277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0781 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  100 
 
 
412 aa  838    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0180  allantoate amidohydrolase  63.9 
 
 
429 aa  546  1e-154  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0027  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  64.13 
 
 
413 aa  535  1e-151  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.187879 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  42.72 
 
 
415 aa  297  2e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.14 
 
 
412 aa  290  4e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  40.2 
 
 
409 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  40.05 
 
 
409 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  39.51 
 
 
409 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2259  allantoate amidohydrolase  40.53 
 
 
428 aa  274  2.0000000000000002e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  38.97 
 
 
425 aa  269  5e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2632  allantoate amidohydrolase  38.78 
 
 
429 aa  265  8e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5111  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.05 
 
 
447 aa  263  4e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  36.78 
 
 
411 aa  261  2e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4534  allantoate amidohydrolase  36.47 
 
 
415 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.289917  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1389  amidase hydantoinase/carbamoylase family  41.89 
 
 
415 aa  247  3e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0995046  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3334  allantoate amidohydrolase  39.64 
 
 
427 aa  243  3.9999999999999997e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3185  allantoate amidohydrolase  39.33 
 
 
427 aa  243  6e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3324  allantoate amidohydrolase  39.38 
 
 
427 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3949  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.5 
 
 
407 aa  239  5e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193056  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3012  allantoate amidohydrolase  38.29 
 
 
425 aa  239  9e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  34.63 
 
 
416 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3439  allantoate amidohydrolase  35.47 
 
 
427 aa  238  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0973396  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0866  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.4 
 
 
424 aa  237  3e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0759953  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3464  allantoate amidohydrolase  39.73 
 
 
429 aa  236  6e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3979  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.6 
 
 
419 aa  235  1.0000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1787  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.2 
 
 
410 aa  234  3e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.105508  normal  0.371665 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1668  allantoate amidohydrolase  34.3 
 
 
431 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2051  allantoate amidohydrolase  36.32 
 
 
408 aa  233  6e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0629  allantoate amidohydrolase  37.47 
 
 
414 aa  231  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2546  allantoate amidohydrolase  39.08 
 
 
422 aa  230  3e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2423  amidase, hydantoinase/carbamoylase family protein  36.5 
 
 
411 aa  230  4e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000367086 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2881  allantoate amidohydrolase  33.98 
 
 
416 aa  229  5e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.138552 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3207  amidase  33.09 
 
 
423 aa  229  5e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4127  allantoate amidohydrolase  37 
 
 
413 aa  229  6e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.638137  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7037  allantoate amidohydrolase  38.29 
 
 
419 aa  229  6e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3071  allantoate amidohydrolase  37.47 
 
 
421 aa  229  6e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4780  allantoate amidohydrolase  37.26 
 
 
415 aa  229  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1498  allantoate amidohydrolase  36.04 
 
 
414 aa  229  8e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0937  allantoate amidohydrolase  38.32 
 
 
418 aa  228  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275472  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4353  allantoate amidohydrolase  36.89 
 
 
430 aa  229  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  0.131907 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4068  allantoate amidohydrolase  35.77 
 
 
414 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3705  allantoate amidohydrolase  36.39 
 
 
433 aa  227  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3308  allantoate amidohydrolase  38.08 
 
 
417 aa  228  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  35.65 
 
 
415 aa  227  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1342  allantoate amidohydrolase  37.89 
 
 
417 aa  227  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6086  amidase  37.25 
 
 
421 aa  227  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.315706 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0547  allantoate amidohydrolase  35.68 
 
 
427 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05810  allantoate amidohydrolase  35.68 
 
 
427 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2039  allantoate amidohydrolase  38.54 
 
 
426 aa  226  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2180  allantoate amidohydrolase  38.54 
 
 
426 aa  226  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0554  allantoate amidohydrolase  37 
 
 
413 aa  226  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0158  allantoate amidohydrolase  36.12 
 
 
423 aa  226  7e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3826  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.38 
 
 
420 aa  226  7e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4903  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.38 
 
 
420 aa  226  7e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810439  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4034  allantoate amidohydrolase  35.28 
 
 
427 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6028  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase  34.23 
 
 
424 aa  225  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4755  amidase  36.19 
 
 
419 aa  224  3e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3535  allantoate amidohydrolase  37.68 
 
 
437 aa  223  4e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1804  allantoate amidohydrolase  35.28 
 
 
427 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.58036  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1838  allantoate amidohydrolase  35.12 
 
 
427 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal  0.060174 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1161  amidase  36.23 
 
 
431 aa  223  7e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441766  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1163  allantoate amidohydrolase  36.56 
 
 
479 aa  222  9e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146469  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3636  allantoate amidohydrolase  35.45 
 
 
427 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1784  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  39.2 
 
 
407 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.210554 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1586  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.71 
 
 
418 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6028  amidase  36.01 
 
 
431 aa  220  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1838  amidase  38.34 
 
 
424 aa  220  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4022  amidase  33.66 
 
 
418 aa  220  3e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0047  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.41 
 
 
428 aa  219  7.999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21885  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7539  allantoate amidohydrolase  35.31 
 
 
419 aa  219  7.999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.42 
 
 
421 aa  218  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2034  allantoate amidohydrolase  36.41 
 
 
413 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388418  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1931  amidase, hydantoinase/carbamoylase  36.08 
 
 
415 aa  218  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.876695  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1386  amidase hydantoinase/carbamoylase family  34.31 
 
 
430 aa  217  2e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000270015  normal  0.126217 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3463  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.03 
 
 
418 aa  218  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0590  allantoate amidohydrolase  35.01 
 
 
411 aa  217  4e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2689  allantoate amidohydrolase  35.32 
 
 
406 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0667838  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3896  allantoate amidohydrolase  35.54 
 
 
412 aa  216  7e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1844  allantoate amidohydrolase  35.11 
 
 
415 aa  216  8e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0660  allantoate amidohydrolase  33.58 
 
 
425 aa  216  9e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2575  allantoate amidohydrolase  34.68 
 
 
416 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124568  normal  0.390769 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0614  allantoate amidohydrolase  34.31 
 
 
425 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3376  allantoate amidohydrolase  33.41 
 
 
422 aa  215  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0654  allantoate amidohydrolase  34.06 
 
 
425 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385596  normal  0.174957 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3022  amidase  35.84 
 
 
442 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597256  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2691  allantoate amidohydrolase  35.27 
 
 
426 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4042  allantoate amidohydrolase  33.9 
 
 
411 aa  213  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00143061  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2561  amidase, hydantoinase/carbamoylase  34.06 
 
 
426 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0218  allantoate amidohydrolase  37.86 
 
 
429 aa  213  3.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0387479 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3097  allantoate amidohydrolase  35.18 
 
 
411 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0554  allantoate amidohydrolase  34.92 
 
 
411 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6770  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.9 
 
 
416 aa  213  5.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3623  allantoate amidohydrolase  34.88 
 
 
415 aa  213  7e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6570  amidase  35.05 
 
 
429 aa  213  7e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1427  allantoate amidohydrolase  34.78 
 
 
426 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1132  allantoate amidohydrolase  33.17 
 
 
423 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0561  allantoate amidohydrolase  34.92 
 
 
411 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3711  allantoate amidohydrolase  36.57 
 
 
400 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0455  allantoate amidohydrolase  36.62 
 
 
408 aa  212  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2079  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  39.01 
 
 
420 aa  211  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>