89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0013 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0013  signal protein  100 
 
 
685 aa  1387    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1967  signal protein  43.09 
 
 
675 aa  572  1.0000000000000001e-162  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.764897  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0010  phosphoesterase domain-containing protein  43.25 
 
 
672 aa  556  1e-157  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0144039  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0011  signal protein  39.91 
 
 
672 aa  516  1.0000000000000001e-145  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00560638  hitchhiker  0.0000000733083 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3413  diguanylate cyclase and phosphoesterase  39.55 
 
 
658 aa  451  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5597  DHH subfamily 1 protein  38.34 
 
 
657 aa  442  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0188603  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5338  DHH subfamily 1 protein  38.19 
 
 
657 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00027618  hitchhiker  0.000000025759 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5621  DHH subfamily 1 protein  37.74 
 
 
657 aa  436  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000144841  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3542  diguanylate cyclase and phosphoesterase  40.52 
 
 
658 aa  438  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4010  diguanylate cyclase and phosphoesterase  37.95 
 
 
657 aa  438  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.874769  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5658  DHH subfamily 1 protein  37.74 
 
 
657 aa  436  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000148947  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5263  diguanylate cyclase and phosphoesterase  37.74 
 
 
657 aa  432  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129533  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5719  DHH subfamily 1 protein  38.55 
 
 
657 aa  436  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5580  DHH subfamily 1 protein  38.55 
 
 
657 aa  436  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33995e-19 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5167  DHH family phosphoesterase  38.55 
 
 
657 aa  436  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5151  DHH family phosphoesterase  38.55 
 
 
657 aa  436  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00172819  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5323  DHH subfamily 1 protein  38.55 
 
 
657 aa  436  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2539  DHH family protein  35.55 
 
 
655 aa  434  1e-120  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0014  phosphoesterase domain-containing protein  35.9 
 
 
655 aa  432  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0014  hypothetical protein  35.9 
 
 
655 aa  432  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0080  phosphoesterase RecJ domain protein  34.46 
 
 
667 aa  352  2e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.609068  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1977  signal protein  32.46 
 
 
654 aa  347  5e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.152853  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2141  DHH family protein  32.07 
 
 
660 aa  333  8e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.195838  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2258  phosphoesterase, RecJ-like protein  34.46 
 
 
669 aa  330  7e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0125063  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0788  signal protein  32.88 
 
 
654 aa  328  3e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0653759  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0880  phosphoesterase RecJ domain protein  31.39 
 
 
667 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.631011  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0533  phosphoesterase RecJ domain protein  29.45 
 
 
669 aa  289  1e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3758  phosphoesterase domain-containing protein  29.7 
 
 
684 aa  269  1e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2651  DHH family protein  31.46 
 
 
652 aa  264  4.999999999999999e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0151664  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2973  DHH family protein  31.46 
 
 
652 aa  263  6e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf692  hypothetical protein  26.14 
 
 
653 aa  184  5.0000000000000004e-45  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1197  phosphoesterase domain-containing protein  29.23 
 
 
333 aa  72.4  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0177078  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1258  phosphoesterase domain-containing protein  28.75 
 
 
333 aa  66.2  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1106  phosphoesterase RecJ domain protein  31.43 
 
 
513 aa  64.7  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0318  phosphoesterase RecJ domain protein  23.82 
 
 
344 aa  62.8  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1429  phosphoesterase domain-containing protein  26.43 
 
 
338 aa  62.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0902  phosphoesterase, RecJ-like protein  27.52 
 
 
320 aa  63.2  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0709  phosphoesterase domain-containing protein  25.22 
 
 
338 aa  58.5  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1246  phosphoesterase domain-containing protein  24.93 
 
 
335 aa  58.2  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.631714  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3244  phosphoesterase RecJ domain protein  30.35 
 
 
516 aa  57  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  27.06 
 
 
873 aa  57  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3570  phosphoesterase RecJ domain protein  26.27 
 
 
330 aa  57  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.672109  normal  0.13788 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0643  phosphoesterase domain-containing protein  24.58 
 
 
351 aa  56.2  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0245262  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0187  phosphoesterase RecJ domain protein  26.84 
 
 
391 aa  55.5  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0675  phosphoesterase domain-containing protein  25.86 
 
 
331 aa  53.9  0.000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000812168 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1972  CBS  27.35 
 
 
898 aa  53.9  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.03578  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  27.35 
 
 
888 aa  53.5  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1492  phosphoesterase RecJ domain protein  28.78 
 
 
330 aa  53.5  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.136328  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1345  phosphoesterase RecJ domain protein  28.48 
 
 
393 aa  53.9  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1881  TrkA-N  25.07 
 
 
498 aa  52.8  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0422  phosphoesterase RecJ domain protein  26.09 
 
 
341 aa  52.8  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.788368  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1091  DHH subfamily 1 protein  25.71 
 
 
331 aa  53.1  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.302124 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1458  Polynucleotide adenylyltransferase region  27.5 
 
 
892 aa  52  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.402567  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1654  CBS domain containing protein  23.15 
 
 
890 aa  52.4  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.873652 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1433  polynucleotide adenylyltransferase region  23.3 
 
 
904 aa  51.6  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.743333  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0146  phosphoesterase RecJ domain protein  25.51 
 
 
474 aa  51.2  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00331466 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1856  phosphoesterase RecJ domain protein  25.22 
 
 
335 aa  51.2  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.766478  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1582  phosphoesterase RecJ domain protein  23.56 
 
 
339 aa  49.7  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000783458  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4214  phosphoesterase, RecJ-like  26.39 
 
 
318 aa  49.7  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0130006 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1231  phosphoesterase domain-containing protein  26.13 
 
 
326 aa  49.3  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1441  Polynucleotide adenylyltransferase region  28.21 
 
 
821 aa  48.9  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000556215  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2163  phosphoesterase RecJ domain protein  27.89 
 
 
496 aa  49.3  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.790144 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1257  phosphoesterase domain-containing protein  28.57 
 
 
334 aa  48.9  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1412  phosphoesterase RecJ domain protein  27.42 
 
 
353 aa  48.5  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.595012  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  22.31 
 
 
769 aa  48.5  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  23.55 
 
 
907 aa  48.5  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0419  phosphoesterase, DHH family protein  27.8 
 
 
339 aa  48.5  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1479  DHH superfamily protein, subfamily 1  24.93 
 
 
333 aa  48.1  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0953  DHH family protein  27.27 
 
 
355 aa  47.8  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0998  phosphoesterase RecJ domain protein  26.7 
 
 
358 aa  47.4  0.0009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3186  phosphoesterase RecJ domain protein  23.2 
 
 
326 aa  47.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.500315  normal  0.376889 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1538  phosphoesterase domain-containing protein  26.64 
 
 
354 aa  47  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.490087  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1288  TrkA domain-containing protein  25.33 
 
 
486 aa  46.6  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.444539 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1290  phosphoesterase, RecJ-like protein  23.19 
 
 
335 aa  47  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2772  phosphoesterase domain-containing protein  25.93 
 
 
324 aa  46.6  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2844  phosphoesterase RecJ domain protein  29.13 
 
 
547 aa  46.6  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.061718  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0324  phosphoesterase RecJ domain protein  29.15 
 
 
478 aa  46.6  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.988829  normal  0.0678816 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3049  phosphoesterase RecJ domain protein  28.29 
 
 
389 aa  46.2  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.1164 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2847  polynucleotide adenylyltransferase region  28.17 
 
 
874 aa  46.2  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0983  phosphoesterase RecJ domain protein  23.77 
 
 
314 aa  46.2  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1197  phosphoesterase RecJ domain protein  24.51 
 
 
396 aa  45.4  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0927845  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  25.82 
 
 
907 aa  45.4  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1388  TrkA domain-containing protein  25.33 
 
 
486 aa  45.8  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1715  phosphoesterase domain-containing protein  25.71 
 
 
317 aa  44.7  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0539  phosphoesterase RecJ domain protein  22.47 
 
 
336 aa  44.3  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000146173 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0236  DHH domain-containing protein  28.1 
 
 
311 aa  44.3  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.281177  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1711  phosphoesterase RecJ domain protein  26.76 
 
 
366 aa  44.3  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.041209  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1346  cyclic nucleotide-binding protein  25.82 
 
 
902 aa  43.9  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.761753 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1184  Polynucleotide adenylyltransferase region  25.59 
 
 
905 aa  43.9  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>