177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2911 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2911  BioY protein  100 
 
 		 202 aa  367  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2113  BioY protein  50.25 
 
 		 224 aa  159  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0646325  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  53.11 
 
 		 210 aa  141  6e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1855  BioY protein  42.86 
 
 		 216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21840  hypothetical protein  45.27 
 
 		 212 aa  124  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3349  BioY protein  44.62 
 
 		 207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3464  BioY protein  42.79 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  40.19 
 
 		 231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3228  BioY protein  43.89 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4131  BioY protein  45 
 
 		 189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  41.21 
 
 		 187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2320  BioY protein  45 
 
 		 180 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1529  BioY protein  45.86 
 
 		 188 aa  112  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  35.39 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000070307  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  35.96 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  36.67 
 
 		 191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  39.67 
 
 		 187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5281  BioY protein  43.72 
 
 		 202 aa  108  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.170405  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5370  BioY protein  43.72 
 
 		 202 aa  108  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1193  biotin transport protein BioY  40.68 
 
 		 184 aa  108  5e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5660  BioY protein  43.72 
 
 		 202 aa  108  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  45.86 
 
 		 192 aa  108  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5454  BioY protein  45.54 
 
 		 215 aa  106  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0263826  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4601  BioY protein  41.48 
 
 		 197 aa  106  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440698  normal  0.800249 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1004  biotin synthesis BioY protein  40.66 
 
 		 187 aa  105  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  37.02 
 
 		 189 aa  102  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1732  BioY protein  42.57 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1681  BioY protein  49.18 
 
 		 225 aa  99.8  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0501  BioY protein  40 
 
 		 187 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0382459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3737  bioY family protein  36.52 
 
 		 191 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.776545  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  44.58 
 
 		 199 aa  97.8  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1864  BioY family protein  32.4 
 
 		 182 aa  97.1  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3659  bioY family protein  35.39 
 
 		 191 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00282906  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2314  hypothetical protein  48.39 
 
 		 222 aa  96.3  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.462217  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3659  BioY protein  42.38 
 
 		 179 aa  95.5  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3331  bioY family protein  36.67 
 
 		 191 aa  95.5  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000423922  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3640  bioY family protein  36.67 
 
 		 191 aa  95.5  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3420  bioY family protein  35.39 
 
 		 191 aa  94.4  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000218504  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3381  bioY family protein  35.39 
 
 		 191 aa  94.4  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.96357e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3689  bioY family protein  35.39 
 
 		 191 aa  94.4  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000593466  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20560  hypothetical protein  39.11 
 
 		 221 aa  94  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1068  BioY protein  42.86 
 
 		 192 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  37.5 
 
 		 184 aa  93.6  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  38.89 
 
 		 179 aa  92.4  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  45.23 
 
 		 192 aa  91.7  7e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3386  BioY protein  41.67 
 
 		 182 aa  91.3  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.812512  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2307  BioY protein  33.52 
 
 		 184 aa  90.9  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.366824  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2349  BioY protein  33.52 
 
 		 184 aa  90.9  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  41.34 
 
 		 189 aa  89.7  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  33.71 
 
 		 182 aa  88.6  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0463  BioY family protein  33.51 
 
 		 179 aa  87  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3071  BioY protein  44.74 
 
 		 204 aa  86.3  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1953  hypothetical protein  29.55 
 
 		 189 aa  84.3  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.327178  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0516  hypothetical protein  31.49 
 
 		 180 aa  84  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0355774  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  38.29 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  32.57 
 
 		 182 aa  83.2  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000303529  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  41.07 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  35.43 
 
 		 167 aa  84  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000111141  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0233  BioY protein  39.44 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0398  BioY family protein  29.94 
 
 		 179 aa  80.5  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000949175  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2875  BioY protein  37.16 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000912957  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2319  BioY protein  40.56 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1540  BioY protein  40.56 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3688  BioY protein  40.33 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.983357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  29.28 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012911  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0726  biotin synthase  40.4 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000014315  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  31.4 
 
 		 184 aa  78.2  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000266759  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  32.6 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2735  BioY protein  41.94 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0845  BioY protein  43.65 
 
 		 181 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  38.22 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  34.25 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  31.79 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  38.12 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2173  hypothetical protein  43.09 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  41.86 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  42.29 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  38.51 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0498  BioY protein  43.17 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.583343 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0610  BioY protein  32.96 
 
 		 174 aa  73.2  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775885  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8405  BioY family protein  43.38 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01740  hypothetical protein  46.62 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.770223 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3005  BioY protein  37.72 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.312874  normal  0.884214 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1651  BioY family protein  33.16 
 
 		 203 aa  72  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000463296  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  37.85 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1200  BioY family protein  33.33 
 
 		 216 aa  71.2  0.000000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000053254 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  31.9 
 
 		 187 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21370  hypothetical protein  40.1 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.283174  normal  0.337859 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5033  BioY protein  42.78 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  40.29 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4787  bioY family protein  28.73 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000360294  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5150  bioY family protein  28.73 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85197  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0357  hypothetical protein  34.3 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4739  BioY protein  29.28 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000101818  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  38.36 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5061  bioY family protein  28.73 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3020  BioY protein  33.33 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2901  BioY protein  43.22 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000326686  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2330  BioY protein  41.27 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5056  bioY family protein  28.73 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.745684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>