More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1372 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1372  glutamate racemase  100 
 
 		 263 aa  528  1e-149  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1160  glutamate racemase  56.3 
 
 		 276 aa  289  2e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3675  glutamate racemase  38.08 
 
 		 258 aa  153  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00345939  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0527  glutamate racemase  36.13 
 
 		 264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0054  glutamate racemase  36.8 
 
 		 265 aa  149  3e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.382436  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06751  putative aspartate and glutamate racemases:glutamate racemase  36.84 
 
 		 265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  30.55 
 
 		 289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2724  glutamate racemase  35.66 
 
 		 266 aa  140  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  37.14 
 
 		 276 aa  139  7e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0664  glutamate racemase  32.49 
 
 		 259 aa  138  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0698  glutamate racemase  31.67 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0699  glutamate racemase  31.67 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0161  glutamate racemase  33.89 
 
 		 270 aa  137  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0534068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  33.75 
 
 		 267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0264  glutamate racemase  38.21 
 
 		 276 aa  136  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.741636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0479  glutamate racemase  35.08 
 
 		 265 aa  136  4e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.553791  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0860  glutamate racemase  32.51 
 
 		 284 aa  135  7.000000000000001e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000213664  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1522  glutamate racemase  33.88 
 
 		 265 aa  135  8e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167317  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1467  glutamate racemase  33.2 
 
 		 292 aa  134  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0107271  normal  0.23474 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1937  glutamate racemase  35.39 
 
 		 268 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512985  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  34.65 
 
 		 295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06821  putative aspartate and glutamate racemases:glutamate racemase  34.15 
 
 		 264 aa  133  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.876328  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  33.86 
 
 		 264 aa  133  3e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  34.71 
 
 		 275 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  33.2 
 
 		 278 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09920  glutamate racemase  31.85 
 
 		 285 aa  132  5e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.634287  normal  0.13498 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0487  glutamate racemase  34.71 
 
 		 288 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0079  glutamate racemase  37.45 
 
 		 246 aa  132  7.999999999999999e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4289  glutamate racemase  33.33 
 
 		 281 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244249 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1543  glutamate racemase  31.05 
 
 		 277 aa  131  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1797  glutamate racemase  32.09 
 
 		 278 aa  131  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1349  glutamate racemase  33.2 
 
 		 265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2356  glutamate racemase  32.64 
 
 		 278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0280232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1700  glutamate racemase  32.39 
 
 		 301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499651  normal  0.299923 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1321  glutamate racemase  32.23 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5648  glutamate racemase  33.2 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.546638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10321  putative aspartate and glutamate racemases:glutamate racemase  31.58 
 
 		 267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.22912  normal  0.716928 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  34.18 
 
 		 281 aa  130  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  34.16 
 
 		 272 aa  130  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  34.71 
 
 		 272 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0153  glutamate racemase  37.97 
 
 		 263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000323357  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3231  glutamate racemase  34.91 
 
 		 272 aa  129  7.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.041198  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3010  glutamate racemase  32.37 
 
 		 275 aa  128  9.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3052  glutamate racemase  32.37 
 
 		 275 aa  128  9.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.580902 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1508  glutamate racemase  33.33 
 
 		 273 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1602  glutamate racemase  33.6 
 
 		 281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151201  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1296  glutamate racemase  35.92 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1015  glutamate racemase  32.8 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0260  glutamate racemase  34.3 
 
 		 278 aa  126  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172375 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0638  glutamate racemase  34.96 
 
 		 256 aa  126  3e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1735  glutamate racemase  32.1 
 
 		 271 aa  127  3e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0215474 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0590  glutamate racemase  31.33 
 
 		 293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0987  glutamate racemase  34.85 
 
 		 260 aa  125  8.000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.507565  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0573  glutamate racemase  34.27 
 
 		 267 aa  124  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0872  glutamate racemase  33.2 
 
 		 300 aa  124  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1323  glutamate racemase  32.8 
 
 		 285 aa  125  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.123332  hitchhiker  0.00249811 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2509  glutamate racemase  34.56 
 
 		 291 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.194908 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3204  glutamate racemase  36.06 
 
 		 267 aa  124  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.685477  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3832  glutamate racemase  31.17 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3846  glutamate racemase  31.2 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3920  glutamate racemase  31.2 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1403  glutamate racemase  36.59 
 
 		 271 aa  123  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.011176  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0848  glutamate racemase  33.06 
 
 		 264 aa  123  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4236  glutamate racemase  35.58 
 
 		 269 aa  123  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0547  glutamate racemase  33.47 
 
 		 276 aa  122  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.77942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1315  glutamate racemase  31.84 
 
 		 282 aa  122  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.278048  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0404  glutamate racemase  32.24 
 
 		 280 aa  122  6e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1783  glutamate racemase  32.11 
 
 		 280 aa  122  7e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11368  glutamate racemase  31.17 
 
 		 271 aa  122  8e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110986  normal  0.482837 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1058  glutamate racemase  32.27 
 
 		 268 aa  122  9e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213351  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  32.64 
 
 		 264 aa  121  9e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4603  glutamate racemase  35.1 
 
 		 269 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.171271  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4589  glutamate racemase  35.1 
 
 		 269 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.547606  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4379  glutamate racemase  35.1 
 
 		 269 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4220  glutamate racemase  35.1 
 
 		 269 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.328787  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29140  glutamate racemase  30.24 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.818975 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4573  glutamate racemase  35.1 
 
 		 269 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4717  glutamate racemase  35.1 
 
 		 269 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2315  glutamate racemase  30.8 
 
 		 360 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000133426 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4623  glutamate racemase  35.1 
 
 		 269 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000438915  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0632  glutamate racemase  35.1 
 
 		 269 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0603  glutamate racemase  31.56 
 
 		 281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4328  glutamate racemase  34.62 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20070  glutamate racemase  33.33 
 
 		 270 aa  120  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0449  glutamate racemase  32.5 
 
 		 267 aa  120  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0588  glutamate racemase  31.56 
 
 		 281 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06431  putative aspartate and glutamate racemases:glutamate racemase  31.71 
 
 		 264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1276  glutamate racemase  30.29 
 
 		 295 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0617  glutamate racemase  30.89 
 
 		 264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1600  glutamate racemase  33.74 
 
 		 264 aa  118  7.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129686  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1386  glutamate racemase  31.02 
 
 		 272 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1238  glutamate racemase  35.55 
 
 		 268 aa  118  7.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0708  glutamate racemase  30.8 
 
 		 259 aa  118  9e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1755  glutamate racemase  32.7 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000954192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18941  putative aspartate and glutamate racemases:glutamate racemase  30.99 
 
 		 268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.29569 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2003  glutamate racemase  34.27 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.520225  normal  0.08167 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2013  glutamate racemase  32.67 
 
 		 247 aa  116  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2737  glutamate racemase  31.01 
 
 		 292 aa  116  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.364406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2583  glutamate racemase  30 
 
 		 312 aa  116  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00016554  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1686  glutamate racemase  31.05 
 
 		 263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.000161224  hitchhiker  0.00000616393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>