169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0018 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  100 
 
 		 205 aa  391  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  82.59 
 
 		 206 aa  300  8.000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  51.83 
 
 		 192 aa  176  3e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  51.3 
 
 		 203 aa  166  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2445  BioY protein  52.04 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000283482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  51.15 
 
 		 199 aa  156  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  47.87 
 
 		 197 aa  149  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1123  BioY protein  43.37 
 
 		 197 aa  145  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.432616  normal  0.483731 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  46.7 
 
 		 207 aa  144  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  45.08 
 
 		 195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0230  BioY protein  46.93 
 
 		 204 aa  125  5e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.949273  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0996  BioY protein  42.77 
 
 		 191 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  42.78 
 
 		 197 aa  123  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3005  BioY protein  43.68 
 
 		 200 aa  121  6e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.312874  normal  0.884214 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  43.88 
 
 		 205 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3745  BioY protein  36.78 
 
 		 190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421582  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  38.41 
 
 		 184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8405  BioY family protein  43.01 
 
 		 189 aa  112  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1719  BioY family protein  39.78 
 
 		 191 aa  112  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1662  BioY family protein  39.78 
 
 		 191 aa  112  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2330  BioY protein  44.63 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  42.44 
 
 		 179 aa  109  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1198  BioY protein  40.11 
 
 		 191 aa  108  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3011  BioY protein  47.22 
 
 		 187 aa  108  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131178  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  44.44 
 
 		 189 aa  107  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4638  BioY protein  46.59 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21370  hypothetical protein  45.09 
 
 		 205 aa  106  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.283174  normal  0.337859 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0991  BioY protein  45.09 
 
 		 199 aa  105  6e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2134  putative BioY protein  36.82 
 
 		 197 aa  98.6  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  41.38 
 
 		 182 aa  97.8  9e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012911  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4329  BioY protein  41.57 
 
 		 212 aa  95.1  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.373185 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0693  BioY protein  36.36 
 
 		 199 aa  94  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  39.31 
 
 		 182 aa  94.4  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  40.26 
 
 		 178 aa  93.6  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0776  BioY protein  39.13 
 
 		 200 aa  92.8  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.656127  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  36 
 
 		 187 aa  92  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0506  BioY family protein  37.02 
 
 		 199 aa  90.9  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.529292  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  32.2 
 
 		 184 aa  90.9  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000266759  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0509  BioY family protein  37.02 
 
 		 199 aa  90.9  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  37.97 
 
 		 184 aa  89.7  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  39.68 
 
 		 231 aa  89.4  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2735  BioY protein  41.22 
 
 		 195 aa  89.4  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  34.12 
 
 		 182 aa  89  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000303529  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3688  BioY protein  40.24 
 
 		 190 aa  88.6  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.983357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0144  BioY protein  35.57 
 
 		 200 aa  87  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  35.42 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0575  BioY protein  40.76 
 
 		 185 aa  87  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0901  BioY protein  38.61 
 
 		 208 aa  85.9  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2086  BioY protein  45 
 
 		 197 aa  85.5  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00325943  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0638  BioY family protein  36.53 
 
 		 196 aa  85.1  6e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.532905  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  36.05 
 
 		 167 aa  84.7  7e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000111141  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  39.71 
 
 		 169 aa  84  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1704  BioY protein  35.18 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00848972  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1068  BioY protein  41.36 
 
 		 192 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3107  Na+/H+ antiporter  38.32 
 
 		 192 aa  84.3  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1206  bioY family protein  38.06 
 
 		 175 aa  82.8  0.000000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  36.88 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1597  hypothetical protein  34.64 
 
 		 177 aa  80.9  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839094  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  43.26 
 
 		 189 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0659  BioY protein  36.05 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.728186  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  42 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  39.44 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  40 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0463  BioY family protein  37.06 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1432  BioY protein  43.67 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0357  hypothetical protein  33.54 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  34.48 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3659  BioY protein  40.85 
 
 		 179 aa  77.8  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  36.54 
 
 		 191 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0886  BioY protein  36.3 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.452064  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2113  BioY protein  40.88 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0646325  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  37.65 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1647  BioY protein  36.6 
 
 		 169 aa  77  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  38.24 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4207  BioY protein  40.32 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  36.88 
 
 		 169 aa  77  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  36.88 
 
 		 169 aa  77  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1924  BioY family protein  39.6 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1496  hypothetical protein  34.03 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.41192 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1788  BioY protein  42.34 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4131  BioY protein  41.48 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  36.07 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1855  BioY protein  39.13 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2356  BioY protein  41.4 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  33.91 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000070307  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3444  BioY protein  36.59 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_967  biotin biosynthesis protein BioY  32.26 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000844147  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2320  BioY protein  36.77 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1004  biotin synthesis BioY protein  35.58 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0995  BioY protein  30.86 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2901  BioY protein  51.28 
 
 		 208 aa  72  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000326686  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1529  BioY protein  39.1 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0516  hypothetical protein  32.19 
 
 		 180 aa  70.9  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0355774  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1864  BioY family protein  31.29 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0498  BioY protein  38.31 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.583343 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0610  BioY protein  35.52 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775885  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3659  bioY family protein  34.48 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00282906  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3737  bioY family protein  37.18 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.776545  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2911  BioY protein  44.19 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1274  BioY protein  43.38 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>