173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2901 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2901  BioY protein  100 
 
 		 208 aa  385  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000326686  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  45.86 
 
 		 187 aa  134  7.000000000000001e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  50 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  39.33 
 
 		 182 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012911  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  38.01 
 
 		 184 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  41.01 
 
 		 184 aa  116  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  39.23 
 
 		 167 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000111141  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  37.3 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0991  BioY protein  44.27 
 
 		 199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  43.11 
 
 		 189 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  44.44 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  49.68 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2735  BioY protein  45.75 
 
 		 195 aa  102  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  39.78 
 
 		 179 aa  101  9e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  47.3 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  38.04 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  46.95 
 
 		 203 aa  97.8  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  41.57 
 
 		 169 aa  96.7  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  41.57 
 
 		 169 aa  96.7  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  43.26 
 
 		 187 aa  95.9  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  44.64 
 
 		 197 aa  95.1  7e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  36.41 
 
 		 192 aa  94.4  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269732  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  35.26 
 
 		 184 aa  93.2  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000266759  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1004  biotin synthesis BioY protein  40.48 
 
 		 187 aa  93.2  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  44.59 
 
 		 205 aa  94  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  35.84 
 
 		 182 aa  94  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  39.49 
 
 		 178 aa  92.4  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02210  hypothetical protein  35 
 
 		 194 aa  92  5e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  41.4 
 
 		 169 aa  91.3  9e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1647  BioY protein  45.45 
 
 		 169 aa  90.9  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  42.95 
 
 		 207 aa  89.4  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  43.53 
 
 		 189 aa  89  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1515  bioY family protein  33.15 
 
 		 184 aa  88.6  6e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00248245  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0886  BioY protein  37.99 
 
 		 235 aa  88.2  8e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.452064  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0230  BioY protein  43.87 
 
 		 204 aa  87.4  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.949273  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1206  bioY family protein  37.72 
 
 		 175 aa  86.7  2e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0659  BioY protein  35.66 
 
 		 171 aa  85.5  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.728186  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0398  BioY family protein  35.43 
 
 		 179 aa  85.1  6e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000949175  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0996  BioY protein  43.02 
 
 		 191 aa  85.1  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  40.78 
 
 		 182 aa  85.1  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1681  BioY protein  46.41 
 
 		 225 aa  84.7  9e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2307  BioY protein  32.37 
 
 		 184 aa  84.7  9e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.366824  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2349  BioY protein  32.37 
 
 		 184 aa  84.7  9e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  45.51 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0243  BioY protein  37.5 
 
 		 190 aa  84  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00131705  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0169  BioY protein  36.84 
 
 		 187 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000989963  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0463  BioY family protein  37.06 
 
 		 179 aa  83.6  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1529  BioY protein  42.24 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  37.63 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  35.47 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  34.68 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000070307  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3107  Na+/H+ antiporter  38.89 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  43.18 
 
 		 182 aa  81.3  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  35.26 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0610  BioY protein  38.51 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775885  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_967  biotin biosynthesis protein BioY  34.32 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000844147  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0575  BioY protein  43.04 
 
 		 185 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1198  BioY protein  40.96 
 
 		 191 aa  79.3  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  41.14 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0501  BioY protein  38.55 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0382459  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1864  BioY family protein  29.89 
 
 		 182 aa  77.4  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3020  BioY protein  39.01 
 
 		 201 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1597  hypothetical protein  40.27 
 
 		 177 aa  77.4  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839094  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0995  BioY protein  31.75 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2947  BioY protein  43.48 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000305792  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0498  BioY protein  44.16 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.583343 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5049  bioY family protein  40.95 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.925565  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3528  BioY protein  45.16 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1788  BioY protein  38.3 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5056  bioY family protein  33.8 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.745684  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  38.01 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1193  biotin transport protein BioY  33.87 
 
 		 184 aa  75.5  0.0000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4739  BioY protein  39.05 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000101818  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5061  bioY family protein  33.8 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0185  bioY family protein  40 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4787  bioY family protein  40 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000360294  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4627  biotin synthesis BioY protein  40 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.33055e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4649  biotin synthesis BioY protein  40 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000112597  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5150  bioY family protein  40 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85197  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5028  bioY family protein  40 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02230  hypothetical protein  40.49 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1184  BioY family protein  34.32 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000330178  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3005  BioY protein  40.37 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.312874  normal  0.884214 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0357  hypothetical protein  31.52 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1432  BioY protein  43.23 
 
 		 185 aa  74.3  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4601  BioY protein  40.57 
 
 		 197 aa  74.7  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440698  normal  0.800249 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0516  hypothetical protein  32.94 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0355774  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  37.97 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0539  BioY protein  45.62 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.252714  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  34.92 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_004310  BR1719  BioY family protein  39.16 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1662  BioY family protein  39.16 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4638  BioY protein  44.78 
 
 		 203 aa  72  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3688  BioY protein  36.99 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.983357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1855  BioY protein  36.54 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1651  BioY family protein  32.42 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000463296  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2875  BioY protein  34.67 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000912957  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21370  hypothetical protein  41.67 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.283174  normal  0.337859 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  43.07 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0132  hypothetical protein  33.33 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>