More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5270 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5270  Prephenate dehydratase  100 
 
 		 315 aa  628  1e-179  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3053  prephenate dehydratase  74.92 
 
 		 315 aa  471  1e-132  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0071  prephenate dehydratase  61.41 
 
 		 324 aa  355  7.999999999999999e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0141  Prephenate dehydratase  60.19 
 
 		 306 aa  347  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0121  Prephenate dehydratase  56.27 
 
 		 305 aa  317  2e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2105  prephenate dehydratase  54.17 
 
 		 318 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.547731 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2485  prephenate dehydratase  51.92 
 
 		 349 aa  298  7e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0138  prephenate dehydratase  50.32 
 
 		 327 aa  296  4e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0268  Prephenate dehydratase  54.6 
 
 		 311 aa  295  7e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0282  Prephenate dehydratase  52.77 
 
 		 326 aa  293  4e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.209842 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6401  Prephenate dehydratase  51.77 
 
 		 305 aa  282  5.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1594  prephenate dehydratase  50.16 
 
 		 317 aa  279  4e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0572712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4522  prephenate dehydratase  50.63 
 
 		 318 aa  278  8e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0245  Prephenate dehydratase  54.11 
 
 		 314 aa  276  3e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00775166  hitchhiker  0.00464716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0097  Prephenate dehydratase  52.56 
 
 		 314 aa  275  7e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0315701 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3187  Prephenate dehydratase  51.1 
 
 		 322 aa  269  5.9999999999999995e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32144  normal  0.019372 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01130  prephenate dehydratase  48.7 
 
 		 316 aa  266  5e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5032  prephenate dehydratase  49.53 
 
 		 318 aa  256  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0377  Prephenate dehydratase  47.52 
 
 		 335 aa  247  2e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.461559 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0100  Prephenate dehydratase  49.03 
 
 		 300 aa  235  9e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.863601  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13872  prephenate dehydratase  45.43 
 
 		 321 aa  232  7.000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01190  prephenate dehydratase  47.77 
 
 		 301 aa  220  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.70392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06790  prephenate dehydratase  41.3 
 
 		 325 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.299471  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1145  prephenate dehydratase  42.24 
 
 		 309 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0149983  normal  0.0340431 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5662  prephenate dehydratase  41.85 
 
 		 312 aa  206  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.963646  normal  0.0943658 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  43.06 
 
 		 272 aa  206  4e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0218  Prephenate dehydratase  45.42 
 
 		 314 aa  206  6e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5034  prephenate dehydratase  43.3 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431184  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5122  prephenate dehydratase  43.3 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5415  prephenate dehydratase  43.3 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  44.2 
 
 		 386 aa  195  7e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  46.74 
 
 		 371 aa  195  7e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  42.6 
 
 		 277 aa  195  9e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  41.88 
 
 		 277 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  41.88 
 
 		 277 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  41.9 
 
 		 372 aa  188  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  41.37 
 
 		 360 aa  187  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  39.07 
 
 		 358 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0097  Prephenate dehydratase  43.32 
 
 		 306 aa  182  9.000000000000001e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1334  prephenate dehydratase  41.22 
 
 		 280 aa  179  7e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000128945  normal  0.202615 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1250  chorismate mutase  38.13 
 
 		 382 aa  177  1e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149804  normal  0.0219371 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  38.87 
 
 		 276 aa  177  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0145  Prephenate dehydratase  41.28 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0961  chorismate mutase  40.65 
 
 		 374 aa  177  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0078  prephenate dehydratase  37.18 
 
 		 280 aa  176  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0545378  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2039  prephenate dehydratase  44.04 
 
 		 275 aa  176  6e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402041 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  37.63 
 
 		 359 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1552  prephenate dehydratase  39.29 
 
 		 279 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0248162  normal  0.310445 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01900  Prephenate dehydratase  35.39 
 
 		 303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  40.29 
 
 		 358 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  39.93 
 
 		 359 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  37.28 
 
 		 359 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  41.01 
 
 		 362 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2535  prephenate dehydratase  37.37 
 
 		 282 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  38.93 
 
 		 360 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2260  prephenate dehydratase  34.18 
 
 		 278 aa  171  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08570  prephenate dehydratase  39.72 
 
 		 286 aa  170  3e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  36.2 
 
 		 356 aa  170  3e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  38.71 
 
 		 371 aa  170  3e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  39.21 
 
 		 368 aa  169  5e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1186  prephenate dehydratase  37.41 
 
 		 393 aa  168  1e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.343107 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1244  Prephenate dehydratase  40.22 
 
 		 283 aa  168  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  37.41 
 
 		 367 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  37.41 
 
 		 364 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1538  chorismate mutase  41.37 
 
 		 362 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1204  chorismate mutase  37.41 
 
 		 393 aa  167  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.973222  normal  0.768195 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  35.84 
 
 		 358 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  37.41 
 
 		 364 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  38.13 
 
 		 360 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  37.41 
 
 		 364 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0176  chorismate mutase / prephenate dehydratase  42.18 
 
 		 368 aa  166  2.9999999999999998e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0878  Prephenate dehydratase  35.34 
 
 		 277 aa  166  4e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.583651  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  37.77 
 
 		 364 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16271  chorismate mutase-prephenate dehydratase  36.43 
 
 		 281 aa  166  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.763625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1394  chorismate mutase  39.21 
 
 		 371 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0138573  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2466  chorismate mutase / prephenate dehydratase  39.21 
 
 		 371 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  37.41 
 
 		 364 aa  165  8e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2241  prephenate dehydratase / chorismate mutase  40.93 
 
 		 370 aa  165  9e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.41 
 
 		 364 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  37.41 
 
 		 373 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  36.52 
 
 		 381 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1964  prephenate dehydratase  38.57 
 
 		 279 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221167 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  38.52 
 
 		 361 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1497  P-protein (prephenate dehydratase / chorismate mutase)  38.49 
 
 		 374 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554673  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  36.69 
 
 		 364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  37.09 
 
 		 356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  37.05 
 
 		 365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  39.71 
 
 		 355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3051  Prephenate dehydratase  35.84 
 
 		 286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  37.05 
 
 		 365 aa  163  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  39.93 
 
 		 387 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1930  prephenate dehydratase  36.68 
 
 		 311 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898282 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0316  prephenate dehydratase  39.36 
 
 		 291 aa  162  5.0000000000000005e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51764  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4331  prephenate dehydratase  37.63 
 
 		 283 aa  162  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.662649  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4666  prephenate dehydratase  37.63 
 
 		 283 aa  162  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  32.62 
 
 		 311 aa  162  6e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1442  chorismate mutase  38.13 
 
 		 374 aa  162  7e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.105369  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1569  chorismate mutase  37.91 
 
 		 360 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203479  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  39.21 
 
 		 382 aa  162  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1617  chorismate mutase  39.21 
 
 		 373 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>