208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4476 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4476  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  100 
 
 		 376 aa  745    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0890  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  60.4 
 
 		 357 aa  427  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.712139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0613  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  33.81 
 
 		 383 aa  155  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5609  hypothetical protein  32.94 
 
 		 400 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675144  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5973  hypothetical protein  32.94 
 
 		 400 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0578676  hitchhiker  0.00100227 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3412  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  33.64 
 
 		 381 aa  123  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0456561 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2118  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  29.13 
 
 		 383 aa  116  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4575  hypothetical protein  35.69 
 
 		 326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.116237 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5460  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  27.54 
 
 		 424 aa  107  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.528765  normal  0.198358 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1544  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  29.55 
 
 		 448 aa  103  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000180144  normal  0.131474 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1547  hypothetical protein  27.09 
 
 		 384 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.26317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6210  Acetyl xylan esterase  25.7 
 
 		 402 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2113  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  30.26 
 
 		 474 aa  100  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0478  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  29.41 
 
 		 388 aa  97.8  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1530  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  30.59 
 
 		 463 aa  97.4  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2389  hypothetical protein  31.06 
 
 		 390 aa  97.1  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0906  hypothetical protein  29.36 
 
 		 385 aa  95.5  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60282  normal  0.197591 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1933  hypothetical protein  30.86 
 
 		 385 aa  92  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0714  hypothetical protein  29.82 
 
 		 385 aa  91.3  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0856  hypothetical protein  27.79 
 
 		 386 aa  90.9  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1005  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  33.78 
 
 		 434 aa  91.3  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3425  hypothetical protein  31.18 
 
 		 387 aa  89.7  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.4734  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5486  hypothetical protein  27.78 
 
 		 390 aa  88.6  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.416451  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3195  hypothetical protein  31.46 
 
 		 420 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1866  fermentation/respiration switch protein  27.27 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000738572  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0976  fermentation/respiration switch protein  26.79 
 
 		 413 aa  83.2  0.000000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  26.95 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5182  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  37.65 
 
 		 423 aa  82  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4831  hypothetical protein  27.84 
 
 		 386 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.857401  normal  0.718277 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3150  hypothetical protein  25.84 
 
 		 386 aa  80.1  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0967  alpha/beta fold family hydrolase  23.47 
 
 		 388 aa  77.8  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3159  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  32.18 
 
 		 420 aa  77  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1228  hypothetical protein  28.93 
 
 		 403 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.395886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2955  fermentation/respiration switch protein  24.83 
 
 		 419 aa  75.9  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.283852  normal  0.148271 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4695  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase related protein  31.43 
 
 		 406 aa  75.9  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00234  fermentation/respiration switch protein  25.08 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3368  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  25.08 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00237  hypothetical protein  25.08 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3342  fermentation/respiration switch protein  25.08 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0293  fermentation/respiration switch protein  25.08 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0072363 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004270  hypothetical protein  23.21 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291288  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0266  fermentation/respiration switch protein  26.17 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0284  fermentation/respiration switch protein  25.08 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.117184  normal  0.397141 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0236  fermentation/respiration switch protein  25.84 
 
 		 414 aa  72.8  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2676  hypothetical protein  30.07 
 
 		 401 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1811  hypothetical protein  30.8 
 
 		 399 aa  72.4  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.369907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01160  fermentation/respiration switch protein  23.5 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0271  fermentation/respiration switch protein  25.84 
 
 		 414 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1853  hypothetical protein  31.86 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0765  fermentation/respiration switch protein  25.39 
 
 		 414 aa  70.1  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4482  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like  28.77 
 
 		 358 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3290  fermentation/respiration switch protein  24.21 
 
 		 415 aa  66.2  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3303  fermentation/respiration switch protein  24.21 
 
 		 415 aa  66.2  0.0000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000661178  hitchhiker  0.000575901 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3152  fermentation/respiration switch protein  24.21 
 
 		 415 aa  66.2  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0736  hypothetical protein  25.38 
 
 		 396 aa  63.9  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.59 
 
 		 406 aa  63.5  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.351879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2308  hypothetical protein  30.14 
 
 		 399 aa  62.8  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.14665  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  23.9 
 
 		 255 aa  62.4  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0357  fermentation/respiration switch protein  24.83 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0359  fermentation/respiration switch protein  24.83 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000175577 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28910  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  31.39 
 
 		 719 aa  61.6  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.487032  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0348  fermentation/respiration switch protein  24.83 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3940  hypothetical protein  24.28 
 
 		 418 aa  61.6  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000344769  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0367  fermentation/respiration switch protein  24.3 
 
 		 414 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0352  fermentation/respiration switch protein  24.3 
 
 		 414 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6547  alpha/beta hydrolase BEM46  30.22 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4716  hypothetical protein  26.34 
 
 		 406 aa  61.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1275  alpha/beta fold family hydrolase  24.68 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3838  hypothetical protein  26.89 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00401866  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2038  peptidase S15  36.36 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907978  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0716  hypothetical protein  25.1 
 
 		 396 aa  60.1  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  23.17 
 
 		 261 aa  58.9  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2957  hypothetical protein  28.29 
 
 		 418 aa  59.3  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.85194  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2563  hypothetical protein  36.59 
 
 		 148 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3924  hypothetical protein  26.47 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0127899  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3950  hypothetical protein  26.47 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.992848 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  26.46 
 
 		 259 aa  56.2  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2193  hypothetical protein  24.07 
 
 		 674 aa  55.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.189847 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1823  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.59 
 
 		 633 aa  55.1  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.272231  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0081  hydrolase, alpha/beta fold family  25.68 
 
 		 286 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  27.92 
 
 		 326 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0031  alpha/beta fold family hydrolase  25.68 
 
 		 286 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1592  peptidase S15  38.69 
 
 		 580 aa  53.5  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000232254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1503  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.21 
 
 		 682 aa  53.5  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0395  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.57 
 
 		 617 aa  53.5  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1497  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.21 
 
 		 682 aa  53.1  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2848  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.21 
 
 		 682 aa  53.1  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000237688 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1533  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.21 
 
 		 682 aa  53.1  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09171  conidial pigment biosynthesis protein Ayg1 (AFU_orthologue; AFUA_2G17550)  23.23 
 
 		 300 aa  52.4  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1417  peptidase S15  35.83 
 
 		 321 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  37.33 
 
 		 467 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2193  hypothetical protein  21.32 
 
 		 402 aa  51.6  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3344  hypothetical protein  27.62 
 
 		 296 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00702344 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2656  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28 
 
 		 677 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1149  Acylaminoacyl-peptidase  30.18 
 
 		 618 aa  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0889139 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2165  hypothetical protein  22.78 
 
 		 402 aa  51.2  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2249  peptidase S15  35.04 
 
 		 474 aa  51.2  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000310265  normal  0.111012 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  26.29 
 
 		 415 aa  50.8  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1252  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  30.18 
 
 		 294 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696042  normal  0.518884 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  21.48 
 
 		 254 aa  51.2  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>