107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0638 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0638  BioY family protein  100 
 
 		 196 aa  376  1e-104  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.532905  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  37.97 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  38.55 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  37.04 
 
 		 197 aa  87  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  39.88 
 
 		 203 aa  87  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  43.4 
 
 		 195 aa  85.9  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3745  BioY protein  33.7 
 
 		 190 aa  85.1  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421582  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  36.94 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  33.73 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0230  BioY protein  34.76 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.949273  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2134  putative BioY protein  38.02 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  35.39 
 
 		 178 aa  74.3  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  37.42 
 
 		 169 aa  73.9  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1198  BioY protein  38.75 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1719  BioY family protein  35.62 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1662  BioY family protein  35.62 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  35.19 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3011  BioY protein  40.68 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131178  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2445  BioY protein  34.16 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000283482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  35.19 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0506  BioY family protein  34.1 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.529292  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0509  BioY family protein  34.1 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0693  BioY protein  35.54 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0357  hypothetical protein  33.71 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1206  bioY family protein  34.68 
 
 		 175 aa  66.6  0.0000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  33.54 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0575  BioY protein  34.44 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0991  BioY protein  35.03 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  29.03 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  33.74 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1647  BioY protein  35.29 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  32.53 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02210  hypothetical protein  38.04 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21370  hypothetical protein  34.08 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.283174  normal  0.337859 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  31.61 
 
 		 184 aa  62  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_967  biotin biosynthesis protein BioY  30.77 
 
 		 215 aa  62  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000844147  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0995  BioY protein  30.54 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1855  BioY protein  45.07 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  33.54 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000303529  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2330  BioY protein  33.13 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  31.54 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3005  BioY protein  30.43 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.312874  normal  0.884214 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3107  Na+/H+ antiporter  31.55 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0901  BioY protein  32.88 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1432  BioY protein  32.24 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2113  BioY protein  43.66 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0646325  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1496  hypothetical protein  34.13 
 
 		 165 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.41192 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1924  BioY family protein  32.87 
 
 		 145 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0610  BioY protein  32.52 
 
 		 174 aa  57  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775885  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3688  BioY protein  33.13 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.983357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  34.97 
 
 		 179 aa  57  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1630  hypothetical protein  43.37 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1200  BioY family protein  50 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000053254 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1068  BioY protein  33.8 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1597  hypothetical protein  30.81 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839094  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  35.44 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000111141  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0659  BioY protein  34.51 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.728186  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1184  BioY family protein  30 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000330178  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1788  BioY protein  32.92 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1704  BioY protein  40.62 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00848972  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1274  BioY protein  32.69 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4329  BioY protein  33.33 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.373185 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  32.81 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0398  BioY family protein  30.19 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000949175  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  32.65 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0516  hypothetical protein  41.56 
 
 		 180 aa  52.8  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0355774  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  28.47 
 
 		 182 aa  53.1  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  34.97 
 
 		 189 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0996  BioY protein  29.01 
 
 		 191 aa  52  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1864  BioY family protein  30.6 
 
 		 182 aa  50.8  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  28.28 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000266759  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0733  BioY protein  31.79 
 
 		 190 aa  49.7  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.307469  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1123  BioY protein  28.34 
 
 		 197 aa  48.9  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.432616  normal  0.483731 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2735  BioY protein  31.76 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  39.13 
 
 		 169 aa  48.9  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  39.13 
 
 		 169 aa  48.9  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2901  BioY protein  32.35 
 
 		 208 aa  48.5  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000326686  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  39.53 
 
 		 182 aa  48.5  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  30.41 
 
 		 182 aa  48.5  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012911  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1953  hypothetical protein  30.48 
 
 		 189 aa  48.5  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.327178  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0776  BioY protein  30.11 
 
 		 200 aa  48.1  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.656127  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  32.91 
 
 		 210 aa  48.1  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  33.33 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3444  BioY protein  32.42 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  32.21 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0498  BioY protein  37.84 
 
 		 193 aa  47.4  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.583343 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  28.97 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0144  BioY protein  35.88 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1681  BioY protein  41.1 
 
 		 225 aa  45.8  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4638  BioY protein  26.52 
 
 		 203 aa  45.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0539  BioY protein  39.56 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.252714  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0132  hypothetical protein  31.76 
 
 		 176 aa  45.4  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0568  BioY protein  39.56 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.936427  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2889  BioY protein  26.88 
 
 		 197 aa  45.1  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0726  biotin synthase  31.16 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000014315  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0571  BioY protein  39.56 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4207  BioY protein  32.46 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  33.33 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1529  BioY protein  34.41 
 
 		 188 aa  43.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1491  BioY protein  37.66 
 
 		 220 aa  43.1  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.865608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>