More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_3070 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_3070  PfkB family of carbohydrate kinase  100 
 
 		 305 aa  624  1e-178  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1796  PfkB  47.08 
 
 		 293 aa  270  2e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000052274  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0095  PfkB domain protein  45.27 
 
 		 294 aa  268  8.999999999999999e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2609  PfkB  43.2 
 
 		 311 aa  230  2e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2911  PfkB domain protein  45.15 
 
 		 320 aa  228  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2268  PfkB  41.14 
 
 		 296 aa  206  3e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.985563  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0033  PfkB domain protein  41 
 
 		 294 aa  202  5e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.49998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1266  PfkB domain protein  39.26 
 
 		 303 aa  183  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.341209 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1550  carbohydrate kinase, PfkB family  39.26 
 
 		 303 aa  183  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0649  ribokinase-like domain-containing protein  37.54 
 
 		 308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0225975  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4043  ribokinase-like domain-containing protein  32.85 
 
 		 303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1904  ribokinase-like domain-containing protein  33.7 
 
 		 306 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0842808  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1600  PfkB domain protein  33.9 
 
 		 305 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2522  putative fructokinase  33.11 
 
 		 300 aa  135  9e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000987488  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0367  ribokinase-like domain-containing protein  30.56 
 
 		 296 aa  132  6e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000567214 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3273  ribokinase-like domain-containing protein  36.46 
 
 		 320 aa  128  9.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.225179  normal  0.109197 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0562  PfkB domain protein  32.38 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3763  PfkB domain protein  29.08 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00234329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3183  PfkB domain protein  32.88 
 
 		 297 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.208459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1054  ribokinase family sugar kinase  32.18 
 
 		 300 aa  127  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553217  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0462  kinase, PfkB family  31.74 
 
 		 300 aa  125  7e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2838  fructokinase  33.79 
 
 		 324 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.050359  normal  0.34699 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0221  PfkB domain protein  28.62 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.349538  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0205  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.2 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1998  PfkB domain protein  33.11 
 
 		 312 aa  122  8e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0018  PfkB domain protein  25.86 
 
 		 300 aa  108  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4230  PfkB domain protein  33.97 
 
 		 302 aa  105  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  31.08 
 
 		 333 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  30.46 
 
 		 333 aa  95.9  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  30.48 
 
 		 314 aa  94  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  30.16 
 
 		 323 aa  93.6  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  29.62 
 
 		 325 aa  87.8  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  29.75 
 
 		 323 aa  87  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  30.82 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  28.29 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  28.47 
 
 		 307 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  28.2 
 
 		 311 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  29.21 
 
 		 324 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2734  PfkB  27.13 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.228263  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  29.08 
 
 		 311 aa  82  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  27.36 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18191  putative carbohydrate kinase  26.9 
 
 		 332 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  32.69 
 
 		 317 aa  80.1  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  27.11 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0025  ribokinase-like domain-containing protein  26.75 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.112625  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18161  putative carbohydrate kinase  25.39 
 
 		 332 aa  79  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.409365  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  28.28 
 
 		 307 aa  79  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  30.92 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18371  putative carbohydrate kinase  25.62 
 
 		 332 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.455738  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  30.86 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  29.93 
 
 		 327 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2569  ribokinase-like domain-containing protein  30.8 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  30.48 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  27.56 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  30.48 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  29.92 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  27.91 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  30.48 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  28.43 
 
 		 337 aa  77.4  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  30.94 
 
 		 327 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  25.82 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1030  PfkB domain protein  29.06 
 
 		 329 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185699  normal  0.340834 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  30.37 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  26.4 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  26.4 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  29.52 
 
 		 330 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  29.92 
 
 		 316 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  29.04 
 
 		 323 aa  75.5  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0116  fructokinase  28.41 
 
 		 324 aa  75.1  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.393597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  29.89 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  24.55 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  25.7 
 
 		 338 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  24.55 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  30.04 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1204  putative carbohydrate kinase  26.8 
 
 		 338 aa  72.8  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  30.48 
 
 		 340 aa  72.4  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  27.44 
 
 		 317 aa  72.4  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1720  putative carbohydrate kinase  26.33 
 
 		 332 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.259189  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  27.48 
 
 		 329 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17531  putative carbohydrate kinase  26.93 
 
 		 338 aa  71.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3485  PfkB domain protein  27.22 
 
 		 347 aa  71.2  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  29.96 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  27.33 
 
 		 322 aa  70.9  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  29.43 
 
 		 328 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4018  PfkB domain protein  23.62 
 
 		 338 aa  70.1  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00301504  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  27.42 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4203  aminoimidazole riboside kinase  27.97 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1170  PfkB domain-containing protein  26.05 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0154398  normal  0.362053 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  27.41 
 
 		 329 aa  69.3  0.00000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  25.89 
 
 		 326 aa  69.3  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  27.88 
 
 		 329 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  28.03 
 
 		 329 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0144  putative fructokinase  29.89 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  31.11 
 
 		 315 aa  68.9  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20791  putative carbohydrate kinase  26.46 
 
 		 338 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2333  iolC protein  25.18 
 
 		 332 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2296  myo-inositol catabolism protein  25.18 
 
 		 332 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.192741  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1118  PfkB domain protein  29.75 
 
 		 316 aa  68.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59245  normal  0.875512 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  28.03 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  28.03 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>