More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1528 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1528  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 209 aa  417  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  50.99 
 
 		 217 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  51.5 
 
 		 217 aa  176  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  46.89 
 
 		 210 aa  174  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  48.15 
 
 		 220 aa  166  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  47.5 
 
 		 208 aa  163  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  44 
 
 		 203 aa  159  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  47.6 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  43.27 
 
 		 209 aa  142  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1686  Methyltransferase type 11  42.38 
 
 		 212 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776814  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  43.56 
 
 		 218 aa  136  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  39.91 
 
 		 215 aa  131  6.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  39.11 
 
 		 200 aa  121  7e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  40.8 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0640  methyltransferase type 11  41.32 
 
 		 197 aa  116  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  41.15 
 
 		 222 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  42.48 
 
 		 200 aa  112  3e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0494  Methyltransferase type 11  44.44 
 
 		 228 aa  109  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  39.69 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030187 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4405  Methyltransferase type 11  32.16 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.432448  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  37.16 
 
 		 219 aa  97.8  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  41.38 
 
 		 224 aa  96.7  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2718  Methyltransferase type 12  34.2 
 
 		 204 aa  94.4  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2782  hypothetical protein  35.15 
 
 		 400 aa  86.7  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0750  hypothetical protein  41.18 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0915  Methyltransferase type 12  40.74 
 
 		 222 aa  81.6  0.000000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2262  hypothetical protein  38.24 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.363838  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1093  methyltransferase  38.24 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280373  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0938  SAM-dependent methyltransferases  38.24 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2139  hypothetical protein  38.24 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0942  hypothetical protein  38.24 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0559  hypothetical protein  38.24 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  33.76 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  31.85 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  34.69 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  31.85 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5571  methyltransferase  44.07 
 
 		 121 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.766224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 232 aa  68.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  36.69 
 
 		 364 aa  65.5  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  33.1 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  33.79 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  39.02 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  36.51 
 
 		 241 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  36.02 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1589  Methyltransferase type 11  32.41 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  32.76 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.06 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  34.39 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  27.97 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  36.08 
 
 		 255 aa  58.2  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1744  Methyltransferase type 11  32.45 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.370117 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  24.74 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0757  methyltransferase type 11  40.21 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.137769  normal  0.156895 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13054  hypothetical protein  42.86 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3257  Methyltransferase type 11  34.69 
 
 		 551 aa  57.4  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.708921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3370  Methyltransferase type 11  33.98 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.442858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.53 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0223  SAM-dependent methyltransferase  37.14 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  37.11 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5792  Methyltransferase type 11  39.81 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5869  hypothetical protein  39.18 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0641287  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4181  methyltransferase type 11  34.09 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4832  methyltransferase type 11  34.09 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3334  methyltransferase type 11  34.09 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  30.54 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  30.36 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0152  methyltransferase type 11  32.63 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0462  methyltransferase type 11  22.67 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2971  Generic methyltransferase  32.14 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294264  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1859  methyltransferase type 11  38.32 
 
 		 328 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1840  methyltransferase type 11  38.32 
 
 		 328 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4269  methyltransferase type 11  39.25 
 
 		 332 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1906  methyltransferase type 11  38.32 
 
 		 328 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1926  methyltransferase type 11  40.21 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2538  methyltransferase type 11  40.21 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0718588  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2090  methyltransferase type 11  38.18 
 
 		 341 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2319  methyltransferase type 11  30.98 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690206  normal  0.0712991 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3846  methyltransferase type 11  36.79 
 
 		 351 aa  54.7  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0403066  normal  0.436715 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  34.91 
 
 		 252 aa  54.7  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87708  predicted protein  30.82 
 
 		 267 aa  54.7  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2539  methyltransferase type 11  33.99 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0779638  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  38.3 
 
 		 259 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0166  DNA topoisomerase VI subunit A-like protein  25.52 
 
 		 257 aa  54.7  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1312  methyltransferase type 11  40.57 
 
 		 303 aa  53.9  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.117711  hitchhiker  0.0001856 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.97 
 
 		 236 aa  53.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  32.03 
 
 		 253 aa  53.9  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0919  chromosome segregation ATPase  36.36 
 
 		 646 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.446373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 		 1106 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  38.3 
 
 		 259 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  22.99 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1074  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 436 aa  53.5  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.257037  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2771  Methyltransferase type 12  28.42 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2562  methyltransferase type 11  38.14 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.290266  normal  0.0304213 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  35.58 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1989  methyltransferase type 11  36.21 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512707  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3007  methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 429 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  35.45 
 
 		 226 aa  53.1  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>