159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3688 on replicon NC_009955
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009955  Dshi_3688  BioY protein  100 
 
 		 190 aa  355  1.9999999999999998e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.983357  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1719  BioY family protein  44.07 
 
 		 191 aa  122  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1662  BioY family protein  44.07 
 
 		 191 aa  122  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1198  BioY protein  43.75 
 
 		 191 aa  120  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1274  BioY protein  47.85 
 
 		 196 aa  97.8  9e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  43.05 
 
 		 179 aa  92  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  36.96 
 
 		 197 aa  90.1  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  39.62 
 
 		 203 aa  89.7  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  40.49 
 
 		 192 aa  89  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  39.24 
 
 		 206 aa  87  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  41.61 
 
 		 205 aa  85.1  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  38.19 
 
 		 187 aa  84.3  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  35.59 
 
 		 169 aa  82.8  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  35.59 
 
 		 169 aa  82.8  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4329  BioY protein  36.9 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.373185 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  38.1 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  35.71 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0726  biotin synthase  40.91 
 
 		 179 aa  80.1  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000014315  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  37.82 
 
 		 197 aa  79.7  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  35.54 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  38.27 
 
 		 167 aa  77  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000111141  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  35.09 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2445  BioY protein  38.55 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000283482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  37.09 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  38.36 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3011  BioY protein  36.56 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131178  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  31.64 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2954  BioY family protein  45.24 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.716157  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0233  BioY protein  31.36 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  33.55 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0610  BioY protein  34.59 
 
 		 174 aa  73.2  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775885  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1496  hypothetical protein  31.06 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.41192 
 
 
-
 
NC_002978  WD1206  bioY family protein  33.33 
 
 		 175 aa  72  0.000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0357  hypothetical protein  33.53 
 
 		 182 aa  72  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  36.2 
 
 		 169 aa  72  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3349  BioY protein  38.62 
 
 		 207 aa  72  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0575  BioY protein  34.93 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  37.42 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  34.86 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1123  BioY protein  40.82 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.432616  normal  0.483731 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  36.94 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  32.45 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012911  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02210  hypothetical protein  35.19 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3107  Na+/H+ antiporter  31.93 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2911  BioY protein  45.9 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2113  BioY protein  37.33 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0646325  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  30.77 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0132  hypothetical protein  34.91 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2735  BioY protein  33.33 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1864  BioY family protein  43.53 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  42.17 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0991  BioY protein  35.19 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0230  BioY protein  35.25 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.949273  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  37.5 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  38.19 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1647  BioY protein  38.22 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0693  BioY protein  32.69 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21840  hypothetical protein  35.16 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1855  BioY protein  35.37 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2320  BioY protein  37.5 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  38.82 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  28.82 
 
 		 184 aa  64.3  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000266759  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  36.54 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  35.2 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0506  BioY family protein  31.21 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.529292  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1068  BioY protein  41.59 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0776  BioY protein  35.06 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.656127  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0509  BioY family protein  31.21 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4638  BioY protein  35.34 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1529  BioY protein  39.81 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3745  BioY protein  34.71 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421582  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1651  BioY family protein  38.24 
 
 		 203 aa  62  0.000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000463296  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2134  putative BioY protein  39.6 
 
 		 197 aa  62  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0886  BioY protein  32.35 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.452064  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1788  BioY protein  35.1 
 
 		 169 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1924  BioY family protein  35.34 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1681  BioY protein  35.85 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1597  hypothetical protein  29.94 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839094  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2330  BioY protein  33.52 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4207  BioY protein  35.29 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2307  BioY protein  34.34 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.366824  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2349  BioY protein  34.34 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  31.79 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0463  BioY family protein  39.05 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  39.08 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000070307  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0996  BioY protein  34.71 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  39.08 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4601  BioY protein  34.23 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440698  normal  0.800249 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  37.93 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1432  BioY protein  32.73 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  33.8 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3528  BioY protein  38.96 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1732  BioY protein  31.91 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1200  BioY family protein  37.27 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000053254 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0516  hypothetical protein  40.85 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0355774  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3020  BioY protein  35.85 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2875  BioY protein  33.33 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000912957  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0638  BioY family protein  33.13 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.532905  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8405  BioY family protein  38.61 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1704  BioY protein  41.18 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00848972  normal  0.900765 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>