165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2319 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2319  BioY protein  100 
 
 
194 aa  367  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1540  BioY protein  99.48 
 
 
194 aa  365  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4601  BioY protein  71.35 
 
 
197 aa  252  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440698  normal  0.800249 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  48.02 
 
 
189 aa  141  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  44.81 
 
 
187 aa  134  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  45.41 
 
 
187 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  41.48 
 
 
191 aa  123  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000070307  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  42.13 
 
 
191 aa  122  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  41.48 
 
 
191 aa  122  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2320  BioY protein  46.59 
 
 
180 aa  121  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0501  BioY protein  45.05 
 
 
187 aa  119  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0382459  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2113  BioY protein  41.3 
 
 
224 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0646325  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1193  biotin transport protein BioY  40.22 
 
 
184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1004  biotin synthesis BioY protein  42.42 
 
 
187 aa  115  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  42.47 
 
 
192 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1529  BioY protein  48.1 
 
 
188 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  39.9 
 
 
231 aa  112  5e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1855  BioY protein  38.67 
 
 
216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0463  BioY family protein  38.76 
 
 
179 aa  107  9.000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3464  BioY protein  39.34 
 
 
205 aa  107  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1864  BioY family protein  35.5 
 
 
182 aa  106  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1068  BioY protein  44.64 
 
 
192 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0516  hypothetical protein  39.41 
 
 
180 aa  105  4e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0355774  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3659  BioY protein  43.37 
 
 
179 aa  105  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3737  bioY family protein  43.75 
 
 
191 aa  105  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.776545  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2307  BioY protein  36.09 
 
 
184 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.366824  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2349  BioY protein  36.09 
 
 
184 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3331  bioY family protein  42.7 
 
 
191 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000423922  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3386  BioY protein  45.45 
 
 
182 aa  103  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.812512  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3659  bioY family protein  42.61 
 
 
191 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00282906  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4131  BioY protein  38.54 
 
 
189 aa  103  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3640  bioY family protein  42.7 
 
 
191 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3228  BioY protein  39.89 
 
 
201 aa  102  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3420  bioY family protein  42.13 
 
 
191 aa  101  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000218504  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3381  bioY family protein  42.13 
 
 
191 aa  101  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.96357e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3689  bioY family protein  42.13 
 
 
191 aa  101  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000593466  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1681  BioY protein  41.94 
 
 
225 aa  99.8  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  38.25 
 
 
210 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21840  hypothetical protein  39.18 
 
 
212 aa  97.4  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0398  BioY family protein  36.47 
 
 
179 aa  95.5  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000949175  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  34.52 
 
 
184 aa  95.5  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3349  BioY protein  41.67 
 
 
207 aa  95.5  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1953  hypothetical protein  32.22 
 
 
189 aa  94  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.327178  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5281  BioY protein  41.29 
 
 
202 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.170405  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5370  BioY protein  41.29 
 
 
202 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5660  BioY protein  41.29 
 
 
202 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2173  hypothetical protein  46.02 
 
 
181 aa  92.8  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0845  BioY protein  45.45 
 
 
181 aa  90.9  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  34.13 
 
 
182 aa  88.2  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012911  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1200  BioY family protein  36 
 
 
216 aa  87.4  1e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000053254 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20560  hypothetical protein  42.93 
 
 
221 aa  87  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  33.33 
 
 
179 aa  85.1  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5033  BioY protein  47.19 
 
 
191 aa  83.6  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301047  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2911  BioY protein  40.56 
 
 
202 aa  83.2  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  38.73 
 
 
187 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1732  BioY protein  33.13 
 
 
208 aa  82.4  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3071  BioY protein  44.51 
 
 
204 aa  82.4  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0733  BioY protein  35.48 
 
 
190 aa  81.3  0.000000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.307469  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5454  BioY protein  41.44 
 
 
215 aa  80.5  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0263826  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  42.06 
 
 
182 aa  80.9  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  31.87 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2735  BioY protein  39.04 
 
 
195 aa  76.3  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  34.81 
 
 
182 aa  76.3  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000303529  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  34.3 
 
 
187 aa  75.9  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  38.42 
 
 
189 aa  75.1  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  36.42 
 
 
197 aa  74.7  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2947  BioY protein  34.97 
 
 
187 aa  75.1  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000305792  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  34.44 
 
 
187 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  36.02 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0243  BioY protein  36.36 
 
 
190 aa  72.8  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00131705  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1651  BioY family protein  35.56 
 
 
203 aa  72.4  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000463296  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01740  hypothetical protein  46.67 
 
 
204 aa  72.4  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.770223 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2005  BioY protein  46.47 
 
 
183 aa  71.6  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.319092  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1198  BioY protein  36.31 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1719  BioY family protein  35.52 
 
 
191 aa  70.1  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1662  BioY family protein  35.52 
 
 
191 aa  70.1  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  37.33 
 
 
205 aa  69.7  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  28.02 
 
 
182 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  34.48 
 
 
192 aa  69.3  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269732  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  40.26 
 
 
195 aa  69.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1333  BioY protein  46.48 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.692637  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  36.67 
 
 
207 aa  68.2  0.00000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  37.27 
 
 
189 aa  67.8  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  46.24 
 
 
182 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  32.46 
 
 
199 aa  66.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0575  BioY protein  41.14 
 
 
185 aa  66.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0726  biotin synthase  39.07 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000014315  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2901  BioY protein  45.83 
 
 
208 aa  64.7  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000326686  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2314  hypothetical protein  40.37 
 
 
222 aa  63.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.462217  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  33.97 
 
 
178 aa  63.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0996  BioY protein  38.04 
 
 
191 aa  63.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  34.67 
 
 
206 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0991  BioY protein  35.23 
 
 
199 aa  63.5  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0539  BioY protein  46.23 
 
 
193 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.252714  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0498  BioY protein  35.76 
 
 
193 aa  63.2  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.583343 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0568  BioY protein  46.23 
 
 
193 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.936427  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4638  BioY protein  37.69 
 
 
203 aa  62.4  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0571  BioY protein  46.15 
 
 
193 aa  62.4  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4649  biotin synthesis BioY protein  26.47 
 
 
197 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000112597  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  36.47 
 
 
197 aa  62  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.380414 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>