150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3444 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3444  BioY protein  100 
 
 
181 aa  353  6.999999999999999e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  43.21 
 
 
197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  37.93 
 
 
199 aa  99.4  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  45 
 
 
182 aa  89  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  38.75 
 
 
197 aa  89  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  35.88 
 
 
189 aa  88.2  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  39.86 
 
 
169 aa  87.8  8e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  39.86 
 
 
169 aa  87.8  8e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  36.59 
 
 
203 aa  84.7  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  38.86 
 
 
192 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  37.93 
 
 
187 aa  83.2  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3005  BioY protein  40.25 
 
 
200 aa  82  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.312874  normal  0.884214 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1123  BioY protein  31.75 
 
 
197 aa  82  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.432616  normal  0.483731 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2134  putative BioY protein  38.73 
 
 
197 aa  81.3  0.000000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  34.97 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  34.44 
 
 
179 aa  79.7  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1068  BioY protein  36.42 
 
 
192 aa  79  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  34.71 
 
 
207 aa  79  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  43.7 
 
 
231 aa  79  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  37.89 
 
 
192 aa  77.8  0.00000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21370  hypothetical protein  33.54 
 
 
205 aa  77.8  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.283174  normal  0.337859 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  32.8 
 
 
187 aa  77.4  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  36.96 
 
 
192 aa  77  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269732  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0996  BioY protein  37.8 
 
 
191 aa  76.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0991  BioY protein  36.31 
 
 
199 aa  75.9  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0230  BioY protein  36.97 
 
 
204 aa  75.5  0.0000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.949273  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4638  BioY protein  40.79 
 
 
203 aa  75.1  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2735  BioY protein  36.65 
 
 
195 aa  74.7  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2901  BioY protein  41.51 
 
 
208 aa  72.8  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000326686  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  33.9 
 
 
184 aa  72.4  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1704  BioY protein  38.19 
 
 
200 aa  71.6  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00848972  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  35.5 
 
 
195 aa  71.2  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3528  BioY protein  32 
 
 
198 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0498  BioY protein  34.87 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.583343 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3107  Na+/H+ antiporter  33.87 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1206  bioY family protein  34.36 
 
 
175 aa  68.9  0.00000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3349  BioY protein  34.87 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3011  BioY protein  35.43 
 
 
187 aa  68.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131178  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1515  bioY family protein  35.29 
 
 
184 aa  68.2  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00248245  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  33.93 
 
 
187 aa  68.6  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3745  BioY protein  28.57 
 
 
190 aa  68.2  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421582  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  32.34 
 
 
184 aa  67.8  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000266759  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1529  BioY protein  41.67 
 
 
188 aa  67  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1496  hypothetical protein  34.42 
 
 
165 aa  67  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.41192 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2445  BioY protein  35.46 
 
 
198 aa  66.2  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000283482  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  36.59 
 
 
205 aa  66.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  29.41 
 
 
182 aa  66.2  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012911  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  31.58 
 
 
210 aa  65.9  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4207  BioY protein  40.31 
 
 
195 aa  66.2  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0233  BioY protein  34.32 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0610  BioY protein  32.76 
 
 
174 aa  66.2  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775885  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  29.51 
 
 
182 aa  66.2  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1198  BioY protein  32.92 
 
 
191 aa  65.1  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3688  BioY protein  36.13 
 
 
190 aa  65.1  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.983357  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2330  BioY protein  34.86 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1719  BioY family protein  33.54 
 
 
191 aa  64.7  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1662  BioY family protein  33.54 
 
 
191 aa  64.7  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4787  bioY family protein  33.78 
 
 
197 aa  64.3  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000360294  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4627  biotin synthesis BioY protein  33.78 
 
 
197 aa  64.3  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.33055e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5150  bioY family protein  33.78 
 
 
197 aa  64.3  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85197  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5028  bioY family protein  33.78 
 
 
197 aa  64.3  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4649  biotin synthesis BioY protein  33.78 
 
 
197 aa  64.3  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000112597  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0357  hypothetical protein  37.41 
 
 
182 aa  64.3  0.0000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1004  biotin synthesis BioY protein  34.13 
 
 
187 aa  63.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  30.95 
 
 
167 aa  63.9  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000111141  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5056  bioY family protein  33.33 
 
 
197 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.745684  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  32.14 
 
 
187 aa  63.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0726  biotin synthase  35.43 
 
 
179 aa  62.8  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000014315  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21840  hypothetical protein  46.24 
 
 
212 aa  62.8  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  37.32 
 
 
178 aa  62  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4739  BioY protein  38.32 
 
 
197 aa  61.6  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000101818  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0185  bioY family protein  39.25 
 
 
197 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0995  BioY protein  38.61 
 
 
215 aa  61.6  0.000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8405  BioY family protein  35.71 
 
 
189 aa  61.2  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2875  BioY protein  33.1 
 
 
202 aa  60.8  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000912957  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  39.47 
 
 
189 aa  60.8  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0243  BioY protein  36.88 
 
 
190 aa  60.5  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00131705  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_967  biotin biosynthesis protein BioY  37.62 
 
 
215 aa  60.5  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000844147  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1788  BioY protein  40.58 
 
 
169 aa  60.5  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5061  bioY family protein  38.32 
 
 
197 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5049  bioY family protein  38.32 
 
 
197 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.925565  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1864  BioY family protein  33.1 
 
 
182 aa  60.1  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3020  BioY protein  34.23 
 
 
201 aa  58.9  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  36.99 
 
 
191 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0575  BioY protein  32.8 
 
 
185 aa  58.9  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  36.3 
 
 
191 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000070307  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  34 
 
 
191 aa  58.5  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1630  hypothetical protein  38.61 
 
 
199 aa  57.8  0.00000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0516  hypothetical protein  36.46 
 
 
180 aa  57.4  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0355774  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  39.6 
 
 
205 aa  57  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  33.52 
 
 
206 aa  56.6  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  30.46 
 
 
189 aa  56.6  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  28.3 
 
 
182 aa  55.5  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000303529  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3659  BioY protein  33.1 
 
 
179 aa  55.1  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0901  BioY protein  32.03 
 
 
208 aa  55.1  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0169  BioY protein  29.65 
 
 
187 aa  55.1  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000989963  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0693  BioY protein  28.34 
 
 
199 aa  55.1  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2307  BioY protein  38.27 
 
 
184 aa  54.7  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.366824  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2349  BioY protein  38.27 
 
 
184 aa  54.7  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0659  BioY protein  28.14 
 
 
171 aa  54.3  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.728186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>