More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0957 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0957  50S ribosomal protein L21P  100 
 
 
100 aa  198  1.9999999999999998e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000239901  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1326  50S ribosomal protein L21P  65.62 
 
 
99 aa  137  7e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000107304  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1192  50S ribosomal protein L21  66.67 
 
 
102 aa  129  9e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000108547  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  67 
 
 
156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000031212  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  58.59 
 
 
102 aa  120  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0455  50S ribosomal protein L21  60.61 
 
 
104 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000169225  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1180  50S ribosomal protein L21  59.22 
 
 
104 aa  118  3e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00135426  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1370  50S ribosomal protein L21  57.43 
 
 
104 aa  117  7e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000286753  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  55.56 
 
 
102 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  55.56 
 
 
102 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  55.56 
 
 
102 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  55.56 
 
 
102 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  55.56 
 
 
102 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  55.56 
 
 
102 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  55.56 
 
 
102 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  55.56 
 
 
102 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  55.56 
 
 
102 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  53.54 
 
 
102 aa  111  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  53.54 
 
 
102 aa  111  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  53.54 
 
 
102 aa  111  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf326  50S ribosomal protein L21  54.17 
 
 
101 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.858976  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl441  50S ribosomal protein L21  56.25 
 
 
99 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304369  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  57 
 
 
132 aa  107  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020004  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0205  50S ribosomal protein L21  48.96 
 
 
100 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  56 
 
 
103 aa  107  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  51 
 
 
104 aa  107  7.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  56 
 
 
103 aa  106  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  51 
 
 
103 aa  106  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0412  50S ribosomal protein L21  52.08 
 
 
100 aa  105  3e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1452  ribosomal protein L21  52 
 
 
103 aa  105  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000000564167  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  53 
 
 
104 aa  104  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1211  50S ribosomal protein L21  57.58 
 
 
102 aa  103  8e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000816286  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1737  50S ribosomal protein L21  56.57 
 
 
102 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000015429  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1704  50S ribosomal protein L21  56.57 
 
 
102 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000276664  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2228  50S ribosomal protein L21  52.04 
 
 
101 aa  99.8  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  52.53 
 
 
102 aa  100  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  55 
 
 
103 aa  98.2  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  55 
 
 
103 aa  98.2  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  49.5 
 
 
104 aa  98.2  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1281  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 
105 aa  97.8  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00406184  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1320  50S ribosomal protein L21  55 
 
 
103 aa  97.4  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0375246  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  49 
 
 
114 aa  97.1  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  50 
 
 
103 aa  95.9  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 
104 aa  95.9  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  51 
 
 
103 aa  94.4  5e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  46 
 
 
103 aa  94.4  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399206  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0212  50S ribosomal protein L21  46 
 
 
103 aa  94.4  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.237362 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  51.52 
 
 
102 aa  94  6e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  50 
 
 
105 aa  94  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  49.5 
 
 
104 aa  94  6e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000133447  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2246  ribosomal protein L21  48 
 
 
103 aa  93.2  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000579103  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  50.52 
 
 
103 aa  92.8  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  48 
 
 
103 aa  92  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  47.06 
 
 
131 aa  92.4  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4328  50S ribosomal protein L21  56 
 
 
138 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.665904 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  48 
 
 
103 aa  91.7  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  50 
 
 
104 aa  90.5  7e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  46 
 
 
105 aa  90.5  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  51 
 
 
104 aa  90.1  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4193  50S ribosomal protein L21  45 
 
 
105 aa  90.1  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4182  50S ribosomal protein L21  52 
 
 
101 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.190633  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  47.47 
 
 
102 aa  89.4  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0749  ribosomal protein L21  47.96 
 
 
101 aa  90.1  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000000486349  hitchhiker  0.00474582 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  48.48 
 
 
149 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1036  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 
106 aa  88.2  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0850957  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  44.44 
 
 
102 aa  87.8  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  47 
 
 
103 aa  87.8  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  47 
 
 
103 aa  87.8  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  47 
 
 
103 aa  88.2  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  49.49 
 
 
102 aa  87.8  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1336  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 
104 aa  87.4  5e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100172  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2652  50S ribosomal protein L21  48 
 
 
103 aa  87.4  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0214685  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  47 
 
 
103 aa  87.4  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  45 
 
 
103 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4313  50S ribosomal protein L21  51 
 
 
101 aa  87  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4335  50S ribosomal protein L21  51 
 
 
101 aa  87  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  45 
 
 
103 aa  87  7e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  45 
 
 
103 aa  87  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1350  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 
104 aa  87  8e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0226901  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  46.46 
 
 
102 aa  87  8e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0285  50S ribosomal protein L21  44 
 
 
103 aa  87  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.253807  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  44 
 
 
103 aa  87  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3917  ribosomal protein L21  48 
 
 
103 aa  86.7  9e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  47.47 
 
 
102 aa  86.7  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3283  50S ribosomal protein L21  45 
 
 
125 aa  86.3  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  42 
 
 
103 aa  86.3  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  47 
 
 
103 aa  86.3  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  46 
 
 
103 aa  86.3  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  50 
 
 
103 aa  86.3  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3449  50S ribosomal protein L21  47 
 
 
103 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00752607  hitchhiker  0.00404832 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1751  50S ribosomal protein L21  45 
 
 
103 aa  85.5  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000842566  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3005  50S ribosomal protein L21  44 
 
 
124 aa  85.9  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  45.45 
 
 
102 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  46.46 
 
 
102 aa  85.5  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1815  50S ribosomal protein L21  46 
 
 
103 aa  85.5  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0507  50S ribosomal protein L21  47 
 
 
103 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  45 
 
 
103 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1118  50S ribosomal protein L21  48 
 
 
146 aa  85.5  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00565538  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0497  ribosomal protein L21  47.92 
 
 
98 aa  85.5  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3639  50S ribosomal protein L21  44 
 
 
106 aa  85.9  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.211161  normal  0.460303 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>