More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1655 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 306 aa  628  1e-179  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  48.48 
 
 		 296 aa  280  3e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  35.53 
 
 		 332 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  33.86 
 
 		 349 aa  181  2e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  33.12 
 
 		 318 aa  176  4e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  36.04 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  32.25 
 
 		 309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 314 aa  165  8e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3888  periplasmic solute binding protein  35.37 
 
 		 310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3938  periplasmic solute binding protein  34.69 
 
 		 310 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.165215 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  33.95 
 
 		 323 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  32.73 
 
 		 307 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  34.7 
 
 		 282 aa  161  1e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  33.81 
 
 		 317 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  33.87 
 
 		 290 aa  159  7e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  30.43 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  32.98 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  33.88 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_572  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  34.52 
 
 		 290 aa  156  4e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  30.1 
 
 		 298 aa  156  4e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  35.25 
 
 		 301 aa  154  1e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148152  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  29.25 
 
 		 326 aa  153  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0604  periplasmic solute binding protein  33.23 
 
 		 290 aa  152  7e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  30.18 
 
 		 318 aa  149  5e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  32.97 
 
 		 322 aa  148  9e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  32.08 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0535  zinc ABC transporter, zinc-binding adhesion liprotein  33.33 
 
 		 506 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0968782  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  32.98 
 
 		 300 aa  146  6e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  32.87 
 
 		 311 aa  145  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 316 aa  144  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  29.33 
 
 		 302 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  32.27 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  30 
 
 		 339 aa  143  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  31.35 
 
 		 320 aa  143  5e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  27.08 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  30.77 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  30.18 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  30.56 
 
 		 365 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1533  periplasmic solute binding protein  33.02 
 
 		 308 aa  139  7e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.411014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1833  periplasmic solute binding protein  30.85 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.475081  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  33.2 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1015  solute binding protein  33.1 
 
 		 310 aa  138  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  27.39 
 
 		 317 aa  138  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1891  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  32.23 
 
 		 288 aa  138  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0461  periplasmic solute binding protein  32.73 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  29.15 
 
 		 345 aa  136  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  34.26 
 
 		 285 aa  136  4e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  30.18 
 
 		 304 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  29.97 
 
 		 316 aa  136  5e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  28.32 
 
 		 346 aa  135  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3026  ABC-type transport system, periplasmic component  28.87 
 
 		 302 aa  135  7.000000000000001e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  30.55 
 
 		 292 aa  135  7.000000000000001e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  29.09 
 
 		 514 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0580  periplasmic solute binding protein  30.48 
 
 		 328 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  27.82 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2065  periplasmic solute binding protein  29.96 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  29.02 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18350  periplasmic solute binding protein  32.61 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000303257  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2635  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  30.94 
 
 		 298 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828517  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  28.76 
 
 		 311 aa  133  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  29.51 
 
 		 333 aa  133  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  28.04 
 
 		 368 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  32.14 
 
 		 303 aa  133  3.9999999999999996e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  29.58 
 
 		 300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0185  periplasmic solute binding protein  29.55 
 
 		 307 aa  133  3.9999999999999996e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11141  hypothetical protein  30.24 
 
 		 324 aa  133  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  30.18 
 
 		 292 aa  132  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  29.75 
 
 		 317 aa  132  6e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  28.34 
 
 		 311 aa  132  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  28.34 
 
 		 311 aa  132  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  29.75 
 
 		 317 aa  132  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0205  periplasmic solute binding protein  29.82 
 
 		 300 aa  132  6e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767408  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  27.78 
 
 		 311 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0516  periplasmic solute binding protein  31.33 
 
 		 365 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1674  adhesion protein, putative  29.84 
 
 		 311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0484174  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  29.35 
 
 		 301 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2227  periplasmic solute binding protein  30.51 
 
 		 327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82387 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0722  AfeA  32.25 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.738909  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  29.02 
 
 		 316 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1015  periplasmic solute binding protein  32.54 
 
 		 293 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0333  periplasmic solute binding protein  30.52 
 
 		 302 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000273282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  30.58 
 
 		 298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2791  periplasmic solute binding protein  29.97 
 
 		 314 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000435611  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  28.18 
 
 		 316 aa  129  6e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  30.55 
 
 		 292 aa  129  6e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  29.02 
 
 		 316 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0916  periplasmic solute binding protein  28.72 
 
 		 307 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  28.71 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  28.33 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  28.71 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2088  periplasmic solute binding protein  29.71 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1141  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  28.08 
 
 		 316 aa  126  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  28.24 
 
 		 309 aa  127  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0400  periplasmic solute binding protein  30.28 
 
 		 302 aa  127  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  31.51 
 
 		 328 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1156  periplasmic solute binding protein  30.29 
 
 		 303 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  28.08 
 
 		 316 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2419  zinc ABC transporter substrate-binding protein  28.57 
 
 		 280 aa  126  4.0000000000000003e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0902077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>