More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0060 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0060  glutamate racemase  100 
 
 
251 aa  491  1e-138  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0823  Asp/Glu racemase  33.8 
 
 
278 aa  134  1e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1508  glutamate racemase  29.8 
 
 
273 aa  117  2e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  31.69 
 
 
267 aa  113  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0664  glutamate racemase  24.58 
 
 
259 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  23.57 
 
 
289 aa  107  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0699  glutamate racemase  23.75 
 
 
259 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0698  glutamate racemase  23.75 
 
 
259 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1755  glutamate racemase  33.75 
 
 
266 aa  105  8e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000954192  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  24.6 
 
 
281 aa  103  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  5.32867e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1276  glutamate racemase  28.16 
 
 
295 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5418  glutamate racemase  31.93 
 
 
296 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0479  glutamate racemase  30.17 
 
 
265 aa  101  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.553791  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0492  glutamate racemase  29.63 
 
 
250 aa  100  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0708  glutamate racemase  24.17 
 
 
259 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2724  glutamate racemase  30.73 
 
 
266 aa  98.2  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3675  glutamate racemase  28.98 
 
 
258 aa  98.2  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00345939  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  29.2 
 
 
295 aa  97.1  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1349  glutamate racemase  28.11 
 
 
265 aa  97.4  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0573  glutamate racemase  30.81 
 
 
267 aa  97.1  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2541  glutamate racemase  27.16 
 
 
272 aa  96.7  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114878 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1467  glutamate racemase  28.37 
 
 
292 aa  96.7  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0107271  normal  0.23474 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0754  glutamate racemase  32.42 
 
 
268 aa  97.1  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1140  glutamate racemase  30.34 
 
 
268 aa  97.1  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0541  glutamate racemase  28.51 
 
 
267 aa  96.7  3e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  2.56058e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  30 
 
 
275 aa  96.3  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0781  glutamate racemase  24.81 
 
 
291 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.264959 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1799  glutamate racemase  25.67 
 
 
277 aa  95.9  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.627391  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0860  glutamate racemase  29.38 
 
 
284 aa  95.5  7e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  2.13664e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4745  glutamate racemase  26.17 
 
 
263 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4214  glutamate racemase  26.86 
 
 
254 aa  94.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0624  glutamate racemase  27.31 
 
 
270 aa  94.7  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  3.06047e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0449  glutamate racemase  29.03 
 
 
267 aa  93.6  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0987  glutamate racemase  29.75 
 
 
260 aa  94  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.507565  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  27.94 
 
 
264 aa  94  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1735  glutamate racemase  28.84 
 
 
271 aa  93.2  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0215474 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1372  glutamate racemase  25.61 
 
 
263 aa  92.8  4e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1240  glutamate racemase  29.62 
 
 
282 aa  92.8  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2085  glutamate racemase  27.78 
 
 
271 aa  92.4  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0449  glutamate racemase  28.02 
 
 
273 aa  92.4  6e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0316043  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3231  glutamate racemase  28.05 
 
 
272 aa  92.4  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.041198  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0396  glutamate racemase  26.85 
 
 
279 aa  92.4  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.971705 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0588  glutamate racemase  27.49 
 
 
281 aa  92.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0848  glutamate racemase  27.53 
 
 
264 aa  92  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  31.48 
 
 
270 aa  92  8e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0603  glutamate racemase  27.49 
 
 
281 aa  92  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  27.13 
 
 
276 aa  91.3  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  7.16913e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1797  glutamate racemase  31.46 
 
 
269 aa  91.3  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.850127  normal  0.2795 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2003  glutamate racemase  29.3 
 
 
269 aa  91.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.520225  normal  0.08167 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1954  glutamate racemase  28.74 
 
 
330 aa  91.3  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.998132 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0346  glutamate racemase  29.44 
 
 
274 aa  91.3  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.633772  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0527  glutamate racemase  27.57 
 
 
264 aa  90.9  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0161  glutamate racemase  26.72 
 
 
270 aa  90.9  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0534068  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1160  glutamate racemase  27.27 
 
 
276 aa  90.9  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1779  glutamate racemase  24.8 
 
 
280 aa  90.1  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.63205 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2226  glutamate racemase  28.57 
 
 
281 aa  90.1  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1956  glutamate racemase  28.11 
 
 
277 aa  90.1  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.201101  normal  0.864089 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1295  glutamate racemase  23.79 
 
 
276 aa  90.1  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0764463 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2103  glutamate racemase  27.1 
 
 
282 aa  90.5  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.629875 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4603  glutamate racemase  25.41 
 
 
269 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.171271  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0632  glutamate racemase  25.41 
 
 
269 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4328  glutamate racemase  25.63 
 
 
267 aa  89.7  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0415  glutamate racemase  29.22 
 
 
272 aa  89.7  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.51428  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  29.22 
 
 
272 aa  89.7  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3204  glutamate racemase  24.9 
 
 
267 aa  89.4  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.685477  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2249  glutamate racemase  28.18 
 
 
333 aa  89  7e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.062681  normal  0.257999 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4573  glutamate racemase  25.21 
 
 
269 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2251  glutamate racemase  26.32 
 
 
290 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0194593  normal  0.0243965 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4623  glutamate racemase  25.21 
 
 
269 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000438915  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0538  glutamate racemase  27.56 
 
 
261 aa  87.8  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  1.09629e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1780  glutamate racemase  26.38 
 
 
264 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1403  glutamate racemase  25.41 
 
 
271 aa  88.2  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.011176  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4589  glutamate racemase  25.21 
 
 
269 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.547606  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4717  glutamate racemase  25.21 
 
 
269 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  2.52581e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4220  glutamate racemase  25.21 
 
 
269 aa  88.6  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.328787  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4379  glutamate racemase  25.21 
 
 
269 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119134  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0952  glutamate racemase  26.7 
 
 
271 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.44485  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1645  glutamate racemase  26.09 
 
 
265 aa  87.8  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0547  glutamate racemase  30.21 
 
 
276 aa  88.6  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.77942  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4236  glutamate racemase  25.21 
 
 
269 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1797  glutamate racemase  26.05 
 
 
278 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00256  glutamate racemase  28.1 
 
 
268 aa  87.8  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1326  glutamate racemase  23.66 
 
 
287 aa  87.8  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.219508  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1955  glutamate racemase  26.32 
 
 
303 aa  87.4  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00243974  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3412  glutamate racemase  27.78 
 
 
286 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04380  Glutamate racemase  30.05 
 
 
263 aa  87.4  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2045  glutamate racemase  25.63 
 
 
281 aa  87.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.36787  normal  0.0203699 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0133  glutamate racemase  28.57 
 
 
290 aa  86.3  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00475482  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5384  glutamate racemase  27.08 
 
 
265 aa  86.3  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.572623 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1865  glutamate racemase  25 
 
 
283 aa  86.3  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0131897  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1112  glutamate racemase  26.94 
 
 
275 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2884  glutamate racemase  26.39 
 
 
272 aa  86.3  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.297231 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  27.75 
 
 
272 aa  86.3  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3541  glutamate racemase  25.51 
 
 
286 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.476153 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002158  glutamate racemase  28.37 
 
 
267 aa  85.9  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  4.702e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09110  glutamate racemase  24.63 
 
 
307 aa  85.9  6e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.644138  normal  0.0830373 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5311  glutamate racemase  24.49 
 
 
265 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0736  glutamate racemase  23.67 
 
 
265 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3847  glutamate racemase  26.85 
 
 
305 aa  85.5  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.671121  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0764  glutamate racemase  26.51 
 
 
265 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>