173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0991 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0991  BioY protein  100 
 
 
199 aa  374  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  41.8 
 
 
197 aa  130  9e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2086  BioY protein  45.6 
 
 
197 aa  128  5.0000000000000004e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00325943  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  43.23 
 
 
199 aa  122  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0230  BioY protein  44.39 
 
 
204 aa  122  5e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.949273  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  51.01 
 
 
206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  42.51 
 
 
197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_967  biotin biosynthesis protein BioY  36.79 
 
 
215 aa  111  6e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000844147  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0996  BioY protein  44.91 
 
 
191 aa  109  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  47.27 
 
 
192 aa  109  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  45.18 
 
 
203 aa  109  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  48.3 
 
 
205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0995  BioY protein  36.27 
 
 
215 aa  107  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1184  BioY family protein  35.64 
 
 
215 aa  106  3e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000330178  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  42.11 
 
 
184 aa  103  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  38.95 
 
 
187 aa  100  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  41.18 
 
 
189 aa  99.4  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  36.67 
 
 
187 aa  96.3  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  41.36 
 
 
182 aa  96.3  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012911  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4638  BioY protein  45.86 
 
 
203 aa  95.9  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  43.05 
 
 
178 aa  95.5  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  43.98 
 
 
169 aa  94.7  8e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  43.98 
 
 
169 aa  94.7  8e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  35.98 
 
 
187 aa  94  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  40 
 
 
207 aa  93.6  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1123  BioY protein  41.01 
 
 
197 aa  93.2  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.432616  normal  0.483731 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3005  BioY protein  42.86 
 
 
200 aa  91.7  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.312874  normal  0.884214 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  40.57 
 
 
195 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3745  BioY protein  34.62 
 
 
190 aa  89.7  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421582  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  36.84 
 
 
179 aa  89.4  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  39.73 
 
 
184 aa  89  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000266759  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4329  BioY protein  41.67 
 
 
212 aa  89  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.373185 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  33.33 
 
 
182 aa  88.6  6e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  35.43 
 
 
210 aa  85.1  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1004  biotin synthesis BioY protein  37.27 
 
 
187 aa  83.6  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  43.48 
 
 
169 aa  83.6  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0501  BioY protein  39.13 
 
 
187 aa  83.6  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0382459  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4207  BioY protein  42.98 
 
 
195 aa  82.4  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2901  BioY protein  48.6 
 
 
208 aa  81.6  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000326686  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8405  BioY family protein  41.4 
 
 
189 aa  81.3  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1647  BioY protein  41.51 
 
 
169 aa  81.3  0.000000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  30.34 
 
 
184 aa  80.5  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  40.96 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1788  BioY protein  40.99 
 
 
169 aa  79.7  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  33.94 
 
 
189 aa  80.5  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0575  BioY protein  41.03 
 
 
185 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2113  BioY protein  37.8 
 
 
224 aa  78.6  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0646325  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  35.86 
 
 
191 aa  79  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2330  BioY protein  38.99 
 
 
196 aa  78.2  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  35.86 
 
 
191 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3444  BioY protein  36.31 
 
 
181 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0776  BioY protein  38.29 
 
 
200 aa  77  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.656127  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  35.17 
 
 
191 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000070307  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  40.24 
 
 
182 aa  77  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4131  BioY protein  41.01 
 
 
189 aa  76.3  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  39.29 
 
 
192 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  34.66 
 
 
187 aa  76.3  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  40 
 
 
182 aa  76.3  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1198  BioY protein  40.4 
 
 
191 aa  75.9  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1719  BioY family protein  35.93 
 
 
191 aa  75.1  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1662  BioY family protein  35.93 
 
 
191 aa  75.1  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  31.71 
 
 
182 aa  75.1  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000303529  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1068  BioY protein  36.76 
 
 
192 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2307  BioY protein  32.19 
 
 
184 aa  73.6  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.366824  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2349  BioY protein  32.19 
 
 
184 aa  73.6  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0506  BioY family protein  38.41 
 
 
199 aa  72.8  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.529292  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02210  hypothetical protein  36.31 
 
 
194 aa  72.8  0.000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0509  BioY family protein  38.41 
 
 
199 aa  72.8  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3107  Na+/H+ antiporter  34.9 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2735  BioY protein  36.02 
 
 
195 aa  72  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  33.14 
 
 
231 aa  72  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0693  BioY protein  38.04 
 
 
199 aa  72  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1496  hypothetical protein  32.92 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.41192 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1200  BioY family protein  37.42 
 
 
216 aa  72  0.000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000053254 
 
 
-
 
NC_002620  TC0638  BioY family protein  35.03 
 
 
196 aa  71.6  0.000000000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.532905  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  36.99 
 
 
187 aa  71.6  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1597  hypothetical protein  37.27 
 
 
177 aa  70.9  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839094  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0659  BioY protein  39.42 
 
 
171 aa  70.5  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.728186  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3659  BioY protein  38.36 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1206  bioY family protein  36 
 
 
175 aa  69.3  0.00000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3688  BioY protein  32.29 
 
 
190 aa  69.3  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.983357  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1432  BioY protein  43.04 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  36.77 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0132  hypothetical protein  39.57 
 
 
176 aa  68.9  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1651  BioY family protein  34.68 
 
 
203 aa  68.2  0.00000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000463296  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21370  hypothetical protein  35.71 
 
 
205 aa  68.2  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.283174  normal  0.337859 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1924  BioY family protein  39.01 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3011  BioY protein  39.11 
 
 
187 aa  68.2  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131178  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1193  biotin transport protein BioY  34.08 
 
 
184 aa  68.2  0.00000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1864  BioY family protein  30.46 
 
 
182 aa  67.8  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2947  BioY protein  35.44 
 
 
187 aa  67.4  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000305792  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3659  bioY family protein  37.24 
 
 
191 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00282906  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2320  BioY protein  35.5 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3420  bioY family protein  36.55 
 
 
191 aa  67  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000218504  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3381  bioY family protein  36.55 
 
 
191 aa  67  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.96357e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  31.64 
 
 
192 aa  67  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269732  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3689  bioY family protein  36.55 
 
 
191 aa  67  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000593466  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  35.06 
 
 
167 aa  66.6  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000111141  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3737  bioY family protein  34.93 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.776545  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1681  BioY protein  40.43 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>