180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0504 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  100 
 
 		 210 aa  393  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2314  hypothetical protein  59.8 
 
 		 222 aa  165  4e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.462217  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  43.24 
 
 		 187 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3228  BioY protein  47.28 
 
 		 201 aa  131  6.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  42.7 
 
 		 187 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3464  BioY protein  49.15 
 
 		 205 aa  129  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4131  BioY protein  45.81 
 
 		 189 aa  125  5e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0501  BioY protein  45.41 
 
 		 187 aa  125  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0382459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5281  BioY protein  49.46 
 
 		 202 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.170405  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5370  BioY protein  49.46 
 
 		 202 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5660  BioY protein  49.46 
 
 		 202 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  42.78 
 
 		 189 aa  120  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1004  biotin synthesis BioY protein  42.93 
 
 		 187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2113  BioY protein  44.81 
 
 		 224 aa  116  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0646325  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2911  BioY protein  51.7 
 
 		 202 aa  115  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1732  BioY protein  48.32 
 
 		 208 aa  115  6.9999999999999995e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1529  BioY protein  47.51 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  42.29 
 
 		 184 aa  112  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  37.24 
 
 		 191 aa  112  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  36.56 
 
 		 191 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000070307  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  42.46 
 
 		 192 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  36.02 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1193  biotin transport protein BioY  40.43 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  42.35 
 
 		 187 aa  106  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2307  BioY protein  38.98 
 
 		 184 aa  105  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.366824  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2349  BioY protein  38.98 
 
 		 184 aa  105  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  43.26 
 
 		 199 aa  104  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2320  BioY protein  43.33 
 
 		 180 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1068  BioY protein  43.29 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3331  bioY family protein  37.63 
 
 		 191 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000423922  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3640  bioY family protein  37.63 
 
 		 191 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  36.02 
 
 		 182 aa  99.4  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000303529  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3420  bioY family protein  37.1 
 
 		 191 aa  98.2  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000218504  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3381  bioY family protein  37.1 
 
 		 191 aa  98.2  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.96357e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3689  bioY family protein  37.1 
 
 		 191 aa  98.2  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000593466  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  38.98 
 
 		 179 aa  98.2  9e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1864  BioY family protein  34.43 
 
 		 182 aa  97.4  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1855  BioY protein  38.8 
 
 		 216 aa  97.4  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  34.15 
 
 		 231 aa  97.8  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  38.83 
 
 		 197 aa  96.7  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3659  bioY family protein  36.02 
 
 		 191 aa  94  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00282906  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  38.24 
 
 		 192 aa  94  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5454  BioY protein  46.63 
 
 		 215 aa  92.8  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0263826  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3386  BioY protein  44.44 
 
 		 182 aa  93.2  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.812512  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3737  bioY family protein  36.56 
 
 		 191 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.776545  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  39.41 
 
 		 197 aa  92.8  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  37.91 
 
 		 189 aa  92.4  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3659  BioY protein  46.98 
 
 		 179 aa  92.4  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1953  hypothetical protein  33.9 
 
 		 189 aa  87.4  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.327178  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4601  BioY protein  34.78 
 
 		 197 aa  87.8  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440698  normal  0.800249 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  33.17 
 
 		 182 aa  87.8  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012911  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1681  BioY protein  40.32 
 
 		 225 aa  86.7  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0996  BioY protein  39.18 
 
 		 191 aa  86.3  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0230  BioY protein  39.78 
 
 		 204 aa  85.1  7e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.949273  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  39.13 
 
 		 169 aa  84.7  8e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  39.13 
 
 		 169 aa  84.7  8e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  36.31 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0991  BioY protein  35.43 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1515  bioY family protein  35.71 
 
 		 184 aa  84  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00248245  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1200  BioY family protein  33.33 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000053254 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  36.88 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0463  BioY family protein  34.64 
 
 		 179 aa  82  0.000000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0398  BioY family protein  31.07 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000949175  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21840  hypothetical protein  37.63 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3349  BioY protein  41.4 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0733  BioY protein  34.83 
 
 		 190 aa  81.3  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.307469  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  30.43 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000266759  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0516  hypothetical protein  33.33 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0355774  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0233  BioY protein  39.44 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  37.8 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  32.4 
 
 		 178 aa  77.8  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3071  BioY protein  45.33 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2875  BioY protein  34.54 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000912957  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  28.35 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1198  BioY protein  34.92 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2319  BioY protein  38.25 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  39.39 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1540  BioY protein  38.25 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4329  BioY protein  36.54 
 
 		 212 aa  74.7  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.373185 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  30.91 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  36.07 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1651  BioY family protein  30.54 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000463296  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20560  hypothetical protein  37.77 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  33.84 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1123  BioY protein  35.2 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.432616  normal  0.483731 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  34.78 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_967  biotin biosynthesis protein BioY  35.88 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000844147  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1206  bioY family protein  33.61 
 
 		 175 aa  70.5  0.00000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0995  BioY protein  37.06 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2901  BioY protein  37.62 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000326686  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1333  BioY protein  44.06 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.692637  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  27.87 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269732  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0169  BioY protein  31.28 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000989963  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1630  hypothetical protein  38.75 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3020  BioY protein  32.62 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  36.81 
 
 		 182 aa  67.8  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5033  BioY protein  43.26 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2134  putative BioY protein  34.71 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2330  BioY protein  36.69 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3528  BioY protein  32.97 
 
 		 198 aa  67  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>