More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5078 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5078  response regulator receiver and unknown domain protein  100 
 
 		 228 aa  451  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.763511 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8064  response regulator of citrate/malate metabolism  55.26 
 
 		 224 aa  227  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5599  response regulator receiver and unknown domain protein  51.74 
 
 		 243 aa  208  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0782544  normal  0.532525 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37850  response regulator of citrate/malate metabolism  49.78 
 
 		 227 aa  202  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.277898 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0508  response regulator receiver and unknown domain protein  49.55 
 
 		 224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.957096  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0598  response regulator receiver and unknown domain protein  48 
 
 		 223 aa  196  3e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00972259 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1397  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  48.91 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.362742  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0064  response regulator receiver and unknown domain protein  49.57 
 
 		 238 aa  190  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.803731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25720  response regulator of citrate/malate metabolism  49.33 
 
 		 231 aa  188  5e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3623  response regulator receiver and unknown domain protein  46.26 
 
 		 232 aa  178  5.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.796239  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1040  response regulator receiver and unknown domain protein  46.9 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3239  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  46.49 
 
 		 220 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3301  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  46.49 
 
 		 220 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0147948 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3250  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  46.05 
 
 		 220 aa  174  8e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.237703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3706  response regulator receiver and unknown domain protein  47.64 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1163  response regulator receiver and unknown domain protein  45.09 
 
 		 231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3868  putative response regulator ofcitrate/malate metabolism  46.46 
 
 		 223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.017891 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3002  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  45.33 
 
 		 221 aa  171  6.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0266393 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8199  response regulator receiver and unknown domain protein  44.59 
 
 		 226 aa  168  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3504  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  44.44 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0894605 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4415  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  45.53 
 
 		 241 aa  162  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1528  response regulator receiver and unknown domain protein  41.77 
 
 		 237 aa  161  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000318963 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0835  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  45.33 
 
 		 233 aa  158  8e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.256612  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4178  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  44.68 
 
 		 233 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0312835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4244  Fis family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 233 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0391426  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2259  response regulator receiver and unknown domain protein  47.14 
 
 		 223 aa  156  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00555688  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4400  Fis family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 233 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.328489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1528  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  40.85 
 
 		 236 aa  155  6e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.827563  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3992  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  39.74 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000025564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0514  response regulator receiver and unknown domain protein  37.55 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1769  response regulator receiver and unknown domain-containing protein  50.22 
 
 		 223 aa  152  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.870814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1376  response regulator receiver and unknown domain protein  38.7 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02430  response regulator  36 
 
 		 228 aa  149  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2968  response regulator receiver and unknown domain protein  42.36 
 
 		 228 aa  149  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33413  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3597  response regulator receiver and unknown domain protein  41.99 
 
 		 228 aa  148  8e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3357  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  46.32 
 
 		 251 aa  148  9e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0520  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  40.26 
 
 		 272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0517  two component transcriptional regulator, Fis family  45.19 
 
 		 231 aa  146  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.169907  normal  0.0442424 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003320  transcriptional regulatory protein CitB  36.73 
 
 		 228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1864  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  35.96 
 
 		 230 aa  145  5e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.134891  normal  0.12527 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1209  response regulator  36.61 
 
 		 228 aa  145  5e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000538312  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2788  response regulator receiver and unknown domain protein  34.63 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2899  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  37 
 
 		 228 aa  142  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1346  response regulator receiver and unknown domain protein  41.48 
 
 		 220 aa  141  6e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000367941 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4644  response regulator receiver and unknown domain protein  33.77 
 
 		 231 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210142  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4698  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  44.64 
 
 		 229 aa  139  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.423451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0812  response regulator receiver  31.11 
 
 		 225 aa  136  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4345  response regulator  31.56 
 
 		 225 aa  135  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158783  hitchhiker  0.00000000000467704 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2186  HTH-type transcriptional regulator, two-component response regulator  33.63 
 
 		 224 aa  135  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1303  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  40.87 
 
 		 220 aa  135  5e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0321774  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2442  response regulator receiver and unknown domain protein  36.4 
 
 		 227 aa  134  9e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0870  response regulator  31.11 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0924  response regulator  31.11 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1351  response regulator receiver and unknown domain protein  38.94 
 
 		 220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0966  response regulator  31.11 
 
 		 225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1010  response regulator  30.67 
 
 		 225 aa  132  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1239  response regulator receiver and unknown domain protein  33.63 
 
 		 225 aa  132  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0291668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0838  response regulator  31.11 
 
 		 225 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.873813  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1090  response regulator  30.67 
 
 		 225 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1005  response regulator  30.67 
 
 		 225 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.38637e-62 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14110  response regulator of citrate/malate metabolism  40.34 
 
 		 238 aa  129  4.0000000000000003e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0325971  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2791  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  31 
 
 		 228 aa  128  6e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00727267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0473  response regulator receiver  32.74 
 
 		 230 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4724  response regulator  32.3 
 
 		 235 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.240866  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0471  response regulator  33.48 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0689  response regulator  33.48 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4743  response regulator  33.92 
 
 		 230 aa  126  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0546  response regulator  31.86 
 
 		 235 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000213708  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0616  response regulator  33.48 
 
 		 230 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0596  response regulator  33.48 
 
 		 230 aa  125  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0615  response regulator  31.42 
 
 		 235 aa  124  9e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0621  DNA-binding response regulator  33.04 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0640  response regulator  31.86 
 
 		 235 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0490  response regulator  30.97 
 
 		 235 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00461557  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1958  DNA-binding transcriptional activator DcuR  35.78 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0209132 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0349  response regulator receiver  30.18 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0488  response regulator  30.97 
 
 		 235 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0633  response regulator  30.97 
 
 		 235 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0497  response regulator receiver  30.36 
 
 		 235 aa  122  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0317  transcriptional regulator CitB  33.48 
 
 		 230 aa  122  5e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0491  response regulator receiver  30.97 
 
 		 235 aa  121  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2556  DNA-binding transcriptional activator DcuR  32.61 
 
 		 239 aa  121  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.109677 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0512  two-component response regulator  28.7 
 
 		 222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0501  two-component response regulator  28.25 
 
 		 222 aa  118  6e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1748  response regulator receiver and unknown domain protein  32.6 
 
 		 233 aa  118  7.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.013924  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2020  response regulator receiver and unknown domain protein  32.16 
 
 		 233 aa  117  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.105388  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4785  response regulator receiver  38.6 
 
 		 233 aa  116  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.286234  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2326  response regulator receiver and unknown domain protein  33.33 
 
 		 241 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.500594  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4101  DNA-binding transcriptional activator DcuR  31.51 
 
 		 240 aa  116  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3732  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  32.59 
 
 		 229 aa  116  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.655402 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2037  response regulator receiver  38.63 
 
 		 237 aa  115  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0045  DNA-binding transcriptional activator DcuR  31.65 
 
 		 240 aa  115  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0039  DNA-binding transcriptional activator DcuR  31.65 
 
 		 240 aa  115  6e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2225  response regulator receiver and unknown domain protein  34.07 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.381743  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0354  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  38.79 
 
 		 217 aa  114  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.435973 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03956  hypothetical protein  30.87 
 
 		 239 aa  113  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3095  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  33.19 
 
 		 226 aa  113  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0654926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5638  DNA-binding transcriptional activator DcuR  30.87 
 
 		 239 aa  113  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4365  DNA-binding transcriptional activator DcuR  30.87 
 
 		 239 aa  113  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.414132  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4678  DNA-binding transcriptional activator DcuR  30.87 
 
 		 239 aa  113  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>