57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0005 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0005  hypothetical protein  100 
 
 
300 aa  603  1e-171  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0643796  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2226  hypothetical protein  26.58 
 
 
168 aa  80.5  3e-14  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.16141e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0004  protein of unknown function DUF721  24 
 
 
286 aa  72  1e-11  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000131484  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0638  hypothetical protein  31.09 
 
 
159 aa  70.9  2e-11  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.128267  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3498  protein of unknown function DUF721  29.91 
 
 
153 aa  67.8  2e-10  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.68574e-33 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1102  hypothetical protein  28.68 
 
 
155 aa  66.6  5e-10  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  5.65832e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  28.69 
 
 
151 aa  66.2  6e-10  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2875  hypothetical protein  31.93 
 
 
162 aa  65.9  8e-10  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0140441  hitchhiker  1.88483e-05 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3768  hypothetical protein  27.63 
 
 
152 aa  64.3  2e-09  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00373156  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1621  hypothetical protein  24.75 
 
 
287 aa  64.3  2e-09  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.238182 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0004  protein of unknown function DUF721  31.82 
 
 
105 aa  57.8  2e-07  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0005  protein of unknown function DUF721  26.6 
 
 
173 aa  58.2  2e-07  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  34.78 
 
 
266 aa  55.5  1e-06  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.221602  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0005  protein of unknown function DUF721  25.26 
 
 
185 aa  54.3  2e-06  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.06889e-13 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  30.14 
 
 
196 aa  53.9  3e-06  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0095  Zn-ribbon-containing protein  37.68 
 
 
101 aa  54.3  3e-06  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142092  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  30.86 
 
 
187 aa  53.9  3e-06  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0095  hypothetical protein  36.23 
 
 
101 aa  53.5  4e-06  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.437017  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0005  hypothetical protein  24 
 
 
183 aa  53.1  5e-06  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0232127  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2009  hypothetical protein  34.67 
 
 
97 aa  53.1  5e-06  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0005  protein of unknown function DUF721  23.96 
 
 
217 aa  52.4  8e-06  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382214 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  27.37 
 
 
196 aa  52  1e-05  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0005  hypothetical protein  25.26 
 
 
185 aa  51.6  1e-05  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342856  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1548  protein of unknown function DUF721  35.29 
 
 
160 aa  51.6  2e-05  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0658767  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0004  hypothetical protein  37.33 
 
 
102 aa  50.8  2e-05  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.301106  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0005  protein of unknown function DUF721  28.57 
 
 
166 aa  50.8  2e-05  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0164  hypothetical protein  30.68 
 
 
185 aa  51.2  2e-05  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0544  hypothetical protein  32.81 
 
 
86 aa  50.4  3e-05  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  1.77054e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0004  hypothetical protein  38.24 
 
 
97 aa  50.8  3e-05  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1572  protein of unknown function DUF721  22.15 
 
 
194 aa  50.1  4e-05  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0005  protein of unknown function DUF721  23.81 
 
 
179 aa  50.1  4e-05  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1595  protein of unknown function DUF721  22.15 
 
 
194 aa  50.1  4e-05  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.215209 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0005  hypothetical protein  25.35 
 
 
188 aa  50.4  4e-05  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0006  Zn-ribbon-containing possibly RNA-binding protein and truncated derivatives-like protein  23.17 
 
 
206 aa  49.3  8e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0005  hypothetical protein  28.74 
 
 
190 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0005  hypothetical protein  28.74 
 
 
190 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.935209  normal  0.0649143 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0013  hypothetical protein  28.74 
 
 
190 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0004  hypothetical protein  32 
 
 
97 aa  47.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.52078  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2673  protein of unknown function DUF721  27.35 
 
 
151 aa  48.1  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.212988  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1258  hypothetical protein  25 
 
 
169 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0005  protein of unknown function DUF721  25.24 
 
 
171 aa  48.1  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0003  hypothetical protein  34.67 
 
 
97 aa  47  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.179596  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0004  hypothetical protein  34.67 
 
 
96 aa  47.4  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.132864 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0823  hypothetical protein  27.27 
 
 
188 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3330  hypothetical protein  22.83 
 
 
149 aa  46.6  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0005  hypothetical protein  27.63 
 
 
185 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731239  normal  0.310544 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3502  protein of unknown function DUF721  21.54 
 
 
170 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.428989 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0008  protein of unknown function DUF721  26.58 
 
 
180 aa  44.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0005  protein of unknown function DUF721  31.58 
 
 
172 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.799003 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0535  protein of unknown function DUF721  31.94 
 
 
96 aa  43.9  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.864734  hitchhiker  1.14959e-08 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0005  hypothetical protein  24.42 
 
 
273 aa  43.9  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0987513  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0005  hypothetical protein  22.35 
 
 
173 aa  43.5  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0499719  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10004  hypothetical protein  22.47 
 
 
187 aa  43.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2445  hypothetical protein  28.93 
 
 
156 aa  42.7  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  4.8803e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0005  hypothetical protein  26.92 
 
 
134 aa  43.1  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  0.25905 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0005  hypothetical protein  21.7 
 
 
177 aa  42.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0005  protein of unknown function DUF721  20.73 
 
 
188 aa  42.4  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>