158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0463 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0463  BioY family protein  100 
 
 
179 aa  343  5e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1953  hypothetical protein  47.16 
 
 
189 aa  159  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.327178  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0398  BioY family protein  47.67 
 
 
179 aa  155  4e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000949175  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0733  BioY protein  46.29 
 
 
190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.307469  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0516  hypothetical protein  48.07 
 
 
180 aa  138  4.999999999999999e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0355774  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2307  BioY protein  42.53 
 
 
184 aa  137  7e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.366824  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2349  BioY protein  42.53 
 
 
184 aa  137  7e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1864  BioY family protein  42.53 
 
 
182 aa  134  8e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  41.81 
 
 
191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  42.37 
 
 
191 aa  129  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000070307  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  41.81 
 
 
191 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1004  biotin synthesis BioY protein  43.64 
 
 
187 aa  120  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  42.29 
 
 
187 aa  117  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  42.29 
 
 
187 aa  115  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3659  bioY family protein  40.68 
 
 
191 aa  112  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00282906  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3420  bioY family protein  41.81 
 
 
191 aa  111  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000218504  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3381  bioY family protein  41.81 
 
 
191 aa  111  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.96357e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3689  bioY family protein  41.81 
 
 
191 aa  111  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000593466  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3737  bioY family protein  41.81 
 
 
191 aa  111  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.776545  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3331  bioY family protein  41.81 
 
 
191 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000423922  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3640  bioY family protein  41.81 
 
 
191 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1529  BioY protein  45.06 
 
 
188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  45.73 
 
 
182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012911  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  33.16 
 
 
231 aa  103  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  37.08 
 
 
192 aa  101  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1193  biotin transport protein BioY  40.23 
 
 
184 aa  100  9e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  38.12 
 
 
189 aa  100  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1068  BioY protein  37.2 
 
 
192 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  38.24 
 
 
184 aa  99  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4601  BioY protein  35.59 
 
 
197 aa  99.4  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440698  normal  0.800249 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3228  BioY protein  39.05 
 
 
201 aa  95.9  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0501  BioY protein  44.44 
 
 
187 aa  95.1  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0382459  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3464  BioY protein  38.46 
 
 
205 aa  94.4  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2320  BioY protein  38.82 
 
 
180 aa  91.3  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2319  BioY protein  38.76 
 
 
194 aa  87  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  37.89 
 
 
179 aa  87  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1540  BioY protein  38.76 
 
 
194 aa  86.3  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5281  BioY protein  40.27 
 
 
202 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.170405  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5370  BioY protein  40.27 
 
 
202 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5660  BioY protein  40.27 
 
 
202 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3659  BioY protein  41.5 
 
 
179 aa  84.3  7e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  35.59 
 
 
189 aa  83.6  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1855  BioY protein  35.85 
 
 
216 aa  83.6  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  34.64 
 
 
210 aa  82  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  39.57 
 
 
197 aa  81.6  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  35.63 
 
 
178 aa  80.9  0.000000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4131  BioY protein  34.41 
 
 
189 aa  80.9  0.000000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2113  BioY protein  36.05 
 
 
224 aa  80.5  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0646325  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1732  BioY protein  37.5 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  37.06 
 
 
205 aa  79  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  36.81 
 
 
199 aa  79  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1681  BioY protein  36.25 
 
 
225 aa  77  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  38.46 
 
 
169 aa  76.6  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2911  BioY protein  36.08 
 
 
202 aa  76.3  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  34.1 
 
 
187 aa  74.7  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3349  BioY protein  38.12 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2901  BioY protein  48.39 
 
 
208 aa  73.6  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000326686  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  36.36 
 
 
206 aa  70.9  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0357  hypothetical protein  34.83 
 
 
182 aa  70.9  0.000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  32.6 
 
 
184 aa  70.5  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  36.26 
 
 
182 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  37.66 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  52.78 
 
 
203 aa  69.7  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  35.5 
 
 
167 aa  68.9  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000111141  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5033  BioY protein  42.69 
 
 
191 aa  68.6  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301047  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3386  BioY protein  38.32 
 
 
182 aa  67.4  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.812512  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  36.92 
 
 
192 aa  67  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3071  BioY protein  38.78 
 
 
204 aa  67  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1123  BioY protein  46.25 
 
 
197 aa  65.1  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.432616  normal  0.483731 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2314  hypothetical protein  38.36 
 
 
222 aa  64.3  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.462217  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1651  BioY family protein  46.74 
 
 
203 aa  63.9  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000463296  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  31.49 
 
 
182 aa  63.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000303529  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2173  hypothetical protein  40.94 
 
 
181 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0233  BioY protein  32.39 
 
 
197 aa  62.8  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  31.21 
 
 
184 aa  63.2  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000266759  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0845  BioY protein  40.94 
 
 
181 aa  62.8  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  36.07 
 
 
187 aa  62  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  42.15 
 
 
169 aa  62  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  42.15 
 
 
169 aa  62  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2445  BioY protein  47.5 
 
 
198 aa  61.2  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000283482  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5454  BioY protein  37.13 
 
 
215 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0263826  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0726  biotin synthase  36.22 
 
 
179 aa  60.8  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000014315  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  48.72 
 
 
182 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3688  BioY protein  39.05 
 
 
190 aa  59.7  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.983357  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21840  hypothetical protein  30.72 
 
 
212 aa  59.3  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2954  BioY family protein  34.67 
 
 
180 aa  58.9  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.716157  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1788  BioY protein  30.29 
 
 
169 aa  58.9  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20560  hypothetical protein  34.83 
 
 
221 aa  58.9  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0169  BioY protein  34.86 
 
 
187 aa  58.2  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000989963  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  30.6 
 
 
187 aa  58.2  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0659  BioY protein  33.14 
 
 
171 aa  57.8  0.00000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.728186  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  31.03 
 
 
189 aa  57.8  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_004310  BR1719  BioY family protein  44.94 
 
 
191 aa  57.4  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1662  BioY family protein  44.94 
 
 
191 aa  57.4  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2005  BioY protein  43.29 
 
 
183 aa  56.2  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.319092  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1647  BioY protein  31.58 
 
 
169 aa  55.5  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1198  BioY protein  40.57 
 
 
191 aa  55.5  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1515  bioY family protein  32.45 
 
 
184 aa  55.1  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00248245  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1491  BioY protein  46.38 
 
 
220 aa  54.7  0.0000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.865608  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  28.36 
 
 
207 aa  54.7  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>