More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5248 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5248  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 484 aa  981    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3064  peptidoglycan glycosyltransferase  55.65 
 
 		 482 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.300447  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0172  Peptidoglycan glycosyltransferase  47.06 
 
 		 483 aa  385  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.81873 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  44.92 
 
 		 482 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  43.23 
 
 		 485 aa  375  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  45.38 
 
 		 489 aa  372  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0027  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.33 
 
 		 483 aa  366  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0028  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.71 
 
 		 493 aa  366  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.790877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.26 
 
 		 489 aa  363  4e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7946  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.76 
 
 		 487 aa  357  2.9999999999999997e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  43.47 
 
 		 480 aa  356  5.999999999999999e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.02 
 
 		 485 aa  352  7e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0053  peptidoglycan glycosyltransferase  42.57 
 
 		 485 aa  350  4e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00491745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0113  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.63 
 
 		 485 aa  348  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0705115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.52 
 
 		 480 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0810  penicillin-binding protein, transpeptidase  42.32 
 
 		 491 aa  334  2e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  41.12 
 
 		 491 aa  331  2e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0025  peptidoglycan glycosyltransferase  41.12 
 
 		 491 aa  331  2e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487065 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0023  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.93 
 
 		 488 aa  331  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0951925  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  41.12 
 
 		 491 aa  331  2e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.768484  normal  0.198111 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0024  peptidoglycan glycosyltransferase  41.78 
 
 		 490 aa  327  3e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805359  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26970  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  40.73 
 
 		 481 aa  323  6e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0025  penicillin-binding protein, transpeptidase  39.32 
 
 		 491 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00200  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  42.2 
 
 		 490 aa  315  1.9999999999999998e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00380  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  40.2 
 
 		 489 aa  308  1.0000000000000001e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0027  penicillin-binding protein transpeptidase  39.68 
 
 		 495 aa  302  8.000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.474914  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0079  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.32 
 
 		 493 aa  298  1e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1381  cell division protein  37.8 
 
 		 488 aa  294  2e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10016  penicillin-binding protein pbpA  39.39 
 
 		 491 aa  293  4e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0051  peptidoglycan glycosyltransferase  39.72 
 
 		 503 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.948858  normal  0.601931 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0029  penicillin-binding protein transpeptidase  37.33 
 
 		 504 aa  278  2e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0046  peptidoglycan glycosyltransferase  38.39 
 
 		 501 aa  277  3e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.56645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0065  penicillin-binding protein transpeptidase  37.5 
 
 		 489 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  39.39 
 
 		 504 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0032  penicillin-binding protein, transpeptidase domain protein  36.38 
 
 		 488 aa  266  5e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6473  penicillin-binding protein transpeptidase  36.25 
 
 		 492 aa  263  4.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00770  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  37.22 
 
 		 481 aa  262  1e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.28 
 
 		 490 aa  257  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  34.55 
 
 		 486 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0022  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.35 
 
 		 486 aa  250  4e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000781199 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  34.76 
 
 		 470 aa  236  9e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0016  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.11 
 
 		 478 aa  233  5e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  34.14 
 
 		 972 aa  224  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  33.81 
 
 		 473 aa  224  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.02 
 
 		 458 aa  223  6e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0089  penicillin-binding protein transpeptidase  35.32 
 
 		 493 aa  220  5e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  32.12 
 
 		 921 aa  218  2e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  32.72 
 
 		 471 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3845  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.6 
 
 		 472 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  36.15 
 
 		 933 aa  215  9.999999999999999e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.36 
 
 		 924 aa  216  9.999999999999999e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1713  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.4 
 
 		 476 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0911  peptidoglycan glycosyltransferase  33.81 
 
 		 461 aa  211  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.271036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0876  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.77 
 
 		 503 aa  208  2e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2616  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.1 
 
 		 573 aa  208  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  33.13 
 
 		 487 aa  203  5e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  33.13 
 
 		 487 aa  203  7e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0579  peptidoglycan glycosyltransferase  35.03 
 
 		 578 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3840  peptidoglycan glycosyltransferase  34.31 
 
 		 577 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527285  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1376  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.5 
 
 		 547 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3956  peptidoglycan glycosyltransferase  32.79 
 
 		 570 aa  185  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  34.79 
 
 		 640 aa  180  4e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1344  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.42 
 
 		 954 aa  179  1e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  32.64 
 
 		 610 aa  177  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  31.76 
 
 		 701 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1118  peptidoglycan glycosyltransferase  33.13 
 
 		 584 aa  169  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3814  penicillin-binding protein transpeptidase  29.98 
 
 		 579 aa  166  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0233122  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  29.77 
 
 		 646 aa  162  9e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0890  peptidoglycan glycosyltransferase  31.04 
 
 		 547 aa  162  1e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  32.44 
 
 		 645 aa  161  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  32.09 
 
 		 611 aa  160  4e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  32.15 
 
 		 647 aa  160  4e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  32.42 
 
 		 643 aa  159  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0571  peptidoglycan glycosyltransferase  33.24 
 
 		 634 aa  158  3e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.784328  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  34.26 
 
 		 801 aa  157  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1741  penicillin-binding protein 2  33.16 
 
 		 635 aa  157  4e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  33.59 
 
 		 766 aa  154  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  31.76 
 
 		 647 aa  152  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  28.7 
 
 		 574 aa  152  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2024  peptidoglycan glycosyltransferase  32.9 
 
 		 635 aa  152  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0252806  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  31.69 
 
 		 641 aa  151  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0054  peptidoglycan glycosyltransferase  33.08 
 
 		 793 aa  150  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  31.59 
 
 		 645 aa  150  6e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  32.08 
 
 		 627 aa  149  7e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0671  peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 		 687 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.195303  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0590  penicillin-binding protein 2  33.33 
 
 		 687 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.253689  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  29.89 
 
 		 634 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0630  penicillin-binding protein 2  31.88 
 
 		 615 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  32.82 
 
 		 673 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0568  penicillin-binding protein 2  37.3 
 
 		 612 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.116785  normal  0.658129 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0551  penicillin-binding protein 2  37.3 
 
 		 612 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0378  penicillin-binding protein 2  27.14 
 
 		 586 aa  149  2.0000000000000003e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0104  penicillin-binding protein 2  26.73 
 
 		 599 aa  147  3e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.14442  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  28.54 
 
 		 705 aa  147  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1352  penicillin-binding protein  30 
 
 		 617 aa  147  5e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1175  peptidoglycan glycosyltransferase  26.75 
 
 		 533 aa  147  5e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3305  peptidoglycan glycosyltransferase  29.31 
 
 		 600 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.374594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  31.84 
 
 		 636 aa  145  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1500  peptidoglycan glycosyltransferase  31.15 
 
 		 535 aa  145  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  31.69 
 
 		 632 aa  146  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>