157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4072 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4072  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  284  2e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6630  hypothetical protein  58.04 
 
 		 120 aa  123  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0233518  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  38.71 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  36.51 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  43 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  38.79 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  39.33 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  40.32 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  36.75 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  39.37 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  33.58 
 
 		 152 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  32.35 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  35.63 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3311  hypothetical protein  40.21 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0616  hypothetical protein  36.17 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  34.48 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  31.71 
 
 		 321 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  34.11 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  32.52 
 
 		 319 aa  67  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  34.88 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  29.41 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  32.82 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  31.25 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  31.25 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  31.25 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  31.25 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  31.25 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  31.25 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  37.96 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0549  hypothetical protein  30.65 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  41.86 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  33.58 
 
 		 550 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  33.58 
 
 		 550 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5096  hypothetical protein  37.61 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  30.08 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  35.94 
 
 		 550 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2094  hypothetical protein  35.63 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3318  hypothetical protein  32.26 
 
 		 312 aa  60.5  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206651 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  36.23 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0155  hypothetical protein  33.06 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  30.08 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  34.75 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  33.88 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  37.74 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  26.98 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  30.08 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  34.02 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  30.08 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  29.31 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0885  protein of unknown function DUF35  38.66 
 
 		 333 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2745  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  33.62 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  32.95 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2363  hypothetical protein  34.38 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2106  hypothetical protein  34.86 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.283808  normal  0.0319762 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3568  hypothetical protein  34.86 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  31.45 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0905  hypothetical protein  33.72 
 
 		 135 aa  57  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00718711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4566  putative thiolase subunit  32.58 
 
 		 132 aa  57  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00449482  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2662  hypothetical protein  32.81 
 
 		 136 aa  57  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5281  hypothetical protein  35 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  32.2 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1392  hypothetical protein  32.06 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0060  protein of unknown function DUF35  32.94 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4412  hypothetical protein  32.06 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000585754  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4674  hypothetical protein  33.08 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4760  hypothetical protein  33.08 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  37.04 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4020  hypothetical protein  34.45 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.909625 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0317  protein of unknown function DUF35  26.45 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  29.85 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4017  hypothetical protein  30 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5059  hypothetical protein  33.08 
 
 		 317 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.945383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  31.67 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  32.5 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  30.47 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  33.72 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3652  hypothetical protein  34.09 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2508  protein of unknown function DUF35  30.16 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.347955  normal  0.395372 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4153  hypothetical protein  33.08 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280027  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0149  hypothetical protein  31.15 
 
 		 129 aa  53.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0351  hypothetical protein  35.23 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000546433  hitchhiker  0.00000644081 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  33.33 
 
 		 548 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1609  protein of unknown function DUF35  31.25 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13575  hypothetical protein  32.76 
 
 		 311 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328171 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  37.5 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2360  hypothetical protein  35.43 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.116484 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  32.95 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  33.33 
 
 		 548 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2623  hypothetical protein  34.91 
 
 		 305 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140164  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0178  hypothetical protein  38.32 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2675  hypothetical protein  37.11 
 
 		 417 aa  51.6  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1511  hypothetical protein  32.31 
 
 		 317 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1934  hypothetical protein  26.4 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0108502  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  32.79 
 
 		 311 aa  51.6  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3973  hypothetical protein  42.17 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.370228 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  33.07 
 
 		 541 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.51495 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>