159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1432 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1432  BioY protein  100 
 
 		 185 aa  336  9.999999999999999e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0575  BioY protein  84.32 
 
 		 185 aa  259  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1924  BioY family protein  80.69 
 
 		 145 aa  217  8.999999999999998e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3107  Na+/H+ antiporter  60.87 
 
 		 192 aa  175  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  51.32 
 
 		 192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0506  BioY family protein  47.65 
 
 		 199 aa  122  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.529292  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0509  BioY family protein  47.65 
 
 		 199 aa  122  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0693  BioY protein  46.11 
 
 		 199 aa  121  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0776  BioY protein  43.86 
 
 		 200 aa  115  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.656127  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  46.39 
 
 		 195 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  44.51 
 
 		 199 aa  102  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  43.23 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  41.88 
 
 		 169 aa  100  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  41.88 
 
 		 169 aa  100  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1198  BioY protein  41.67 
 
 		 191 aa  99  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  36.99 
 
 		 197 aa  97.1  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  43.4 
 
 		 206 aa  97.1  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  37.04 
 
 		 184 aa  96.7  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  43.67 
 
 		 205 aa  94.7  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_004310  BR1719  BioY family protein  38.69 
 
 		 191 aa  91.3  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1662  BioY family protein  38.69 
 
 		 191 aa  91.3  7e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3011  BioY protein  45.45 
 
 		 187 aa  90.9  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131178  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0991  BioY protein  41.81 
 
 		 199 aa  90.5  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  40.34 
 
 		 197 aa  89.7  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0230  BioY protein  40 
 
 		 204 aa  87  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.949273  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  42.94 
 
 		 207 aa  87  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3745  BioY protein  32.79 
 
 		 190 aa  85.5  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421582  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2445  BioY protein  40.94 
 
 		 198 aa  85.1  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000283482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  39.88 
 
 		 178 aa  84.3  8e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0995  BioY protein  36.36 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0996  BioY protein  38.8 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1704  BioY protein  37.43 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00848972  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_967  biotin biosynthesis protein BioY  36.36 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000844147  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2134  putative BioY protein  35.33 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_002978  WD1206  bioY family protein  34.76 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  35.85 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  37.66 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  34.32 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000266759  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4329  BioY protein  39.38 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.373185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8405  BioY family protein  38.27 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1123  BioY protein  35.75 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.432616  normal  0.483731 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  38.2 
 
 		 187 aa  77.8  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  38.19 
 
 		 169 aa  77.4  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3688  BioY protein  34.24 
 
 		 190 aa  77.4  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.983357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1496  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  77.4  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.41192 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02210  hypothetical protein  38.56 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0610  BioY protein  38.06 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775885  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2947  BioY protein  37.65 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000305792  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  41.03 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0901  BioY protein  41.72 
 
 		 208 aa  74.3  0.0000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  39.04 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1274  BioY protein  41.5 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0638  BioY family protein  35.53 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.532905  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  57.32 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1200  BioY family protein  35.86 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000053254 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3005  BioY protein  37.08 
 
 		 200 aa  72  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.312874  normal  0.884214 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  41.26 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0357  hypothetical protein  35.53 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  32.69 
 
 		 167 aa  71.2  0.000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000111141  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  34.81 
 
 		 184 aa  70.9  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  37.69 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269732  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0243  BioY protein  36.46 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00131705  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1184  BioY family protein  36.36 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000330178  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0233  BioY protein  36.71 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1597  hypothetical protein  33.14 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839094  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  34.59 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1788  BioY protein  35.44 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  34.69 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012911  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2735  BioY protein  37.18 
 
 		 195 aa  67  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0539  BioY protein  47.92 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.252714  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0132  hypothetical protein  37.8 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02230  hypothetical protein  37.95 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3444  BioY protein  32.8 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4131  BioY protein  37.84 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0659  BioY protein  33.77 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.728186  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0998  BioY protein  35.29 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000197008  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0169  BioY protein  32.58 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000989963  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  34.97 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  32.64 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000303529  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  35.71 
 
 		 231 aa  64.3  0.0000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1647  BioY protein  36.17 
 
 		 169 aa  63.9  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1651  BioY family protein  34.43 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000463296  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  39.11 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1855  BioY protein  36 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0726  biotin synthase  40.77 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000014315  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  35.29 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4332  BioY protein  39.42 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000491401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  39.16 
 
 		 187 aa  62  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  39.76 
 
 		 187 aa  62  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2889  BioY protein  48.1 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2875  BioY protein  36.36 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000912957  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4638  BioY protein  39.55 
 
 		 203 aa  61.2  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  36.14 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0568  BioY protein  53.06 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.936427  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2954  BioY family protein  44.83 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.716157  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1068  BioY protein  36.52 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1515  bioY family protein  36.15 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00248245  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1004  biotin synthesis BioY protein  36.75 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01740  hypothetical protein  46.43 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.770223 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0498  BioY protein  39.74 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.583343 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>