153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3228 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3228  BioY protein  100 
 
 
201 aa  385  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3464  BioY protein  86.76 
 
 
205 aa  335  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5281  BioY protein  81.62 
 
 
202 aa  280  8.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.170405  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5370  BioY protein  81.62 
 
 
202 aa  280  8.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5660  BioY protein  81.62 
 
 
202 aa  280  8.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1732  BioY protein  67.4 
 
 
208 aa  219  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  47.28 
 
 
210 aa  131  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  35.91 
 
 
191 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  35.36 
 
 
191 aa  115  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000070307  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  35.36 
 
 
191 aa  112  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2113  BioY protein  40.44 
 
 
224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0646325  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  40.88 
 
 
187 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5454  BioY protein  44.62 
 
 
215 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0263826  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4601  BioY protein  38.33 
 
 
197 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440698  normal  0.800249 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3420  bioY family protein  34.81 
 
 
191 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000218504  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3381  bioY family protein  34.81 
 
 
191 aa  105  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.96357e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2314  hypothetical protein  50.34 
 
 
222 aa  105  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.462217  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3689  bioY family protein  34.81 
 
 
191 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000593466  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3737  bioY family protein  35.91 
 
 
191 aa  105  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.776545  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  40.22 
 
 
187 aa  104  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3659  bioY family protein  34.25 
 
 
191 aa  104  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00282906  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3331  bioY family protein  34.81 
 
 
191 aa  104  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000423922  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3640  bioY family protein  34.81 
 
 
191 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  33.87 
 
 
189 aa  102  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1193  biotin transport protein BioY  39.01 
 
 
184 aa  102  4e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  38.1 
 
 
192 aa  99.4  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1855  BioY protein  35.42 
 
 
216 aa  98.2  8e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3349  BioY protein  37.5 
 
 
207 aa  95.9  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0463  BioY family protein  39.05 
 
 
179 aa  95.9  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2320  BioY protein  42.7 
 
 
180 aa  95.5  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1068  BioY protein  38.27 
 
 
192 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4131  BioY protein  39.44 
 
 
189 aa  93.6  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2911  BioY protein  43.89 
 
 
202 aa  93.2  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  32.64 
 
 
231 aa  89  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21840  hypothetical protein  36.27 
 
 
212 aa  88.6  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1529  BioY protein  38.85 
 
 
188 aa  88.2  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  35.08 
 
 
184 aa  87.4  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1004  biotin synthesis BioY protein  35.96 
 
 
187 aa  84.3  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  36 
 
 
182 aa  83.2  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000303529  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0516  hypothetical protein  34.83 
 
 
180 aa  82  0.000000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0355774  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  31.06 
 
 
187 aa  80.9  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1681  BioY protein  39.47 
 
 
225 aa  80.5  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1540  BioY protein  38.33 
 
 
194 aa  80.5  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0398  BioY family protein  31.46 
 
 
179 aa  80.5  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000949175  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3386  BioY protein  42.13 
 
 
182 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.812512  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2319  BioY protein  39.89 
 
 
194 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  33.7 
 
 
187 aa  78.6  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2307  BioY protein  31.55 
 
 
184 aa  79  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.366824  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2349  BioY protein  31.55 
 
 
184 aa  79  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0733  BioY protein  33.89 
 
 
190 aa  76.6  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.307469  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0501  BioY protein  35.91 
 
 
187 aa  76.6  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0382459  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  31.25 
 
 
184 aa  75.5  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000266759  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  36.21 
 
 
199 aa  75.5  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1953  hypothetical protein  29.71 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.327178  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20560  hypothetical protein  35.56 
 
 
221 aa  73.6  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3659  BioY protein  38.51 
 
 
179 aa  72.8  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1651  BioY family protein  35.11 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000463296  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1864  BioY family protein  29.38 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  34.81 
 
 
178 aa  68.2  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3071  BioY protein  41.9 
 
 
204 aa  67.4  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2173  hypothetical protein  42.46 
 
 
181 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  41.18 
 
 
189 aa  67  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0233  BioY protein  36.07 
 
 
197 aa  66.6  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5033  BioY protein  41.01 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301047  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0845  BioY protein  42.08 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  29.78 
 
 
182 aa  65.9  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  35.44 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  47.62 
 
 
182 aa  65.5  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  28.9 
 
 
182 aa  64.7  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012911  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  37.68 
 
 
197 aa  63.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  38.17 
 
 
192 aa  63.5  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1206  bioY family protein  38.24 
 
 
175 aa  62.8  0.000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4652  BioY protein  49.47 
 
 
198 aa  62.8  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.113128  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5061  bioY family protein  28.65 
 
 
197 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01740  hypothetical protein  40.56 
 
 
204 aa  62.4  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.770223 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0357  hypothetical protein  32 
 
 
182 aa  62  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1647  BioY protein  40.54 
 
 
169 aa  62  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  31.77 
 
 
187 aa  61.6  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1200  BioY family protein  28.64 
 
 
216 aa  61.6  0.000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000053254 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  31.4 
 
 
179 aa  61.2  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  34.88 
 
 
169 aa  60.8  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  34.88 
 
 
169 aa  60.8  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5056  bioY family protein  28.65 
 
 
197 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.745684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4787  bioY family protein  28.11 
 
 
197 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000360294  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5150  bioY family protein  28.11 
 
 
197 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85197  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1630  hypothetical protein  50 
 
 
199 aa  60.5  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2954  BioY family protein  46.75 
 
 
180 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.716157  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0185  bioY family protein  27.87 
 
 
197 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4627  biotin synthesis BioY protein  28.11 
 
 
197 aa  59.3  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.33055e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4649  biotin synthesis BioY protein  28.11 
 
 
197 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000112597  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5028  bioY family protein  28.11 
 
 
197 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3528  BioY protein  31.76 
 
 
198 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  34.73 
 
 
169 aa  58.5  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0726  biotin synthase  30.56 
 
 
179 aa  57.4  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000014315  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4739  BioY protein  27.03 
 
 
197 aa  57.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000101818  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  35.8 
 
 
203 aa  56.6  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2005  BioY protein  45.14 
 
 
183 aa  56.6  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.319092  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  37.6 
 
 
205 aa  57.4  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  28.12 
 
 
192 aa  56.6  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269732  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5049  bioY family protein  26.23 
 
 
197 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.925565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>