158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0498 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0498  BioY protein  100 
 
 
193 aa  357  5e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.583343 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2735  BioY protein  57.22 
 
 
195 aa  171  6.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0886  BioY protein  50 
 
 
235 aa  151  4e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.452064  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  38.29 
 
 
184 aa  103  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  40 
 
 
199 aa  102  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  41.25 
 
 
187 aa  102  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  41.48 
 
 
179 aa  96.3  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  44.37 
 
 
203 aa  93.2  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  45.1 
 
 
192 aa  87.8  8e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  37.58 
 
 
189 aa  86.3  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  33.88 
 
 
187 aa  85.9  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  41.88 
 
 
189 aa  85.5  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  36.6 
 
 
231 aa  84.7  7e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  38 
 
 
197 aa  81.3  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1651  BioY family protein  33.13 
 
 
203 aa  80.1  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000463296  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  39.16 
 
 
205 aa  80.1  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  39.75 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4638  BioY protein  44.44 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  32.54 
 
 
184 aa  78.2  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  39.16 
 
 
206 aa  78.2  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  35.8 
 
 
191 aa  77.8  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  32.69 
 
 
182 aa  77.8  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012911  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1864  BioY family protein  32 
 
 
182 aa  76.6  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  32.54 
 
 
178 aa  76.6  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2307  BioY protein  29.88 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.366824  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2349  BioY protein  29.88 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2911  BioY protein  46.1 
 
 
202 aa  75.5  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0230  BioY protein  36.65 
 
 
204 aa  74.7  0.0000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.949273  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0610  BioY protein  55.07 
 
 
174 aa  74.7  0.0000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775885  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2901  BioY protein  47.31 
 
 
208 aa  74.7  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000326686  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  34.57 
 
 
191 aa  74.7  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000070307  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  34.88 
 
 
191 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3349  BioY protein  40.74 
 
 
207 aa  73.6  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  38.16 
 
 
207 aa  73.2  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4601  BioY protein  33.89 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440698  normal  0.800249 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  40.24 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0996  BioY protein  37.29 
 
 
191 aa  71.6  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2113  BioY protein  38.82 
 
 
224 aa  71.6  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0646325  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8405  BioY family protein  40.11 
 
 
189 aa  71.6  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21840  hypothetical protein  38.67 
 
 
212 aa  71.6  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  37.57 
 
 
210 aa  71.2  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1529  BioY protein  38.61 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0508  BioY protein  43.09 
 
 
194 aa  70.9  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  34.57 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  31.82 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000303529  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  36.31 
 
 
187 aa  68.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3011  BioY protein  42.21 
 
 
187 aa  68.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131178  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  41.5 
 
 
195 aa  68.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2445  BioY protein  44.07 
 
 
198 aa  68.6  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000283482  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  33.78 
 
 
167 aa  68.2  0.00000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000111141  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1123  BioY protein  35.62 
 
 
197 aa  67.8  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.432616  normal  0.483731 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  35.29 
 
 
187 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0539  BioY protein  40.59 
 
 
193 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.252714  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2954  BioY family protein  48.15 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.716157  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3444  BioY protein  36.6 
 
 
181 aa  65.5  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  33.56 
 
 
182 aa  65.5  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3737  bioY family protein  35.26 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.776545  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2889  BioY protein  41.49 
 
 
197 aa  64.7  0.0000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  32.12 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  32.12 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3659  bioY family protein  35.93 
 
 
191 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00282906  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4207  BioY protein  37.91 
 
 
195 aa  63.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2320  BioY protein  36.69 
 
 
180 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1855  BioY protein  35.86 
 
 
216 aa  63.2  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  36.76 
 
 
192 aa  62.8  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269732  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3331  bioY family protein  35.47 
 
 
191 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000423922  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3640  bioY family protein  35.47 
 
 
191 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3005  BioY protein  36.25 
 
 
200 aa  62.4  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.312874  normal  0.884214 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  36.63 
 
 
189 aa  62.4  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0516  hypothetical protein  33.11 
 
 
180 aa  62  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0355774  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2330  BioY protein  39.6 
 
 
196 aa  61.6  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1004  biotin synthesis BioY protein  33.74 
 
 
187 aa  61.6  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0463  BioY family protein  33.33 
 
 
179 aa  60.5  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1200  BioY family protein  32.21 
 
 
216 aa  60.8  0.00000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000053254 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  35.37 
 
 
192 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_967  biotin biosynthesis protein BioY  29.38 
 
 
215 aa  60.5  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000844147  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1515  bioY family protein  29.82 
 
 
184 aa  59.7  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00248245  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2319  BioY protein  33.7 
 
 
194 aa  59.3  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1193  biotin transport protein BioY  33.53 
 
 
184 aa  59.7  0.00000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1198  BioY protein  35.33 
 
 
191 aa  59.3  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3688  BioY protein  39.74 
 
 
190 aa  59.7  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.983357  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0659  BioY protein  28.97 
 
 
171 aa  59.7  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.728186  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21370  hypothetical protein  37.58 
 
 
205 aa  58.9  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.283174  normal  0.337859 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1540  BioY protein  33.7 
 
 
194 aa  58.9  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0568  BioY protein  40 
 
 
193 aa  58.9  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.936427  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1681  BioY protein  39.16 
 
 
225 aa  58.9  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3420  bioY family protein  34.3 
 
 
191 aa  58.5  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000218504  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3381  bioY family protein  34.3 
 
 
191 aa  58.5  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.96357e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3689  bioY family protein  34.3 
 
 
191 aa  58.5  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000593466  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1597  hypothetical protein  31.97 
 
 
177 aa  58.5  0.00000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839094  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0726  biotin synthase  35.07 
 
 
179 aa  58.5  0.00000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000014315  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0575  BioY protein  38.56 
 
 
185 aa  58.5  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  30.28 
 
 
184 aa  58.2  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000266759  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  35.82 
 
 
187 aa  57.4  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1953  hypothetical protein  24.58 
 
 
189 aa  57.4  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.327178  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1647  BioY protein  36.84 
 
 
169 aa  57.4  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4131  BioY protein  34.94 
 
 
189 aa  56.6  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2356  BioY protein  41.4 
 
 
200 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1206  bioY family protein  32.14 
 
 
175 aa  55.5  0.0000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0571  BioY protein  40 
 
 
193 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>