147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4531 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4531  putative helicase protein  100 
 
 		 726 aa  1433    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3388  hypothetical protein  49.25 
 
 		 706 aa  561  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.667328 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5784  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  47.49 
 
 		 691 aa  549  1e-155  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3630  hypothetical protein  48.97 
 
 		 705 aa  551  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000100418 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09430  DNA/RNA helicase, superfamily I  45.09 
 
 		 705 aa  511  1e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.260549 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4104  AAA ATPase  42.05 
 
 		 799 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133628  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7542  hypothetical protein  43.25 
 
 		 761 aa  459  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.322202 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05760  DNA/RNA helicase, superfamily I  43.02 
 
 		 755 aa  458  1e-127  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.594948 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1059  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.3 
 
 		 732 aa  339  9.999999999999999e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.394879  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1438  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  38.43 
 
 		 767 aa  320  5e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0481652  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7576  hypothetical protein  37.59 
 
 		 795 aa  318  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3607  ATP-dependent DNA helicase  37.29 
 
 		 759 aa  315  2.9999999999999996e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1510  ATP-dependent DNA helicase  33.81 
 
 		 742 aa  314  2.9999999999999996e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14320  DNA/RNA helicase, superfamily I  37.5 
 
 		 758 aa  313  4.999999999999999e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00598075  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16000  DNA/RNA helicase, superfamily I  36.46 
 
 		 813 aa  312  1e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22980  DNA/RNA helicase, superfamily I  36.3 
 
 		 741 aa  311  2e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51647  normal  0.435822 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1511  ATP-dependent DNA helicase  35.07 
 
 		 742 aa  308  3e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0576  DNA or RNA helicase, Superfamily I family protein  33.46 
 
 		 758 aa  308  3e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0841204 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5818  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.93 
 
 		 766 aa  307  5.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.814611 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2150  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.76 
 
 		 746 aa  304  5.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1262  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.52 
 
 		 757 aa  303  1e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5583  putative helicase  35.43 
 
 		 874 aa  299  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0952  putative helicase  33.54 
 
 		 829 aa  298  3e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5052  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.89 
 
 		 733 aa  296  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.540758  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2428  ATP-dependent DNA helicase  36.38 
 
 		 726 aa  295  2e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523427  normal  0.292743 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0171  superfamily I DNA and RNA helicase  32.83 
 
 		 759 aa  294  4e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2598  putative helicase  34.55 
 
 		 734 aa  291  3e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75582 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1311  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.77 
 
 		 748 aa  291  3e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0032  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.84 
 
 		 786 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1552  hypothetical protein  36.17 
 
 		 754 aa  281  4e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457555  normal  0.0469841 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4508  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.03 
 
 		 693 aa  279  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0108  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.36 
 
 		 804 aa  277  4e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5266  putative helicase  36.2 
 
 		 724 aa  278  4e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5355  putative helicase  36.2 
 
 		 724 aa  278  4e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5645  putative helicase  35.94 
 
 		 724 aa  274  3e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1592  hypothetical protein  35.89 
 
 		 776 aa  275  3e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.430325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3796  putative helicase  33.72 
 
 		 735 aa  269  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2857  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.53 
 
 		 788 aa  265  3e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2425  hypothetical protein  33.83 
 
 		 771 aa  255  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1575  UvrD/REP helicase  38.18 
 
 		 750 aa  245  3e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0191582 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1829  ATP-dependent DNA helicase  33.2 
 
 		 706 aa  243  7e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0962  hypothetical protein  33.51 
 
 		 703 aa  238  4e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916066  normal  0.251911 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3297  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.09 
 
 		 659 aa  236  8e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925836 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4482  hypothetical protein  31.96 
 
 		 680 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8908  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.14 
 
 		 672 aa  234  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10650  DNA/RNA helicase, superfamily I  47.04 
 
 		 747 aa  232  2e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.85506  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1826  superfamily I DNA and RNA helicase  32.93 
 
 		 716 aa  232  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200376  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3495  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  31.24 
 
 		 728 aa  229  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.471615  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1224  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  31.89 
 
 		 645 aa  227  6e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0765  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  50.32 
 
 		 832 aa  224  4e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.360581  normal  0.192195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5043  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.19 
 
 		 685 aa  224  4e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4871  hypothetical protein  33.08 
 
 		 666 aa  224  6e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4077  hypothetical protein  32.09 
 
 		 695 aa  223  7e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0451671 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5180  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  30.85 
 
 		 715 aa  223  7e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292486 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0489  hypothetical protein  31.31 
 
 		 692 aa  221  3e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0388236 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3352  superfamily I DNA and RNA helicase  30.48 
 
 		 715 aa  220  7e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0457  superfamily I DNA and RNA helicase  32.1 
 
 		 710 aa  219  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4154  superfamily I DNA and RNA helicase  31.14 
 
 		 742 aa  219  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4146  putative ATP-dependent DNA helicase  33.2 
 
 		 717 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0213  superfamily I DNA and RNA helicases  32.72 
 
 		 717 aa  216  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3817  hypothetical protein  47.88 
 
 		 765 aa  216  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21750  DNA/RNA helicase, superfamily I  31.91 
 
 		 695 aa  212  2e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4092  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  31.74 
 
 		 670 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.445905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2903  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.02 
 
 		 732 aa  206  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0195315  hitchhiker  0.0000337224 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2679  Superfamily I DNA and RNA helicase  29.52 
 
 		 1048 aa  206  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.357877  normal  0.0252741 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4189  hypothetical protein  39.68 
 
 		 902 aa  205  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.060673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2447  putative ATP-dependent DNA helicase  32.02 
 
 		 792 aa  200  9e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.250058  normal  0.190451 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8108  ATP-dependent DNA helicase  30.36 
 
 		 719 aa  191  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24030  DNA/RNA helicase, superfamily I  30.15 
 
 		 710 aa  189  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2547  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  27.9 
 
 		 861 aa  188  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0101417  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2397  putative ATP/GTP binding protein  29.95 
 
 		 727 aa  182  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115029  normal  0.0547233 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0164  ATP-dependent DNA helicase  31.26 
 
 		 684 aa  173  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.532739 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2694  hypothetical protein  32.64 
 
 		 679 aa  167  8e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1900  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  39.94 
 
 		 724 aa  160  8e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13570  DNA/RNA helicase, superfamily I  37.62 
 
 		 764 aa  148  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.176836 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2623  uvrD/Rep helicase family protein  22.58 
 
 		 689 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000508135  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  22.58 
 
 		 689 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2821  uvrD/Rep helicase family protein  22.52 
 
 		 689 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000164243 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  22.87 
 
 		 689 aa  128  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000078955  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2823  UvrD/Rep helicase family protein  22.89 
 
 		 691 aa  127  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271387  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  22.94 
 
 		 689 aa  127  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0566  helicase, putative  35.38 
 
 		 706 aa  125  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.712813  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0580  putative helicase  35.38 
 
 		 706 aa  125  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.937698  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1050  hypothetical protein  34.56 
 
 		 702 aa  117  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  22.43 
 
 		 691 aa  115  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4227  helicase, UvrD/Rep family  34.72 
 
 		 778 aa  115  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00019989  hitchhiker  0.000557099 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0961  ATP-dependent DNA helicase replicase  33.8 
 
 		 776 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0951  ATP-dependent DNA helicase replicase  33.8 
 
 		 777 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1206  helicase, UvrD/Rep family  33.8 
 
 		 777 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0973  UvrD/Rep family helicase  33.8 
 
 		 776 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0083  hypothetical protein  34.01 
 
 		 785 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1040  UvrD/Rep family helicase  33.8 
 
 		 776 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0956  UvrD/REP helicase  33.8 
 
 		 778 aa  113  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161891  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1118  helicase, UvrD/Rep family  33.8 
 
 		 776 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0603205 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0895  superfamily I DNA helicase  32.07 
 
 		 755 aa  110  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.531504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1075  helicase, UvrD/Rep family  33.33 
 
 		 777 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0201  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  33.51 
 
 		 772 aa  109  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2835  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.56 
 
 		 716 aa  110  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2615  UvrD/Rep helicase family protein  33.85 
 
 		 691 aa  109  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000204354  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0875  hypothetical protein  36.8 
 
 		 712 aa  109  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>