More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1702 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1702  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  100 
 
 
104 aa  213  8e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145851  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1507  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  54.37 
 
 
104 aa  132  9.999999999999999e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000161459  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  58.51 
 
 
103 aa  130  5e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  48.04 
 
 
104 aa  125  2.0000000000000002e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  51.96 
 
 
104 aa  125  3e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  56.52 
 
 
104 aa  113  7.999999999999999e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1717  thioredoxin  54.46 
 
 
104 aa  113  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1776  thioredoxin  51.49 
 
 
104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000224157  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  45.63 
 
 
105 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A34  Thiol-disulfide isomerase  44.23 
 
 
108 aa  103  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0201899  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  52.87 
 
 
104 aa  101  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  42.72 
 
 
104 aa  97.8  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  44.66 
 
 
104 aa  97.1  7e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  43.69 
 
 
104 aa  95.5  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2350  thioredoxin  52.5 
 
 
104 aa  95.5  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  43.69 
 
 
104 aa  95.5  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  46.43 
 
 
135 aa  91.3  4e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  38 
 
 
102 aa  90.9  5e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  43.43 
 
 
108 aa  90.5  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  45.92 
 
 
108 aa  90.1  8e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  42.16 
 
 
124 aa  89.4  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  40.62 
 
 
106 aa  89.7  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0776  thioredoxin  43.62 
 
 
138 aa  89.4  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.116689 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  39.8 
 
 
110 aa  89.4  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  40.86 
 
 
104 aa  89.4  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  41.94 
 
 
104 aa  89.4  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  41.94 
 
 
104 aa  89.4  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  42.86 
 
 
108 aa  88.6  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0044  thioredoxin  40.82 
 
 
139 aa  89  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  38.54 
 
 
105 aa  89  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0691  thioredoxin  44.21 
 
 
105 aa  88.2  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  47.31 
 
 
105 aa  88.6  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2662  thioredoxin  40.38 
 
 
105 aa  88.6  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.93824e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  47.37 
 
 
115 aa  88.6  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  45.1 
 
 
106 aa  88.2  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3070  thioredoxin  41.84 
 
 
105 aa  87.4  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.990711  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  43.27 
 
 
108 aa  87.4  5e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1851  thioredoxin-related  55.41 
 
 
89 aa  87.8  5e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.378293  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  41.18 
 
 
269 aa  87.4  5e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0988  thioredoxin domain-containing protein  41.18 
 
 
124 aa  87.4  6e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  47.31 
 
 
120 aa  87.4  6e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  42.31 
 
 
109 aa  87  7e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  42.86 
 
 
109 aa  86.7  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  42.86 
 
 
109 aa  86.7  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  42.86 
 
 
109 aa  86.7  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  44.44 
 
 
109 aa  86.7  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0363  thioredoxin  44.44 
 
 
109 aa  86.3  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145924  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0147  thioredoxin 1  42.86 
 
 
108 aa  86.3  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000169587  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  42.16 
 
 
109 aa  86.3  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0711  thioredoxin  42.16 
 
 
138 aa  86.3  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0312  Thioredoxin domain protein  46.91 
 
 
88 aa  85.9  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  45.45 
 
 
109 aa  85.9  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  42.68 
 
 
112 aa  85.9  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  41.3 
 
 
165 aa  85.5  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  40.86 
 
 
104 aa  85.5  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  38.04 
 
 
280 aa  85.5  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  42.68 
 
 
112 aa  85.9  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3391  thioredoxin  40 
 
 
119 aa  85.9  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.522646  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0984  thioredoxin  40 
 
 
110 aa  85.1  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  42.86 
 
 
108 aa  85.5  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  43.43 
 
 
109 aa  85.1  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  42.16 
 
 
109 aa  85.1  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4349  thioredoxin  45.63 
 
 
104 aa  85.1  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.141364  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  42.86 
 
 
108 aa  85.5  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0737  thioredoxin  41.84 
 
 
104 aa  84.7  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0942767  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  42.86 
 
 
108 aa  85.5  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4648  thioredoxin  45.63 
 
 
104 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4417  thioredoxin  45.63 
 
 
104 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4256  thioredoxin  45.63 
 
 
104 aa  84.7  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4268  thioredoxin  45.63 
 
 
104 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  42.86 
 
 
104 aa  84.7  4e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4758  thioredoxin  45.63 
 
 
104 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4649  thioredoxin  45.63 
 
 
104 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0606  thioredoxin  45.63 
 
 
104 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4633  thioredoxin  45.63 
 
 
104 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4629  thioredoxin  45.63 
 
 
104 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0273149  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1412  thioredoxin  38.71 
 
 
104 aa  84.3  5e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39568  thioredoxin  42.86 
 
 
103 aa  84.3  5e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.187057 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1362  thioredoxin  35 
 
 
106 aa  84  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  42.71 
 
 
108 aa  84  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  45 
 
 
107 aa  84  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  42.16 
 
 
107 aa  83.6  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  43.56 
 
 
108 aa  84  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  41.58 
 
 
107 aa  84  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  43 
 
 
108 aa  84  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  46 
 
 
110 aa  83.6  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  37 
 
 
139 aa  83.6  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  40 
 
 
110 aa  83.6  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  45.24 
 
 
116 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  41 
 
 
109 aa  82.8  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  36.45 
 
 
310 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  48.78 
 
 
88 aa  82.8  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  46.24 
 
 
110 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  36 
 
 
133 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2305  thioredoxin  35.92 
 
 
113 aa  83.2  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.0025384  normal  0.350799 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  38.83 
 
 
106 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  40.59 
 
 
108 aa  83.2  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  41.41 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  38.54 
 
 
104 aa  82.8  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  45.16 
 
 
109 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.315208 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>