173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1515 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1515  bioY family protein  100 
 
 		 184 aa  352  1e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00248245  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0243  BioY protein  53.89 
 
 		 190 aa  177  1e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00131705  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  52.25 
 
 		 192 aa  176  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269732  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  40.11 
 
 		 187 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4332  BioY protein  45.51 
 
 		 188 aa  142  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000491401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2947  BioY protein  45.81 
 
 		 187 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000305792  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0169  BioY protein  41.06 
 
 		 187 aa  117  7e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000989963  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3020  BioY protein  39.89 
 
 		 201 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  41.24 
 
 		 184 aa  112  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2875  BioY protein  36.56 
 
 		 202 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000912957  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  41.61 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  39.89 
 
 		 169 aa  98.2  6e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  39.89 
 
 		 169 aa  98.2  6e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0243  BioY protein  43.71 
 
 		 182 aa  97.1  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.360915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3528  BioY protein  35.52 
 
 		 198 aa  97.1  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  36.36 
 
 		 187 aa  96.7  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4627  biotin synthesis BioY protein  36.49 
 
 		 197 aa  87.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.33055e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5028  bioY family protein  36.49 
 
 		 197 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5056  bioY family protein  36.49 
 
 		 197 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.745684  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5061  bioY family protein  35.81 
 
 		 197 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4649  biotin synthesis BioY protein  35.81 
 
 		 197 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000112597  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5049  bioY family protein  36.49 
 
 		 197 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.925565  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  34.24 
 
 		 187 aa  86.3  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4739  BioY protein  34.64 
 
 		 197 aa  85.9  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000101818  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0998  BioY protein  36.84 
 
 		 182 aa  85.5  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000197008  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4787  bioY family protein  35.81 
 
 		 197 aa  85.5  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000360294  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5150  bioY family protein  35.81 
 
 		 197 aa  85.5  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85197  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0185  bioY family protein  35.81 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  35.71 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  44.53 
 
 		 167 aa  84  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000111141  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  45.79 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  33.15 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  29.67 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  38.26 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  30.22 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000070307  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0108  hypothetical protein  34 
 
 		 198 aa  80.1  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.307903  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0302  hypothetical protein  31.69 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  31.32 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  38.27 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8405  BioY family protein  40.32 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  28.8 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0610  BioY protein  40.94 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775885  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  34.15 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4972  BioY protein  41.38 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.867854 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  34.29 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000266759  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  35.88 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012911  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3737  bioY family protein  31.32 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.776545  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2901  BioY protein  45.65 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000326686  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0140  BioY protein  43 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000411922 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1004  biotin synthesis BioY protein  36.63 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0143  BioY protein  43 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  32.24 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0996  BioY protein  32.64 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  32.91 
 
 		 197 aa  71.2  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3420  bioY family protein  31.32 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000218504  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3381  bioY family protein  31.32 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.96357e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3689  bioY family protein  31.32 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000593466  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  34.29 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  33.53 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  35.81 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  34.1 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3331  bioY family protein  31.32 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000423922  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3640  bioY family protein  31.32 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3532  BioY protein  37.29 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.173821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  30.17 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000303529  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  35.29 
 
 		 192 aa  67.8  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  33.93 
 
 		 199 aa  67.8  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1530  BioY protein  35.82 
 
 		 206 aa  67.8  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4131  BioY protein  33.9 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1529  BioY protein  34.76 
 
 		 188 aa  67  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2329  BioY protein  33.82 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1651  BioY family protein  30.34 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000463296  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3005  BioY protein  32.87 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.312874  normal  0.884214 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16541  hypothetical protein  32.82 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.724411 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3659  bioY family protein  30.77 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00282906  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  42.86 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3444  BioY protein  35.29 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1647  BioY protein  32.2 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1212  BioY protein  33.94 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1193  biotin transport protein BioY  32.74 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4207  BioY protein  34.82 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1788  BioY protein  35.12 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  30.86 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  32.58 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0357  hypothetical protein  37.31 
 
 		 182 aa  62  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1068  BioY protein  31.98 
 
 		 192 aa  62  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0132  hypothetical protein  34.81 
 
 		 176 aa  62  0.000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2476  BioY protein  35.16 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  38.46 
 
 		 231 aa  61.2  0.000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02210  hypothetical protein  34.11 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4638  BioY protein  30.66 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1727  BioY protein  39.76 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0233  BioY protein  27.62 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0991  BioY protein  34.11 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  30.71 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0230  BioY protein  31.85 
 
 		 204 aa  57.8  0.00000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.949273  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  29.26 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0539  BioY protein  41.58 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.252714  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2113  BioY protein  31.4 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0646325  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2349  BioY protein  31.87 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>