulator receiver protein  31.53 
 
 
114 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.186263  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2399  response regulator receiver protein  31.25 
 
 
128 aa  47  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0186457 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0052  two-component response regulator  31.3 
 
 
264 aa  47  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.669902 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5585  response regulator receiver protein  32.47 
 
 
124 aa  47  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6064  response regulator receiver domain-containing protein  31.37 
 
 
126 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3207  response regulator receiver protein  37.93 
 
 
117 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.156524  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2658  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.15 
 
 
458 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0089  two-component response regulator  32.8 
 
 
266 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2089  response regulator receiver protein  36.19 
 
 
152 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.775144 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0539  two component response regulator  30.93 
 
 
127 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3026  two-component response regulator  31.86 
 
 
264 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.246349  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>